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利用植物脂質(zhì)組學等技術研究水稻雄性生殖發(fā)育機制

瀏覽次數(shù):801 發(fā)布日期:2023-3-2  來源:中科新生命


花粉壁對于保護雄性配子體和受精過程起著非常重要的作用。花粉壁的主要成分脂質(zhì)一般由孢子體絨氈層合成和轉運。盡管目前已有不少研究對與脂質(zhì)生物合成相關的幾個因素進行了表征,但水稻花粉發(fā)育過程中脂質(zhì)生物合成的分子機制仍然不清楚。

2022年6月,四川農(nóng)業(yè)大學李雙成/李平教授團隊在Plant Physiology (IF 8.005) 上發(fā)表了題為“SWOLLEN TAPETUM AND STERILITY 1 Is Required for Tapetum Degeneration and Pollen Wall Formation in Rice”的文章。研究發(fā)現(xiàn) SWOLLEN TAPETUM AND STERILITY 1 (STS1) 基因的突變會導致水稻絨氈層降解延遲和花粉壁形成中止,并結合植物脂質(zhì)組學和轉錄組學等技術證實了STS1是生殖發(fā)育中脂質(zhì)生物合成的重要因子,參與花藥脂質(zhì)穩(wěn)態(tài)。該研究為植物雄性生殖發(fā)育及花藥脂質(zhì)代謝的調(diào)控機制提供了新的見解,并為雜交水稻育種中雄性育性的人工控制提供了新的靶點。中科新生命參與了該研究中植物脂質(zhì)組學的相關工作。


 

 研究材料

水稻花藥

 

 技術路線

步驟1:表型研究,sts1突變體為雄性不育;

步驟2:細胞學分析,sts1突變體水稻絨氈層降解延遲和花粉壁形成中止;

步驟3:脂質(zhì)組學分析,sts1突變體中與花粉育性相關的脂質(zhì)組分明顯下調(diào);

步驟4:轉錄組學分析,與花藥脂質(zhì)生物合成和絨氈層發(fā)育相關的部分基因的表達在sts1-1中受到干擾;

步驟5:STS1與OsPKS2和OsACOS12相互作用,調(diào)節(jié)花藥脂質(zhì)生物合成。

 

 研究結果

1. 表型研究

作者從秈稻品種9311的突變體庫中分離出兩個具有等位基因突變的雄性不育突變體(sts1-1sts1-2)。與野生型(WT)相比,這些突變體顯示正常營養(yǎng)生長,但沒有產(chǎn)生可利用的種子。突變體的花藥呈黃白色且比較小,其在抽穗期沒有產(chǎn)生花粉粒,然而突變體中的胚囊發(fā)育與WT相似。這些結果表明sts1突變體為雄性不育,且通過回交實驗證實不育表型是由單個隱性突變引起的(圖1)。
 


圖1 WT和突變體的表型比較

 

2. 細胞學分析

通過STS1的克隆和功能驗證實驗證實了STS1在維持雄性育性中的關鍵作用。為了進一步了解STS1在雄性生殖中的作用,作者分析比較了WT和sts1-1之間花藥發(fā)育的細胞學差異。光學顯微鏡研究發(fā)現(xiàn)在階段8a之前,WT和sts1-1之間未發(fā)現(xiàn)明顯的差異。WT在第8b階段時絨氈層開始凝結,隨后進一步降解,并最終在第12階段消失。而突變體則開始表現(xiàn)出輕微腫脹,并隨著時間的延長而持續(xù)腫脹。在第12階段時,不完全降解的絨氈層則保留在突變體花藥壁中。盡管突變體的減數(shù)分裂正常,但小孢子在后期逐漸破碎。在第12階段時,WT小孢子最終發(fā)育成充滿內(nèi)含物的成熟花粉粒。相反,突變體小孢子開始塌陷和退化,最終留下空花藥室。作者后續(xù)使用透射電子顯微鏡(TEM)和掃描電子顯微鏡(SEM)觀察了絨氈層和小孢子的超微結構和發(fā)育情況,與光學顯微鏡的結果類似,結果表明STS1對于絨氈層發(fā)育和花粉壁的形成是必不可少的(圖2)。
 


