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HINT-快速檢測(cè)和評(píng)價(jià)冠狀病毒藥物的方法實(shí)例

瀏覽次數(shù):9107 發(fā)布日期:2020-9-14  來(lái)源:Nexcelom

COVID-19 的出現(xiàn),使全球的公共衛(wèi)生面臨了嚴(yán)峻的挑戰(zhàn)。盡快開發(fā)針對(duì)SARS-CoV-2的藥物和疫苗是科學(xué)家們的當(dāng)務(wù)之急。根據(jù)以往的經(jīng)驗(yàn),具有病毒中和能力的單克隆抗體在這兩方面應(yīng)用都具有很好的潛力。本文將為大家介紹由美國(guó)國(guó)立衛(wèi)生研究院(NIH), 美國(guó)疾病預(yù)防控制中心(CDC), MedImmune 等權(quán)威機(jī)構(gòu)及制藥公司開發(fā)及推薦的快速篩選病毒中和抗體的新方法。

病毒中和抗體的功能研究主要涉及兩方面:病毒結(jié)合和中和能力?贵w結(jié)合能力通常采用ELISA、生物膜干涉技術(shù) (Biolayer Interferometry, BLI)、流式細(xì)胞術(shù)(FACS)等方法研究?贵w中和能力通常通過(guò)假病毒報(bào)告基因或病毒蝕斑減少中和實(shí)驗(yàn)(PRNT)來(lái)評(píng)估。但以上幾種方法均存在各自的弊端與局限性(見下表),難以滿足嚴(yán)峻疫情下快速高通量篩選的迫切要求。因此,開發(fā)快速有效地檢測(cè)抗體結(jié)合和功能的方法,將有助于評(píng)估和篩選靶向病毒的抗體。



近年來(lái),研究者們開發(fā)出了一種稱為“HINT” (High Content Imaging-Based Neutralization Test)的方法,通過(guò)高內(nèi)涵成像設(shè)備對(duì)微孔板中的熒光標(biāo)記樣本進(jìn)行高速成像和分析,快速得出反映抗體結(jié)合與中和能力的實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)。

SARS-CoV-2 于2020年2月11日被WHO正式命名。它也是繼SARS-CoV(嚴(yán)重急性呼吸綜合征病毒)和MERS-CoV(中東呼吸綜合征病毒)之后人類歷史上第三種可引發(fā)致命疾病的冠狀病毒。這里我們就以NIH在2019年發(fā)表的一篇文章為例,給大家詳細(xì)介紹研究者們?nèi)绾斡肅eligo全視野細(xì)胞掃描分析儀開展HINT實(shí)驗(yàn)來(lái)檢測(cè)和評(píng)估MERS-CoV中和抗體的功能的(點(diǎn)擊文末“閱讀全文”下載文獻(xiàn)) 。

MERS-CoV與SARS-CoV-2 的病毒結(jié)構(gòu)類似,在病毒顆粒表面均具有突刺(S)蛋白。S蛋白的原聚體包括兩個(gè)部分,一個(gè)是頭部區(qū)域(S1),有助于病毒的附著;另一個(gè)是莖區(qū)(S2),包括融合復(fù)合物。MERS-CoV S1進(jìn)一步分為與宿主細(xì)胞受體二肽基肽酶-4(DPP4)結(jié)合的受體結(jié)合域(RBD)與N-末端結(jié)構(gòu)域(NTD)[1,2]。由于RBD涉及到受體結(jié)合,所以目前很多抗體開發(fā)都集中于MERS-CoV的RBD [3,4,5]。隨著對(duì)全長(zhǎng)MERS-CoV S蛋白三聚體的結(jié)構(gòu)解析 [6,7],其他區(qū)域也成為了潛在的抗體靶點(diǎn)。許多開發(fā)出的單克隆抗體在動(dòng)物模型中已經(jīng)顯示出治療潛力 [3,4,5,8],而且多克隆抗體也在I期臨床中被證明具有安全性 [9],但是尚無(wú)MERS-CoV特異性抗體被批準(zhǔn)在人體使用。

