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AI育種,從這里起步

瀏覽次數:1658 發(fā)布日期:2022-5-7  來源:慧諾瑞德

人工智能(Artificial Intelligence, AI)是21世紀最火熱的技術之一,其重要分枝計算機視覺技術更是在各行各業(yè)得到了廣泛的應用。在農業(yè)領域,基于計算機視覺的植物表型技術,正逐步嵌入農業(yè)產業(yè)鏈各個環(huán)節(jié)中。

 

得益于基因組學、表型組學和人工智能的蓬勃發(fā)展,以及國家對“種源”的核心戰(zhàn)略訴求,AI育種成為近年來的一個熱詞。

 

育種,是在給定的環(huán)境條件下,選擇各種表型指標(產量、品質、抗性)最優(yōu)的基因型材料的過程。AI育種,就是利用人工智能技術幫助育種家加速育種材料篩選的進程,這里面既包括了基因型大數據的分析、預測,也包括表型大數據的分析、預測,實質上是希望借助人工智能的各種神經網絡,加速“萬一挑一”、“大海里撈針”的過程。

 

自從2014年開始有人將深度學習和植物表型工作結合以來,AI以快速嵌入了植物表型的各個領域。而植物表型又被認為是制約現代農業(yè)發(fā)展的最大瓶頸之一。

 

在育種工作中,仍有大量表型工作在采用傳統(tǒng)的“用牙咬、用眼瞪、用手摸”的方式進行。隨著生物育種技術在我國的逐步放開,各種分子生物學、基因組技術的介入,育種將正式進入新紀元。分子手段輔助產生的海量育種材料,也都需要進行從室內到田間、從單株到群體的表型測量。我們有這么多人手進行表型測量嗎?傳統(tǒng)表型測量方式能跟上生物育種的步伐嗎?答案肯定是否定的。這就需要高通量表型技術的介入。

 

育種的核心是產量、品質、抗性,這三者都屬于植物表型指標。利用AI輔助的植物表型測量,加速育種篩選過程,是AI育種能起作用的理想路徑。試舉兩例如下。

 

案例1  AI賦能玉米考種

對于全球第一大糧食作物、同時也是商業(yè)化程度最高的育種作物——玉米——而言,收獲后的果穗和籽?挤N,是玉米育種中最枯燥乏味、最耗費時間的步驟之一,但又絕對不可或缺!

 

傳統(tǒng)的人工考種存在用工多、效率低、誤差大、測量指標少等缺點。利用AI技術為考種賦能,可以大大提高效率和準確度,降低人為干擾,大大加速育種篩選的效率。

 

多光能數字化玉米考種機iMaize®是基于AI技術對玉米的整穗、截面籽粒進行考種的系統(tǒng),能夠自動測量穗數、穗長穗寬、穗周長、穗投影面積禿尖長、禿尖比例、行數、行粒數穗粒數、粒寬粒厚、粒長籽粒面積、籽粒數等指標。


該系統(tǒng)功能強大、性價比高,是大規(guī)模玉米考種的不二選擇,已經在數十家育種單位得到成功應用,大大提高了考種效率。
 
 

案例2  AI賦能田間表型測量

所有的育種,最終都要落實到田間群體測試。實驗室是完成不了整個育種流程的。田間測試過程,也就是植物表型測量的過程

 

田間植物表型測量可以分為便攜式、定點式、固定范圍移動式(軌道式)、大范圍移動式(步行車)和無人機測量等多種方式。綜合自動化程度、測量精度、商業(yè)化程度和可靠性而言,軌道式高通量表型平臺是目前最適合普及的田間表型平臺之一,很重要的一個特性就是育種家可用。

 

要保障育種家可用,就是說不要讓育種家去操心自動化的問題,不要讓育種家去操心海量表型視覺數據分析的問題,而是讓育種家聚焦于分析后的表型性狀數據的深入挖掘,聚焦于育種問題本身。
 

軌道式高通量田間表型平臺

 

從海量表型視覺數據(可見光、熱成像等的二維成像,三維點云,高光譜數據cube等)到形成表格化的性狀數據,不嵌入AI技術幾乎是不可能的。在這方面,慧諾瑞德公司的TraitDiscover平臺已經做的不錯,實現了數據可為育種家、農學家、生物學家所用。

 

如果沒有AI,而是讓育種家將精力耗費到這些海量多源、多維視覺數據的分析上,哪里還有足夠的精力解決育種本身的問題呢?

 

AI已來,我們應該張開懷抱擁抱AI,讓這項酷炫的技術嵌入各行各業(yè)為我們服務。

 

植物表型本身就是一個跨學科領域,自帶AI基因。而植物表型服務的對象就是育種和種植。AI通過植物表型賦能育種,是AI育種的重要發(fā)展方向之一。讓我們用表型之“瞳”,賦農業(yè)之“慧”。

來源:慧諾瑞德(北京)科技有限公司
聯系電話:010-62925490
E-mail:info@phenotrait.com

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