圖2 細胞學分析

 

3.  脂質(zhì)組學分析

研究發(fā)現(xiàn)STS1編碼一個含有DUF726結構域的未知蛋白,其定位于內(nèi)質(zhì)網(wǎng),并證實了STS1具有脂肪酶活性,參與水稻花藥中的脂質(zhì)生物合成。為了進一步了解STS1對脂質(zhì)生物合成的影響,作者采用脂質(zhì)組學方法分析了WT和突變體花藥中的脂質(zhì)成分。OPLS-DA分析表明, WT和突變體花藥在脂質(zhì)組成上存在顯著差異。接著定量分析了與雄性生殖發(fā)育相關的不同脂質(zhì)分子,發(fā)現(xiàn)野生型和突變體中鞘磷脂的豐度相當,但突變體中脂肪酰、甘油脂、糖脂和甘油磷脂的幾個脂質(zhì)類別的總含量顯著低于WT。如鑒定到的六種蠟酯種類,其中四種在突變體中下調(diào)。此外,單酰甘油酯(MG)、三酰甘油酯(TG)、磷脂酰膽堿(PC)和磷脂酰乙醇胺(PE)等類別豐度在突變體中也顯著下調(diào),這些結果表明STS1參與了花藥中脂質(zhì)生物合成的調(diào)節(jié)(圖3)。



圖3 STS1具有脂肪酶活性,并參與水稻花藥中的脂質(zhì)生物合成

 

4. 轉錄組學分析

作者使用轉錄組學技術進一步了解STS1在花粉發(fā)育中的作用。在突變體花藥中篩選出210個差異表達的基因(DEGs)。其中,60個基因上調(diào),150個基因下調(diào)。GO分析發(fā)現(xiàn)DEGs顯著富集在孢粉素生物合成、花粉外壁形成、花粉壁組裝等過程。RT-qPCR分析進一步證實了一些基因參與這些途徑,如在sts1-1花藥7到10的大多數(shù)階段中,CYP703A3、CYP704B2、OsACO12、OsPKS1、OsPKS2等顯著下調(diào)。此外,與絨氈層發(fā)育相關的基因及花藥特異性基因如EAT1、OsAP37、OsSub42等在sts1-1花藥中均下調(diào)。這些結果表明,與花藥脂質(zhì)生物合成和絨氈層發(fā)育相關的許多基因的表達在sts1-1花藥中受到干擾,證實了正;ㄋ幇l(fā)育需要STS1的假設(圖4)。

 


圖4與花藥脂質(zhì)生物合成和絨氈層發(fā)育相關的部分基因的表達在sts1-1中受到干擾 

 

5. STS1與OsPKS2和OsACOS12相互作用

作者使用酵母雙雜交和雙分子熒光互補等技術研究了與STS1相互作用以介導脂質(zhì)生物合成的可能成分。結果發(fā)現(xiàn)STS1可與其自身相互作用,此外,通過體內(nèi)和體外實驗證實了STS1與介導水稻花藥中脂質(zhì)的生物合成參與花粉發(fā)育的兩種蛋白OsACOS12和OsPKS2有直接相互作用,且OsACOS12和OsPKS2可能不影響STS1的酶活性(圖5)。

 


圖5 
STS1與OsPKS2和OsACOS12相互作用

 

 小編小結

總之,細胞學、遺傳學和生物化學數(shù)據(jù)共同表明,STS1編碼一種含有DUF726的蛋白質(zhì),具有脂肪酶活性,并且可能通過與OsACOS12和OsPKS2相互作用,調(diào)節(jié)花藥脂質(zhì)生物合成,對絨氈層發(fā)育和花粉壁形成至關重要。

 

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標簽: 植物代謝組
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