如何使用NMR對生物樣本研究
瀏覽次數(shù):3263 發(fā)布日期:2019-9-25
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使用 NMR的 IVDr 研究,專為生物樣本庫設(shè)計的創(chuàng)新型分析方案。
高分辨率 NMR 已快速發(fā)展成為體液和組織分析中的主要工具。它可用于高通量且一鍵式全自動化地生成譜圖數(shù)據(jù),從這些數(shù)據(jù)中可自動定量生物標(biāo)志物的含量,或與健康或疾病狀態(tài)的統(tǒng)計模型相比較。由于其卓越的重現(xiàn)性和在不同實驗室間的可轉(zhuǎn)移性,它還可用于大規(guī)模流行病學(xué)研究。這些優(yōu)點,加上標(biāo)準(zhǔn)操作流程和標(biāo)準(zhǔn)化工具平臺,可將世界各地生成的數(shù)據(jù)與來自生物樣本庫網(wǎng)絡(luò)的數(shù)據(jù)整合在一起。
NMR 與生物樣本庫及其日常工作的關(guān)系怎樣?
NMR 可用于樣本納入生物樣本庫時的質(zhì)量控制,同步產(chǎn)生的測量數(shù)據(jù)還可作為額外產(chǎn)生的分析數(shù)據(jù)而增加樣本存儲的附加價值:
- „ 驗證樣本的類型,例如判定EDTA(乙二胺四乙酸)血漿、枸櫞酸鹽血漿,以及質(zhì)量控制、檢查污染和雜質(zhì)
- „ 生成每個樣本的 NMR 譜圖,用于輸入生物樣本庫信息,其中NMR 譜圖在標(biāo)準(zhǔn)條件下生成,可用于世界范圍內(nèi)不同生物樣本庫的整合波譜庫
- „ 同步生成包含114個參數(shù)的血清/血漿的脂蛋白亞分析數(shù)據(jù)
- „ 增加一系列尿液定量數(shù)據(jù),包括每個代謝物的參考濃度范圍
NMR 用于波譜數(shù)據(jù)庫應(yīng)用和數(shù)據(jù)交換的適合性
同樣 SOP 下、使用標(biāo)準(zhǔn)化 NMR 平臺的 NMR 分析的重現(xiàn)性和可轉(zhuǎn)移性見圖 3。血清樣本的等分樣已經(jīng)過制備和檢測,使用同一儀器單獨制備和檢測的 15次重復(fù)測定之譜圖疊圖顯示在上部,而下部疊圖顯示的是在同樣 SOP 下、使用同一型號儀器在兩個實驗室分別采集的8個譜圖數(shù)據(jù)的疊圖?梢钥闯鰜,所有譜圖都完美重疊。這證明來自不同生物樣本庫的譜圖數(shù)據(jù)可用于綜合統(tǒng)計分析。因此,對于新的研究,可使用譜圖數(shù)據(jù)來代替取自生物樣本庫的新等分樣。
使用分析數(shù)據(jù)給生物樣本庫增加價值
無論是哪個生物樣本庫,與樣本有關(guān)的元數(shù)據(jù)都很重要。這些數(shù)據(jù)可以是患者數(shù)據(jù)、生活方式信
息,也可以是分析數(shù)據(jù),例如血漿/血清中的脂蛋白(包括亞類)濃度,尿液中內(nèi)源性代謝產(chǎn)物的濃度等。通過直接使用質(zhì)控時獲得的譜圖,可自動生成分析結(jié)果,包括從所有生物樣本庫測試樣品所得到的各代謝物濃度的參考范圍。