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中海大:測(cè)序與芯片揭示miRNA調(diào)控海參夏眠機(jī)制

瀏覽次數(shù):2507 發(fā)布日期:2014-1-15  來(lái)源:本站 僅供參考,謝絕轉(zhuǎn)載,否則責(zé)任自負(fù)

 海參(Apostichopus japonicus),是生活在海邊至海底8000米的海洋棘皮動(dòng)物,以海底藻類和浮游生物為食。當(dāng)夏季來(lái)臨,上層海水由于太陽(yáng)光強(qiáng)烈照射,溫度上升。此時(shí),海底的小生物都浮到海面,進(jìn)行一年一度的大量求食和繁殖。而留在海底的海參,迫于夏季食物中斷,進(jìn)入夏眠,此時(shí),其基礎(chǔ)代謝率明顯減退,耗氧和氨氮排泄率下降,甚至嚴(yán)重退化為一個(gè)很細(xì)小的腸纖維。

 

       MiRNAs在低代謝基因調(diào)控中的作用研究,是一個(gè)新興的熱點(diǎn)。為了確定miRNAs是否對(duì)海參夏眠過(guò)程具有調(diào)控作用,近日,中國(guó)海洋大學(xué)的陳慕雁博士后領(lǐng)銜的團(tuán)隊(duì)和聯(lián)川生物公司科研團(tuán)隊(duì)攜手,對(duì)海參夏眠過(guò)程中的miRNAs進(jìn)行了深入研究,研究成果發(fā)表在10月刊的PLoS ONE上。

 

       研究人員對(duì)深度夏眠至少連續(xù)15天狀態(tài)的海參采集樣本,并使用經(jīng)過(guò)夏眠后又恢復(fù)活動(dòng)狀態(tài)的非夏眠海參為對(duì)照樣本。之后,研究人員采用Solexa深度測(cè)序技術(shù)分析了海參腸miRNA的表達(dá)譜,結(jié)果一共鑒定出了308個(gè)海參miRNAs,包括18個(gè)新的海參特異性miRNAs。其中,有42個(gè)miRNAs在海參夏眠階段具有表達(dá)差異,最突出的miRNAs,包括miR-200-3p, miR-2004, miR-2010, miR-22, miR-252a, miR-252a-3p以及 miR-92,在夏眠與非夏眠階段相比,具有顯著的過(guò)表達(dá)。差異表達(dá)的miRNAs通過(guò)miRNA芯片和RT-RCR得到了驗(yàn)證(miRNA芯片服務(wù)由聯(lián)川生物完成)。通過(guò)預(yù)測(cè)的miRNA靶基因并進(jìn)行GO分析表明,這些miRNAs在海參夏眠階段的全轉(zhuǎn)錄水平抑制以及細(xì)胞分化中發(fā)揮重要作用。

*Chen M, Zhang X, Liu J, Storey KB.(2013) High-Throughput Sequencing Reveals Differential Expression of miRNAs in Intestine from Sea Cucumber during Aestivation. PLoS ONE15;8(10):e76120.[]

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