凝膠膜過濾器在采集空氣中病毒中的應(yīng)用
瀏覽次數(shù):1583 發(fā)布日期:2021-6-3
來源:賽多利斯
COVID-19的大流行讓病毒的氣溶膠傳播愈加引人關(guān)注。據(jù)報(bào)道,致病病毒能夠以氣溶膠的形式持續(xù)數(shù)小時(shí),長(zhǎng)期存在于環(huán)境中。持續(xù)存在的病毒基因組甚至可以在釋放后24小時(shí)以上被檢測(cè)到。致病病毒也可通過空氣遠(yuǎn)距離傳播。因此,開發(fā)和改進(jìn)空氣樣品中病毒定量檢測(cè)的方法具有重要意義。
使用凝膠膜過濾器采集空氣中病毒
凝膠過濾法是監(jiān)測(cè)空氣中病原微生物和病毒的一種簡(jiǎn)便、高效、靈敏的方法,其中水溶性凝膠過濾器對(duì)于冠狀病毒采樣的適用性已經(jīng)得到了測(cè)試和證明。
凝膠過濾器的空氣采樣程序可將檢測(cè)下限擴(kuò)展至102個(gè)粒子/米,并能延長(zhǎng)采樣周期(高風(fēng)量采樣,如2000 l)
凝膠過濾器的過濾面積高達(dá)50cm²(Ø 80mm),流速高達(dá)50 l/min
溶劑體積最小可減少到80–100μl/cm²過濾面積,同時(shí)也支持較小的過濾器尺寸,如Ø47 mm(過濾面積17 cm²),因此溶劑體積可進(jìn)一步減少至1.5–2.0 ml)
這種高效率的病毒氣溶膠采樣是不需要進(jìn)行任何額外的準(zhǔn)備或后處理步驟的
凝膠過濾可以與輕便的便攜式AirPort® MD8采樣器配合使用,是一種特別適用于移動(dòng)應(yīng)用的方法。此外,采樣持續(xù)時(shí)間和30℃下80%–85%的相對(duì)濕度也不會(huì)對(duì)病毒的保留產(chǎn)生負(fù)面影響,平均保留率為99.76%。
值得一提的是,使用凝膠過濾器對(duì)人類致病病毒進(jìn)行采樣時(shí),無需使用液體,因此大幅降低了分析檢測(cè)人員的感染風(fēng)險(xiǎn)。經(jīng)過凝膠過濾器采樣后的病毒傳染性有所降低,樣品可被認(rèn)為是非傳染性物質(zhì)。
使用凝膠膜過濾器進(jìn)行病毒PCR檢測(cè)
一旦將凝膠過濾器溶解于去離子水或任何其他適當(dāng)?shù)木彌_液或介質(zhì)中,所有保留在過濾器上的病毒顆?墒褂肞CR進(jìn)行進(jìn)一步處理和檢測(cè)。
凝膠過濾與實(shí)時(shí)定量PCR(qPCR)相結(jié)合,甚至可以檢測(cè)到敏感的RNA物質(zhì)。
多項(xiàng)研究表明,使用凝膠過濾器進(jìn)行空氣采樣后再進(jìn)行PCR分析,可提供優(yōu)于其他檢測(cè)方法的回收結(jié)果。因此,可以認(rèn)為這是檢測(cè)空氣傳播病毒的一種精確可行的方法。
使用凝膠膜過濾器的典型空氣采樣程序以及PCR樣品制備
1. 打開Ø80 mm一次性凝膠過濾器的包裝(貨號(hào)17528--80----ACD)
2. 將一次性凝膠過濾器安裝在賽多利斯MD8空氣取樣器(AirPort MD8(貨號(hào)16757)或MD8 Airscan(貨號(hào)16748))的過濾器支架上
3. 應(yīng)避免觸摸過濾器而造成污染
4. 以50 l/min的速度開始空氣采樣,持續(xù)20分鐘(1000 l是典型的空氣采樣體積)
5. 取樣后,逆時(shí)針轉(zhuǎn)動(dòng)過濾器支架,將其與一次性凝膠過濾器一起從MD8上拆下
6. 逆時(shí)針轉(zhuǎn)動(dòng)過濾器支架,使其頂部與底座分離
7. 將Ø80 mm過濾膜插入15 ml的Falcon管中,需注意過濾膜很容易破損(也可選擇使用Ø47 mm的過濾膜)
8. 可選擇儲(chǔ)存和|或運(yùn)送至分析實(shí)驗(yàn)室
9. 分別加入4–5 ml或1.5–2 ml(對(duì)于Ø47 mm過濾器)溶劑(例如無菌去離子水或適當(dāng)?shù)木彌_介質(zhì))
10. 在離心機(jī)中以3000×g離心
11. 37℃下,在加熱搖床(120 rpm)或加熱塊中孵育10分鐘,使凝膠溶解
12. 選擇性病毒滅活
13. 按照生產(chǎn)商的說明進(jìn)行RNA提取
14. 溶解RNA
15. 選擇性添加核糖核酸酶抑制劑
16. 立即在冰上處理或在-80℃下選擇儲(chǔ)存期
17. 使用帶有引物和dT oligo引物的商用試劑盒在熱循環(huán)器中反轉(zhuǎn)錄合成cDNA
18. cDNA在-20℃下的選擇性儲(chǔ)存
19. 進(jìn)行PCR分析(如qPCR)
相關(guān)產(chǎn)品
MD8 Airscan ® 空氣采樣器
凝膠過濾膜