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最新生物標志物biomarker檢測技術(shù)進展(二)

瀏覽次數(shù):4575 發(fā)布日期:2016-7-26  來源:本站 僅供參考,謝絕轉(zhuǎn)載,否則責任自負

生物標志物檢測的創(chuàng)始:免疫組織化學

人類最早是在組織樣本中實現(xiàn)了生物標志物的檢測。組織特異性的標志物在現(xiàn)代醫(yī)療中被經(jīng)常用來研究腫瘤等疾病中的病理變化。最經(jīng)典的被轉(zhuǎn)化醫(yī)學成功應用于組織中標志物檢測的方法是免疫組織化學(Immunohistochemistry),特別是在肺炎中的早期應用。免疫組化技術(shù)在1940年代發(fā)明時[1],初衷是證實病原體的存在部位,例如肺炎球菌II型和III型多糖在鼠中的定位。過氧化物酶標記技術(shù)在1979年成熟,免疫組化的靈敏度被顯著提高。帶來的直接益處是福爾馬林固定石蠟包埋(FFPE)組織切片的免疫組化檢測。多數(shù)情況下免疫組化使用酶聯(lián)抗體來進行顯色反應,并通過顯微鏡鏡檢。盡管在醫(yī)學檢驗中使用廣泛,但這項技術(shù)仍然存在瓶頸:需要非常專業(yè)的操作人員和極為嚴格的標準,還僅能得到半定量的結(jié)果。近些年來專家致力于免疫組化的標準化和自動化。但要在全世界各地的實驗室實現(xiàn)非常一致的免疫組化,并且在假陽性或假陰性等區(qū)分度方面達到一致的判別標準,還面臨眾多的困難,爭論和挑戰(zhàn)。人們對免疫組化應用于標志物檢測的展望包括提高靈敏度以檢測低豐度蛋白,較好的動態(tài)檢測范圍,更高的空間分辨率以判別標志物表達的細胞類型甚至是細胞器類型。另外,免疫組化在多重性,絕對定量以及特異性方面的需求還沒有得到有效滿足。

生物標志物的應用關鍵:體液樣本檢測

生物標志物近年來引起了極大的關注,因為有大量在血漿或血清中的蛋白標志物被鑒定。盡管這些蛋白有較高的轉(zhuǎn)化醫(yī)學價值,但現(xiàn)有技術(shù)的檢測靈敏度或檢測能力仍然是主要的制約因素。事實上在過去長達15年時間里,平均每年進入臨床應用的新的生物標志物僅為1-2個。在平臺的選擇方面,靈敏度并不是唯一的考量,準確性,可重復性,動態(tài)檢測范圍大小以及樣本通量決定標志物檢測能力。由此也不難理解為什么質(zhì)譜技術(shù)在體液樣本檢測中的應用不廣:質(zhì)譜最主要的缺陷是不適合復雜樣品的分析,特別是體液樣品,體液的樣本除了成分復雜,更有巨大的動態(tài)范圍。

在血清和血漿這樣的生物樣本中檢測蛋白標志物,動態(tài)檢測范圍是區(qū)分度的關鍵。不僅個體間同一指標可以出現(xiàn)幾十倍甚至上百倍的產(chǎn)別。同一份樣本里的不同標志物更是可以達到10個數(shù)量級的差別。例如白蛋白含量大約在30-50mg/mL,而細胞因子可低至pg/mL. 而潛在的大量新型生物標志物甚至會遠低于已知標志物的表達水平(新標志物常表達量較低,因而未被傳統(tǒng)技術(shù)檢出)。血清和血漿樣本因其容易獲得性,一直被當做最理想的生物標志物樣本。但由于血液循環(huán)系統(tǒng)的稀釋作用,血液樣本中的蛋白標志物通常含量極低,需要高靈敏度的技術(shù)才能有效檢測。

總體而言,對于體液樣本的檢測,人們需要較高的靈敏度來檢測表達含量很低的樣本。同時,盡可能擁有較寬的動力學范圍來適應樣本的濃度差異。盡管很多研究者可能認為現(xiàn)有傳統(tǒng)技術(shù)已經(jīng)可以很方便地測定一些常規(guī)的生物標志物,但事實上人們還是會經(jīng)常發(fā)現(xiàn)有重要的標志物無法測得,并且根據(jù)數(shù)據(jù)結(jié)果較輕易相信樣本中不存在目標分析物。在意識到現(xiàn)有技術(shù)其實不能充分檢測樣本中含量較低的分析物之前,重要生物學現(xiàn)象的發(fā)現(xiàn)機會就已經(jīng)錯失了。關于這一點在后文的篇幅中將做簡明扼要的討論。多重生物標志物檢測(Multiplex)技術(shù)的興起和發(fā)展使得研究者更容易利用有限的樣本和經(jīng)費做出科研發(fā)現(xiàn),受到廣泛的歡迎。但不論哪種平臺,多重檢測與生俱來的檢測指標間相互干擾的問題很難避免,在涉及超高靈敏度檢測需求時這種干擾經(jīng)常大到無法被研究者忽視。這也解釋更前沿、對數(shù)據(jù)要求更高的工作,例如藥物研發(fā),通常不把多重檢測技術(shù)當成首選方案。

 

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來源:默克生命科學
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