研究者們利用Celigo全視野細(xì)胞掃描分析儀開發(fā)了一種高通量蛋白結(jié)合抑制檢測(cè)方法,能直接通過(guò)圖像和分析判斷蛋白或抗體與靶細(xì)胞的結(jié)合能力。Celigo可以在明場(chǎng)和熒光通道中直接捕獲和分析微孔板中用熒光抗體標(biāo)記的細(xì)胞圖像,避免了細(xì)胞裂解或胰酶消化等過(guò)程對(duì)細(xì)胞自然狀態(tài)的干擾。Celigo的操作流程十分簡(jiǎn)單,不需要特殊的材料或耗時(shí)的維護(hù)。

研究設(shè)計(jì)思路
 

選擇DPP4高表達(dá)細(xì)胞類型用于抗體結(jié)合和抑制分析

二肽基肽酶-4 (DPP4)是MERS-CoV進(jìn)入宿主細(xì)胞的受體。為了更好地在細(xì)胞水平研究MERS-CoV,研究者們需先建立DPP4高表達(dá)株。A549, BHK21和VeroE6細(xì)胞被轉(zhuǎn)染了不同濃度的DPP4 質(zhì)粒。兩天后,細(xì)胞被固定和染色。Celigo對(duì)所有樣本進(jìn)行全孔成像并識(shí)別單個(gè)細(xì)胞的熒光強(qiáng)度。數(shù)據(jù)以FCS文件導(dǎo)出至FlowJo 10軟件進(jìn)行轉(zhuǎn)染效率分析。BHK-21在0.1 µg質(zhì)粒濃度顯示出了最高表達(dá),因而被選擇用于后續(xù)分析。



優(yōu)化用于抗體結(jié)合和抑制檢測(cè)的細(xì)胞數(shù)

優(yōu)化細(xì)胞接種密度對(duì)于基于熒光的細(xì)胞分析至關(guān)重要。細(xì)胞數(shù)太少會(huì)降低數(shù)據(jù)的可重復(fù)性,細(xì)胞數(shù)太高可能會(huì)造成細(xì)胞堆疊,影響分析。研究者們將不同密度的BHK-21細(xì)胞接種過(guò)夜并轉(zhuǎn)染DPP4, 通過(guò)Celigo的明場(chǎng)通道查看和分析細(xì)胞形態(tài)和融合率,最終選擇5×10^3個(gè)細(xì)胞/孔作為最佳接種密度。



開發(fā)基于圖像分析的病毒蛋白結(jié)合檢測(cè)方法

為了確定病毒蛋白與DPP4高表達(dá)BHK-21細(xì)胞結(jié)合的適合條件,研究者們對(duì)多個(gè)參數(shù)進(jìn)行了優(yōu)化:蛋白構(gòu)建體(MERS-CoV S三聚體或S1單體),蛋白量(0.1–10 µg)和染色方案(AL488抗His-Tag 抗體、不同的MERS-CoV單克隆抗體和AF488抗MERS-CoV S蛋白抗體 )。在蛋白構(gòu)建體方面,Celigo的熒光細(xì)胞圖片顯示MERS-CoV S三聚體和S1單體都能有效地結(jié)合到細(xì)胞上。然而熒光強(qiáng)度分析說(shuō)明,與S1單體相比,MERS-CoV S三聚體顯示出比對(duì)照組更大的峰移。此外,利用全長(zhǎng)MERS-CoV S三聚體可以評(píng)估抗體與整個(gè)S蛋白的相互作用。因此,MERS-CoV S三聚體被用于后續(xù)的實(shí)驗(yàn)。


開發(fā)基于圖像分析的病毒蛋白結(jié)合抑制檢測(cè)方法

RBD特異性抗體通過(guò)阻斷S蛋白和DPP4的結(jié)合,從而主導(dǎo)了MERS-CoV的宿主免疫原性反應(yīng)?贵w也可以作用于其他表位,包括NTD和S2區(qū)域。研究者們測(cè)定了結(jié)合MERS-CoV S不同區(qū)域的單克隆抗體抑制MERS-CoV S與DPP4表達(dá)細(xì)胞的結(jié)合能力。以下的流程圖為該方法的實(shí)驗(yàn)步驟。
 

