質(zhì)粒載體和外源DNA的連接反應(yīng)
瀏覽次數(shù):8803 發(fā)布日期:2018-1-26
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質(zhì)粒載體和外源DNA的連接反應(yīng)
實(shí)驗(yàn)原理
DNA片段之間的連接是通過(guò)DNA連接酶的催化實(shí)現(xiàn)的。DNA連接酶催化具有平末端或互補(bǔ)粘性末端的DNA片段間相鄰堿基通過(guò)3’,5’磷酸二酯鍵連接起來(lái),該反為需能反應(yīng),通常需要加入ATP或NADH,DNA連接酶對(duì)粘性末端的連接效率要遠(yuǎn)高于對(duì)平末端的連接效率。在基因基因工程實(shí)驗(yàn)中,最常用的來(lái)源于T4噬菌體的T4DNA連接酶。對(duì)于平末端或互補(bǔ)的粘性末端可直接進(jìn)行連接反應(yīng)。一個(gè)片段是平末端,另一片段為粘性末端或兩個(gè)片段都是粘性末端但不配對(duì),則需要通過(guò)各種方式使其可一匹配或通過(guò)平末端進(jìn)行連接。通常采用末端補(bǔ)平、加同聚物尾、加接頭等方式是目的片段之間能夠匹配。
進(jìn)行連接反應(yīng)時(shí),為了減少片段的自連,通常要進(jìn)行去磷酸化,去磷酸化可通過(guò)堿性磷酸酶完成。比如將目的片段和載體進(jìn)行時(shí)通常要將載體去磷酸化,以減少載體的自連。同要進(jìn)行連接反應(yīng)也經(jīng)常對(duì)目的片段進(jìn)行磷酸化以增強(qiáng)目的片段的連接,在相鄰堿基間如果沒(méi)有磷酸在連接效率大幅下將,如果載體進(jìn)行了去磷酸化,目的片段可進(jìn)行磷酸化,以增強(qiáng)目的片段和載體的連接。
在連接反應(yīng)中,目的DNA片段和載體的比例是一個(gè)關(guān)鍵問(wèn)題,對(duì)于長(zhǎng)度為1kb的片段和3kb的載體而言,通常目的片段和載體的比例設(shè)為2:1或3:1,如果目的片段越長(zhǎng)該比例應(yīng)再升高,因?yàn)橹饕紤]的是載體和目的片段之間的分子數(shù)的比例。反應(yīng)體系中核酸的濃度也是一個(gè)重要問(wèn)題,通常反應(yīng)體系中反應(yīng)物濃度應(yīng)保持在25-100 ng / μl。
連接反應(yīng)和其它酶不同,需要在較低的溫度下進(jìn)行,通常在12~16℃過(guò)夜,也可在4℃過(guò)夜連接,如果是平末端連接,可適當(dāng)提高連接溫度。除上述因素外,DNA樣品的純度、鹽濃度等會(huì)影響連接效率。
實(shí)驗(yàn)試劑
1、目標(biāo)DNA片段(實(shí)驗(yàn)九RT-PCR擴(kuò)增產(chǎn)物)
2、載體(pGEMT-easy)
3、2 × ligation 緩沖液
4、T4 DNA連接酶
5、ddH2O
實(shí)驗(yàn)設(shè)備
1、臺(tái)式離心機(jī)
2、恒溫水浴
3、微量移液器
實(shí)驗(yàn)步驟
1、取一個(gè)1.5ml離心管依次加入下列試劑:
2 × buffer: 5μl
pGEMT-easy: 0.5μl
目的片段: 2.5μl
T4連接酶: 1μl
ddH2O 1μl
2、2000 rpm 離心30S,使反應(yīng)體系充分混合。
3、4℃過(guò)夜連接。