明白之間——說說熒光定量PCR實驗耗材的選擇
小朗課堂
前兩天,小朗在與某實驗室研究員交流時了解到這么一個情況,他們在qPCR實驗時使用透明管,得到的實驗結(jié)果熒光信號值比較低,曲線被壓得很低,坐標(biāo)軸也不能自適應(yīng)曲線,顯示如下圖。
而正常情況如下圖,縱坐標(biāo)的范圍是可以隨著曲線最大熒光信號值而變化的,并可獲得一條漂亮的S曲線。
明白了這個情況后,小朗為其推薦了白管,更換成白管后,問題就迎刃而解了。
那么,問題來了,
為何做qPCR實驗時一定要用白管呢?
熒光信號值與哪些因素有關(guān)呢?
我們一起來學(xué)習(xí)一下吧~
白管PK透明管
PCR管/板常見的有白色和透明兩種。在傳統(tǒng)PCR實驗中,兩者在使用效果上沒有太大差異,相比較透明管更為方便,因為實驗者更容易看清楚試劑加上與否。但在熒光定量PCR實驗中,白管的優(yōu)勢就凸顯出來了。
優(yōu)勢一:白管管壁支持一致的信號反射,提高qPCR結(jié)果的一致性。
qPCR實驗的核心數(shù)據(jù)是Ct值,而熒光信號是Ct值計算的數(shù)據(jù)來源,所以管內(nèi)的熒光能否完好地傳遞至頂部的檢測器是至關(guān)重要的。
如下圖是三種不同透明度的管子,因為透明管四周均是透明的,對于底部試劑激發(fā)出來的熒光會散向四面八方,管內(nèi)的熒光信號只有少量能到達(dá)管頂部,最終只有少量信號進(jìn)入檢測器,且管間熒光信號不一致。
圖1 白管和透明管內(nèi)部熒光信號路線圖
然而,如圖1所示,與其他管材相比,白管管壁不透明,幾乎沒有信號丟失,且隔絕了樣品臺污染的熒光信號干擾,減少了相同樣本孔間差異。
優(yōu)勢二:白管支持最大限度的信號傳輸,改進(jìn)對低拷貝數(shù)樣本的檢測,提高靈敏度。
圖2 白管和透明管檢測信號對比圖
從圖2中可以看出,同樣試劑量的情況下,到達(dá)檢測器的信號強度,使用白管明顯高于透明管。因此相比于透明管,使用白管可明顯提高檢測器檢測到的信號強度,提高qPCR數(shù)據(jù)的靈敏度。
優(yōu)勢三:支持更小體系擴增,節(jié)約實驗成本。
正因為白管有著高靈敏度的特性,使用白管可以采用小體積反應(yīng),從而可減少實驗試劑量,大大節(jié)省成本~
圖3 白管擴增結(jié)果展示圖
國際一線品牌也同樣證實白管更適合實時熒光定量實驗的結(jié)論。
如上圖,qPCR使用透明和白色耗材的結(jié)果比較:
(A)與透明孔相比,白色孔Ct值更低(靈敏度更高)。
(B)白色孔在技術(shù)重復(fù)中也表現(xiàn)出更高的一致性。
在設(shè)置實時PCR或qPCR的反應(yīng)時,與透明耗材相比,我們更推薦使用白色耗材,以實現(xiàn)靈敏和準(zhǔn)確的熒光檢測。
——賽默飛生命科學(xué)
Jena
Sarstedt
Eppendorf
那么熒光定量PCR儀需要采用
什么技術(shù)才能滿足使用白管呢?
我們來看一下
國際主流品牌的定量PCR儀產(chǎn)品,
一探究竟吧~
首先我們來看一下賽默飛的高端系列Q5和Q7,他們用的是CCD頂部檢測的技術(shù)方案,再來看一下羅氏的旗艦產(chǎn)品LG480,我們可以看到,他們用的也是CCD頂部檢測技術(shù)。
朗基是國內(nèi)第一家全部采用頂部CCD檢測技術(shù)的定量PCR儀廠家。
朗基奧金系列熒光定量PCR系統(tǒng)
頂部CCD檢測技術(shù)光學(xué)部件固定,穩(wěn)定性好,故障率低,對熒光信號的接收和處理能力強,是定量PCR儀檢測技術(shù)的大勢所趨。
頂部CCD檢測技術(shù)
此外,同樣是白管,我們實驗證明白管的質(zhì)量高低也會影響熒光信號值的大小。如下圖:
結(jié)果表明,相較于其他品牌白色管和透明管的擴增曲線,朗基標(biāo)配的白色管的熒光信號值更強,曲線重合度更好。
綜上所述,
在進(jìn)行qPCR實驗時,
使用白管和頂部檢測技術(shù)的qPCR儀,
可獲得更佳實驗結(jié)果。
朗基奧金系列熒光定量PCR儀
采用頂部CCD檢測技術(shù),
配套的管材都是白管,
也可單獨采購白管,
歡迎選購朗基產(chǎn)品,
聯(lián)系我們哦~