培養(yǎng)細胞一經污染，多數(shù)較難處理。在細胞培養(yǎng)中如果污染細胞價值不大，宜棄之；在尋找原因后徹底消毒操作室，復蘇或重新購置細胞，再進行細胞培養(yǎng)。 污染細胞價值較大，又難于重新得到，可采取以下辦法清除。

一、細菌和真菌的清除

抗生素對殺滅細菌較有效。聯(lián)合用藥比單獨用藥效果好。預防用藥比污染后再用藥效果好。

預防用藥一般用雙抗生素，污染后清除用藥需采用大于常用量5～10倍的沖洗法，于加藥后作用24～48小時，再換常規(guī)培養(yǎng)液。此法在污染早期有效。
二、、支原體的清除

1、 用MRA處理

用MRA（Mycoplasma Removal Agent）處理細胞，每4天換一次液,連續(xù)處理15天以確保細胞純潔健康，效果好。   

2、 用清洗純化法清除支原體污染的方法

細胞營養(yǎng)馴化→細胞群的篩選→細胞清洗→反復離心洗滌。

其原理是利用離心力、細胞、微生物質量和懸液的浮力差達到清除支原體的目的。由于支原體個體小且除發(fā)酵支原體外多為細胞外寄生,所以通過反復洗滌細胞和低速離心換液使其中潛在的支原體數(shù)量降低限。

如結合敏感抗生素的抑殺作用，可達到更好的效果。

3、藥物輔助加溫處理

細胞培養(yǎng)先用藥物處理后，再將污染的組織培養(yǎng)物放在41℃培養(yǎng)18小時，可殺死支原體，但對細胞有不良影響。

4、使用支原體特異性血清  

用5%的兔支原體免疫血清可去除支原體污染，因特異抗體可抑制支原體生長，故經抗血清處理后11天即轉為陰性，并且5個月后仍為陰性。但此法比較麻煩，不如用抗生素方便、經濟。