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                                                              English | 中文版 | 手機(jī)版 企業(yè)登錄 | 個人登錄 | 郵件訂閱
                                                              當(dāng)前位置 > 首頁 > 技術(shù)文章 > LAMP核酸擴(kuò)增技術(shù)的發(fā)展、優(yōu)勢、體系及應(yīng)用

                                                              LAMP核酸擴(kuò)增技術(shù)的發(fā)展、優(yōu)勢、體系及應(yīng)用

                                                              瀏覽次數(shù):9742 發(fā)布日期:2021-3-23  來源:本站 僅供參考,謝絕轉(zhuǎn)載,否則責(zé)任自負(fù)

                                                               一、恒溫?cái)U(kuò)增技術(shù)的發(fā)展現(xiàn)狀
                                                              自1980年P(guān)CR技術(shù)發(fā)明后,基于PCR技術(shù)的核酸檢測迅速應(yīng)用到臨床、食品、環(huán)境的檢測中,并成為核酸檢測的金標(biāo)準(zhǔn)。但PCR的檢測技術(shù)存在設(shè)備體積大、粗樣品耐受性差、反應(yīng)時間長、靈敏度難以達(dá)到單copy等諸多缺點(diǎn),已經(jīng)難以滿足現(xiàn)代核酸檢測的要求:速度快(<30min)、超靈敏度(1-5copy/test)、大體積粗制樣品直檢(20-50%反應(yīng)體積樣本量)、野外操作、簡單化操作等方面的指標(biāo)。 在過去的20年中科學(xué)家一直嘗試通過恒溫?cái)U(kuò)增的方法來實(shí)現(xiàn)上述目標(biāo),這其中包括RCA(rolling circle amplification)、LAMP(loop-mediated isothermal amplification)、RPA(recombinase polymerase amplification)、NASBA(nucleic acid sequence based amplification)、SDA(strand displacement amplification)、HDA (helicase dependent amplification)、TMA(transcription-mediated amplification)等新型核酸恒溫?cái)U(kuò)增技術(shù)。

                                                               

