Octet
時光匆匆,2020年已經(jīng)過去,留下了
將近2000篇Octet相關的文獻。陳老濕在前一期已經(jīng)給大家總結了
全年的文獻之最,今天就給大家解讀一下去年12月份的文章精選。既有組蛋白突變與淋巴瘤發(fā)病機制關系,也有血清中直接檢測新冠病毒抗體方法建立,還有中和抗體關鍵表位識別對東部馬腦炎病毒抑制作用的重要性,以及破傷風疫苗誘導的中和抗體對小鼠的保護作用分析等。
Nature
組蛋白突變與淋巴瘤發(fā)病機制[1]
威爾康奈爾醫(yī)學院等機構的科學家們通過研究發(fā)現(xiàn),組蛋白H1的突變或是誘發(fā)淋巴瘤的原因。組蛋白會參與到DNA的卷繞并包裝成為一種特殊結構的過程中。淋巴瘤相關的H1蛋白的突變會干擾組蛋白結合并收緊DNA的能力,使得DNA變得更加松散,原本被抑制的基因就會活躍起來,從而促進早期發(fā)育階段的基因表達異常。淋巴瘤或許就源于此。
研究人員分析并比較了一組101個DLBCL患者機體中H1突變和其它基因突變的頻率,發(fā)現(xiàn)有5種不同形式的H1會在分裂的細胞中發(fā)揮作用,其中H1C和H1E的兩種突變是淋巴瘤的最常見驅動突變。這對如何利用H1突變來開發(fā)淋巴瘤的新型療法提供啟示。
與野生型相比,H1蛋白C端突變體S102F與單核小體的親和力顯著變?nèi),即突變會使得H1蛋白喪失正常的結合功能活性
Scientific Reports
新冠血清學快速診斷方法建立[2]
加州大學圣克魯茲分校的研究人員采用Octet高通量分子互作平臺開發(fā)了新冠病毒抗體血清學檢測方法,集高通量、快速和準確定量于一身,并將其命名為“BLI-ISA(生物層干涉免疫吸附法)”。將新冠病毒S-RBD固定在生物傳感器上,然后浸入1:8或者1:16稀釋的血清樣品中,即包含IgG,IgA等所有抗體的總的結合信號。然后再結合膠體金標記的抗人IgG或抗人IgM抗體,體現(xiàn)了IgG或IgA等抗體的特異性結合信號。
BLI-ISA檢測方法
37個血清樣品的檢測結果(含新冠病毒抗體陰性,弱陽,強陽血清)
BLI法可以準確地區(qū)分所有陰性與陽性樣品
BLI-ISA法30分鐘內(nèi)完成檢測(包括操作和運行),僅為ELISA法的十分之一
Octet一方面可以在血清等粗樣品中直接檢測,還可以通過整合自動化裝置,大幅度提高檢測通量,實現(xiàn)長時間的無人值守。
Cell
馬腦炎病毒中和抗體關鍵表位分析[3]
東部馬腦炎病毒(EEEV)是北美地區(qū)流行的毒性最強的病毒之一,目前還沒有正式的疫苗或抗病毒療法。范德堡大學等機構的研究人員從EEEV自然感染的康復者體內(nèi)分離鑒定出了部分單克隆抗體。其中EEEV-33(IgG)和EEEV-143 (IgA) 兩株抗體,表現(xiàn)出較高的EEEV抑制活性(IC50分布為3.1和2.8pM)。
10株不同的中和抗體的結合表位結構解析
通過分析不同抗體與EEEV病毒的復合物結構,表明EEEV-33結合病毒抗原的Domain A,EEEV-143則結合Domain B。這些抗體可識別不同的抗原位點,這對抑制病毒進入細胞至關重要。其中,EEEV-33和EEEV-143對高致病性EEEV感染的小鼠具有良好的保護作用。這些研究為EEEV中和抗體反應的分子機理提供了基礎,有助于疫苗和候選抗體療法的開發(fā)。
將重組EEEV E2糖蛋白固定在HIS1K生物傳感器上,結合第一抗體(50 ug/mL),再結合第二抗體(50 ug/mL) 。將沒有結合第一抗體的第二抗體的結合作為最大信號,其他結合過第一抗體的第二抗體信號降低到33%以內(nèi)的,認為是與第二抗體完全競爭關系。二抗信號降低到33 ~ 67%之間,認為是部分競爭關系。而二抗的信號在67%以上,則認為是不競爭的
Octet在早期篩選中快速準確地進行抗原表位分析,這在埃博拉病毒,寨卡病毒以及新冠病毒的中和抗體開發(fā)與設計中均發(fā)揮了重要作用,貢獻良多。
International
Immunopharmacology
破傷風疫苗的抗體保護作用分析[4]
破傷風梭菌產(chǎn)生的破傷風神經(jīng)毒素(TeNT)毒性極大,尤其是感染后潛伏期短、發(fā)病快,加劇患者的致命風險。開發(fā)和設計抗TeNT的中和抗體即是預防和治療的有效手段之一。
北京生物工程研究所的陳薇院士組從一名免疫了TeNT的C端結構域(TeNT- hc)的健康成人體內(nèi),分離了記憶B細胞,并鑒定了一系列單克隆抗體。其中13株抗體可與破傷風類毒素(TT)和TeNT-Hc結合,另兩株抗體則只識別TT。T3、T7和T9-6這三株抗體可以完全保護小鼠免受TeNT的感染,T2和T18則可顯著延長存活時間。這五個中和抗體識別不同的抗原表位。該研究提供了治療和預防破傷風神經(jīng)毒素的有潛力的候選藥物。
免疫接種過程
AHC傳感器固定不同的抗體結合TT,5株中和抗體均具有較強的結合,
親和力KD在0.123 ~ 11.9 nM之間
Octet
陳老濕在整個2020年給大家推薦了五十篇左右的優(yōu)質文獻,Octet以其
結果準確、快速便捷、功能全面等特點為廣大科研機構和制藥企業(yè)提供了有力地可靠工具。同時,用戶也是各種不同新應用的開發(fā)者,腦洞夠大才能化繁為簡,直達目標。
-參考文獻-
[1] Yusufova, N et al., Histone H1 loss drives lymphoma by disrupting 3D chromatin architecture. Nature 589, 299–305 (2021).
[2] John V. Dzimianski et al., Rapid and sensitive detection of SARS-CoV-2 antibodies by biolayer interferometry. Scientific Reports 10:21738(2020).
[3] Williamson et al., Human Antibodies Protect against Aerosolized Eastern Equine Encephalitis Virus Infection. Cell 183, 1884–1900 (2020).
[4] Guanying Zhang et al., Tetanus vaccine-induced human neutralizing antibodies provide full protection against neurotoxin challenge in mice. International Immunopharmacology 91, 107297 (2021).