Celigo通過(guò)綠色(AL488)、紅色(PE)和藍(lán)色(DAPI)熒光通道對(duì)樣本進(jìn)行了全孔成像和分析熒光細(xì)胞圖片顯示D12抗體(RBD特異性)(圖4A,B)和G2抗體(NTD特異性,數(shù)據(jù)未顯示)均以劑量依賴性方式抑制MERS-CoV S蛋白結(jié)合,病毒S蛋白的熒光強(qiáng)度(綠色熒光)隨著抗體濃度的降低而減弱。FlowJo分析結(jié)果表明這兩種抗體具有相似的IC50值(~7.5 nM),和它們已知的與MERS-CoV S的結(jié)合常數(shù)具有可比性 [5]。此結(jié)果與先前證明這些單克隆抗體與MERS-CoV S1結(jié)合的BLI實(shí)驗(yàn)結(jié)果一致。作為陰性對(duì)照,G4抗體的結(jié)合區(qū)域?yàn)镾2,在空間上與RBD-DPP4的相互作用較遠(yuǎn),因此沒有顯示出任何抑制作用,如圖4E所示。

用假病毒中和實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證結(jié)合抑制結(jié)果

以往的研究顯示,測(cè)試的三種單克隆抗體(G2,D12和G4)都可有效中和MERS-CoV假病毒感染天然表達(dá)DPP4的Huh 7.5細(xì)胞 [5]。為了驗(yàn)證抑制結(jié)果的可靠性,研究者們進(jìn)行了MERS-CoV England 1假病毒中和實(shí)驗(yàn),以確定抗體對(duì)表達(dá)DPP4的BHK21細(xì)胞的中和模式與結(jié)合抑制方式是否相似。正如所預(yù)期的,G2和D12具有相似的中和曲線(圖5),IC50值在0.5–0.8 nM范圍內(nèi)。而G4的IC50(圖5)比D12和G2高一個(gè)數(shù)量級(jí),與結(jié)合抑制結(jié)果一致。以往的研究也在Huh 7.5細(xì)胞中顯示出D12 / G2和G4之間存在相同數(shù)量級(jí)的差異 [5]。

結(jié)語(yǔ)

近年來(lái),HINT已被多家機(jī)構(gòu)和制藥公司用于病毒的抗體中和能力檢測(cè),例如被美國(guó)CDC用于H3N2型甲流病毒 [10], MedImmune用于呼吸道合胞病毒 [11],中國(guó)食藥監(jiān)局用于H7N9型禽流感病毒等 [12]。HINT中的”Neutralization”(中和)不僅指抗體的中和作用,也可以廣義地理解為非抗體類病毒藥物/疫苗抑制病毒感染細(xì)胞的能力,因此在mRNA、DNA疫苗,佐劑,化學(xué)合成藥物等的評(píng)估中也有很好的應(yīng)用潛力。Celigo全視野細(xì)胞掃描分析儀具有分析整孔細(xì)胞的能力,在96孔板中掃描所有樣品僅需10-15分鐘,并且可以得到細(xì)胞數(shù),細(xì)胞形態(tài)和熒光表達(dá)(包括未轉(zhuǎn)染的細(xì)胞,細(xì)胞面積,平均熒光強(qiáng)度和總熒光強(qiáng)度)等結(jié)果。該方法可以快速地優(yōu)化試驗(yàn)參數(shù),例如細(xì)胞接種密度、細(xì)胞類型、蛋白選擇和染色方法。另外,一塊微孔板上可設(shè)置多個(gè)復(fù)孔和比較各種條件組合,能大大降低實(shí)驗(yàn)成本。Celigo高通量、高速度的特點(diǎn)以及強(qiáng)大的軟件分析能力結(jié)合HINT技術(shù)可加速抗病毒藥物和疫苗的開發(fā),成為研究傳染病的一種有價(jià)值的工具。

Nexcelom Bioscience對(duì)奮戰(zhàn)在防疫一線的醫(yī)護(hù)人員和科研人員工作者致以最高崇高的敬意!同時(shí)為貢獻(xiàn)一份力量,我們將對(duì)所有研究新冠病毒的單位和人員提供力所能及的無(wú)償服務(wù)與幫助。如有任何需要,請(qǐng)歡迎致電021-5886 0038。

愿我們能贏得這場(chǎng)與病毒的較量,挽救和保護(hù)更多的生命!Better tool for better biology for better life!

參考文獻(xiàn)

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