                                                              在這些恒溫?cái)U(kuò)增技術(shù)中,以2000年首次報(bào)道的LAMP法尤為耀眼和引人關(guān)注,目前占據(jù)超過60%的恒溫檢測市場。核酸檢測對LAMP技術(shù)如此親賴,究其原因,得益于其它恒溫檢測技術(shù)難以達(dá)到LAMP技術(shù)的綜合性優(yōu)勢
                                                              1、反應(yīng)速度極快,優(yōu)化的引物組合可以達(dá)到15min內(nèi)檢測到單copy分子,檢測速度接近或超過RPA和NASBA;
                                                              能夠達(dá)到超敏檢測極限,1-5copy的分子能夠穩(wěn)定檢出,穩(wěn)定性極高,其它任何恒溫技術(shù)難以達(dá)到如此穩(wěn)定的水平;
                                                              2、結(jié)果判讀形式的多樣化,適應(yīng)各種環(huán)境和條件下的核酸快速檢測。LAMP擴(kuò)增作為終點(diǎn)判讀形式,可不借助任何其它輔助設(shè)備,裸眼觀察檢出結(jié)果。基于鈣黃綠素、HNB、紅黃變色、OG橙綠變色都可以肉眼觀察結(jié)果。LAMP同樣可借助濁度儀進(jìn)行實(shí)時濁度分析。在反應(yīng)體系中加入SYBR Green熒光染料后,可使用小型恒溫?zé)晒鈨x進(jìn)行實(shí)時檢測。以上這些結(jié)果判讀形式均可在野外等非標(biāo)準(zhǔn)實(shí)驗(yàn)室進(jìn)行,所需設(shè)備簡單、小巧、價(jià)格低廉、便于普及。除此外,傳統(tǒng)實(shí)驗(yàn)室中的熒光定量PCR儀,同樣可進(jìn)行LAMP檢測,可采用SYBR Green、MB探針法或LAMP TaqMan探針法,對于經(jīng)常操作PCR檢測的人員來講,可以無縫對接、無需更換設(shè)備。
                                                              3、對RNA病毒的漏檢率低,由于RNA病毒的突變率較高,在PCR檢測中個別突變對PCR的擴(kuò)增影響較大,容易造成病毒漏檢的假陰性。而LAMP識別靶基因8個區(qū)段,在這些識別區(qū)段中個別的突變對LAMP擴(kuò)增影響較小,不易產(chǎn)生漏檢。
                                                              4、試劑穩(wěn)定、易于使用。同RPA、NASBA等技術(shù)相比,LAMP與PCR法都采用單一酶(或雙酶)系統(tǒng)進(jìn)行反應(yīng),生產(chǎn)批次穩(wěn)定、反應(yīng)酶系統(tǒng)耐高溫,試劑穩(wěn)定性好。在檢測試劑中僅包含酶mix一管、引物/探針一管,使用方便,在熒光定量PCR機(jī)器上可方便的進(jìn)行高通量檢測。而RPA、NASBA等系統(tǒng)需要多個復(fù)合酶,比例嚴(yán)謹(jǐn)、試劑穩(wěn)定生產(chǎn)困難、保存運(yùn)輸條件苛刻、難以高通量應(yīng)用。
                                                              5、LAMP法對耐受雜質(zhì)能力最強(qiáng)。PCR、RPA、NASBA等擴(kuò)增體系均需要進(jìn)行核酸純化制備,在進(jìn)行粗制品的直擴(kuò)系統(tǒng)中,上樣量均較小(<10%),無法大體積上樣,雜質(zhì)對這些擴(kuò)增方法均影響較大。而LAMP法對大多數(shù)樣本的耐受性能達(dá)到20%以上,個別樣本的含量可以容忍到50%以上,如此大的上樣體積量,決定了LAMP具有更高的檢出率。
                                                              6、擴(kuò)增反應(yīng)同步病毒滅活,由于LAMP反應(yīng)溫度在65℃的高溫條件下進(jìn)行,在病毒液直擴(kuò)中,反應(yīng)過程中即可滅活病毒,降低耗材的污染風(fēng)險(xiǎn)。
                                                              7、高特異性,隨著LAMP用酶不斷改進(jìn)、反應(yīng)緩沖液的不斷優(yōu)化、探針技術(shù)的搭配、引物設(shè)計(jì)理念的不斷改善,LAMP的非特異性擴(kuò)增獲得質(zhì)的提升,目前在優(yōu)化的LAMP體系中,假陽性的情況已經(jīng)得到根本改善,假陽性比例接近甚至低于PCR方法。
                                                              8、多重?zé)晒馓结樀膽?yīng)用。隨著Bst DNA聚合酶和反應(yīng)緩沖體系的不斷改進(jìn)、LAMP TaqMan技術(shù)的發(fā)明,多重LAMP體系得以建立。這種多重的LAMP技術(shù),達(dá)到了金標(biāo)準(zhǔn)TaqMan PCR的多靶基因、內(nèi)參質(zhì)控樣本的相同性能,符合到臨床應(yīng)用的標(biāo)準(zhǔn)。


                                                              二、建立核酸恒溫?cái)U(kuò)增技術(shù)平臺
                                                              于2014年啟動LAMP技術(shù)平臺的研發(fā)與搭建,基于分子工具酶研發(fā)經(jīng)驗(yàn)和蛋白質(zhì)電子重構(gòu)架技術(shù),歷時6年時間打造出LAMP全系DNA聚合酶,包括:Bst2.0、Bst3.0、Bst4.0、Bst5.0、Bst7.0 DNA聚合酶。精心優(yōu)化的反應(yīng)體系,打造出性能卓越、高擴(kuò)增效率、高特異性的IsoAmp Mix系列試劑,便于科研和診斷試劑的開發(fā)。上百萬次的測試,總結(jié)出更為高效的引物設(shè)計(jì)理念,為客戶提供免費(fèi)的LAMP引物設(shè)計(jì)服務(wù)。多樣化的預(yù)混顯色試劑,滿足不同檢測需求,包括:可視化變色顯色(紅黃變色、OG變色、HNB變色)、濁度法、SYBR Green熒光法、恒溫?zé)晒馓结樂�、多重恒溫�(zé)晒馓结樂�。除了提供頂級恒溫�(cái)U(kuò)增用酶和預(yù)混mix試劑外,協(xié)助客戶進(jìn)行恒溫?cái)U(kuò)增檢測試劑研發(fā)。

                                                               

                                                               

                                                              三、 LAMP產(chǎn)品體系及應(yīng)用
                                                              1. 原料基礎(chǔ)用酶

                                                              原料酶列表(全系提供含甘油和無甘油的酶版本)

