1、空間單細胞蛋白組背景

空間生物學研究著眼于組織存在哪些細胞、這些細胞在組織中的位置、它們的生物標志物共表達模式，以及它們?nèi)绾蜗嗷プ饔靡杂绊懡M織微環(huán)境。 通過在組織原位下研究細胞，您將獲得新穎的生物學見解。

2、PCF空間單細胞蛋白組技術(shù)

真正的空間表型分析結(jié)合了單細胞分辨率的全玻片成像，以及可視化和定量生物標志物表達，并揭示細胞如何在整個組織景觀中相互作用。這里給大家介紹的是美國Akoya公司的PhenoCycler-Fusion空間單細胞蛋白組分析平臺（原名CODEX）。PCF空間單細胞蛋白組技術(shù)能夠以前所未有的規(guī)模和速度對數(shù)百萬個細胞進行空間表型分析。在單個完整組織切片上繪制數(shù)百萬個細胞及其相互作用有助于發(fā)現(xiàn)稀有細胞類型、細胞鄰域和空間功能狀態(tài)。

3、PCF空間單細胞蛋白組技術(shù)原理

PCF空間單細胞蛋白組技術(shù)的核心原理是每種抗體上標記特異性DNA“條形碼標簽”(Barcode)。成像所需的熒光染料是通過和Barcode互補的寡核苷酸鏈，采用循環(huán)熒光成像，可以實現(xiàn)50種或更多蛋白指標的同時檢測及分析。

PCF空間單細胞蛋白組的實驗流程包括：（1）所有抗體一次性和組織切片孵育；（2）PhenoCycler微流控平臺實現(xiàn)熒光染料標記孵育、成像、熒光洗脫的循環(huán)染色，以及圖像采集，獲得高分辨的單細胞組織圖像。

4、PCF空間單細胞蛋白組技術(shù)優(yōu)勢

PCF空間單細胞蛋白組技術(shù)優(yōu)勢明顯：（1）可以實現(xiàn)全組織切片成像，最大成像面積630mm2；（2）空間單細胞分辨率，可達250nm；（3）超多重靶標檢測，最多實現(xiàn)100+蛋白同時檢測；（4）具有70多種已偶聯(lián)Barcode的抗體庫，以及即用型抗體組合panel，并且可以靈活定制，滿足不同的研究需求；（5）石蠟包埋樣本和新鮮冰凍樣本都可適用

5、PCF空間單細胞蛋白組技術(shù)應(yīng)用

PCF空間單細胞蛋白組技術(shù)應(yīng)用場景非常廣泛，包括腫瘤微環(huán)境、炎癥組織結(jié)構(gòu)分析、神經(jīng)組織、腎臟組織等，應(yīng)用該技術(shù)的研究成果頻繁發(fā)表在Cell、Nature、Science等國際頂刊。例如美國NIH建立的人類生物分子圖譜項目(Human Bio-Molecular Atlas Program, HuBMAP)打算通過各種單細胞分析技術(shù)、空間單細胞成像技術(shù)實現(xiàn)以單細胞分辨率全面繪制人體圖譜。2023年7月20日Nature雜志在線發(fā)表了其中一項HuBMAP研究，題名“Organization of the human intestine at single-cell resolution“。該研究利用PCF空間單細胞蛋白組技術(shù)分析了小腸和結(jié)腸不同組織區(qū)域的空間細胞分布和表型，建立了不同腸道區(qū)域的組織空間單細胞參考圖譜。

諸如PCF等的空間單細胞蛋白組技術(shù)必然會對醫(yī)學、基礎(chǔ)生物學等領(lǐng)域帶了深刻的變革，通過單細胞分辨率下的空間組織成像真正地洞察疾病發(fā)生進展和治療反應(yīng)的機制以及疾病預后的新型空間標志物。

華盈生物提供服務(wù)的Akoya的PhenoCycler（原CODEX）技術(shù)平臺，采用專利的DNA偶聯(lián)抗體檢測技術(shù)結(jié)合自動化高分辨熒光顯微鏡，可還原蛋白質(zhì)和特定細胞在組織中的真實分布�？蓪崿F(xiàn)近百種蛋白質(zhì)的空間原位檢測。