                                                               
                                                              擴(kuò)增速度
                                                              逆轉(zhuǎn)錄活性
                                                              雜質(zhì)耐受性
                                                              dUTP識別能力
                                                              應(yīng)用
                                                              Bst 2.0
                                                              **
                                                              **
                                                              **
                                                              ****
                                                              DNA LAMP SDA反應(yīng)
                                                              Bst 3.0
                                                              ****
                                                              ***
                                                              ****
                                                              **
                                                              LAMP和RT-LAMP反應(yīng)
                                                              Bst 4.0
                                                              ****
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                                                              ****
                                                              **
                                                              RT-LAMP最佳用酶

                                                               

                                                              2. 不同顯色方式的優(yōu)缺點(diǎn)比較

                                                               
                                                              紅黃變色
                                                              OG變色
                                                              HNB變色
                                                              濁度法
                                                              SYBR Green
                                                              恒溫?zé)晒馓结?nbsp;
                                                              結(jié)果判讀方式
                                                              裸眼可視
                                                              裸眼可視
                                                              裸眼可視
                                                              裸眼可視
                                                              濁度儀
                                                              恒溫?zé)晒鈨x
                                                              定量PCR儀
                                                              恒溫?zé)晒鈨x
                                                              定量PCR儀
                                                              反應(yīng)速度
                                                              20-30min
                                                              15-20min
                                                              20-40min
                                                              25-30min
                                                              15-25min
                                                              15-30min
                                                              靈敏度
                                                              <5copy
                                                              <5copy
                                                              <50copy
                                                              <10copy
                                                              <5copy
                                                              <5copy
                                                              單copy檢出率
                                                              30%
                                                              30-50%
                                                              困難
                                                              30%
                                                              >50%
                                                              >50%
                                                              抗雜質(zhì)能力
                                                              ★★
                                                              ★★★★★
                                                              ★★
                                                              ★★★★★
                                                              ★★★★★
                                                              ★★★★★
                                                              假陽性控制能力
                                                              ★★★
                                                              ★★
                                                              ★★★
                                                              ★★★
                                                              ★★★★★
                                                              高通量檢測能力
                                                              ★★★★
                                                              ★★★
                                                              ★★★
                                                              ★★★★★
                                                              ★★★★★
                                                              易用性
                                                              ★★★★
                                                              ★★
                                                              ★★★
                                                              ★★★★★
                                                              ★★★★★

                                                               

                                                              3. 恒溫?cái)U(kuò)增預(yù)混Mix系列

                                                              顯色方式
                                                              檢測模板
                                                              試劑形式
                                                              推薦選用產(chǎn)品
                                                               
                                                              可視化系列(紅黃變色)
                                                              DNA
                                                              液體
                                                              A3824-01
                                                               
                                                               
                                                               
                                                              RNA
                                                              液體
                                                              A3824-01
                                                               
                                                               
                                                               
                                                               
                                                               
                                                               

                                                              可視化系列(OG橙綠變色)
                                                              DNA
                                                              液體
                                                              A3824-02+A3821
                                                               
                                                               
                                                               
                                                              RNA
                                                              液體
                                                              A3824-02+A3821
                                                               
                                                               
                                                               
                                                               
                                                               
                                                               

                                                              可視化系列(HNB變色法)
                                                              DNA
                                                              液體
                                                              A3802
                                                               
                                                               
                                                               

                                                              濁度法
                                                              DNA
                                                              液體
                                                              A3824-02
                                                               
                                                               
                                                               
                                                              RNA
                                                              液體
                                                              A3824-02
                                                               
                                                               
                                                               
                                                               
                                                               
                                                               

                                                              SYBR Green熒光法
                                                              DNA
                                                              液體
                                                              A3824-03
                                                               
                                                               
                                                               
                                                              RNA
                                                              液體
                                                              A3824-03
                                                               
                                                               
                                                               
                                                               
                                                               
                                                               

                                                              恒溫?zé)晒馓结樂?/DIV>
                                                              DNA/RNA
                                                              液體
                                                              定制
                                                              凍干
                                                              定制
                                                               
                                                               
                                                               

                                                              多重恒溫?zé)晒馓结樂?/DIV>
                                                              DNA/RNA
                                                              液體
                                                              定制
                                                              凍干
                                                              定制
                                                              發(fā)布者:上海雅吉生物科技有限公司
                                                              聯(lián)系電話:021-34661276
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                                                              標(biāo)簽: LAMP核酸擴(kuò)增
                                                              用戶名: 密碼: 匿名 快速注冊 忘記密碼
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