一文讀懂腸道菌群非靶標代謝組學
瀏覽次數:1524 發(fā)布日期:2021-4-23
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人體內腸道微生物數量高達100萬億個,接近自身細胞總量的10倍,是人體的“第二基因組”,也被稱為“人體另一個器官”。大量研究表明腸道菌群與糖尿病、肝臟疾病、心腦血管疾病、腎病、艾滋病、腫瘤等多種疾病密切相關,在人類健康和疾病中發(fā)揮著至關重要的作用。腸道菌群通過產生的代謝物對人體產生影響。運用代謝組學檢測腸菌代謝物的動態(tài)變化,清晰展示腸道菌群在宿主中的代謝狀態(tài),可更加直觀的研究腸道菌群與疾病發(fā)生發(fā)展的關系,從而為疾病的預防和治療,提高宿主的健康水平提供新的思路。通過KEGG、BIOML、CGR、HBC、GMrepo等數據庫結合文獻及宏基因組深度測序數據,Biotree自主構建了腸道菌群代謝組數據庫,覆蓋2800+個菌株,1200+個腸道菌群相關代謝物,不僅可有效對代謝物進行溯源分類,而且代謝物可精細溯源到具體菌株(部分為種屬),將大大助力腸道菌群與健康作用機制研究。
1.技術優(yōu)勢
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覆蓋2800+個菌種,1200+個腸道菌群相關代謝物,代謝物數量、菌株數量龐大;
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不僅可對眾多物種的代謝物進行溯源分類,而且代謝物可以溯源到菌株;
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代謝物可以確定上下游關系(如果是可逆反應則無)及調控基因/酶。
2.技術路線

3.技術參數
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樣本要求
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糞便、腸道內容物 200 mg/sample
血清、血漿 200 μL/sample
培養(yǎng)液 ≥200 μL/sample(推薦0.5mL/sample)
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檢測平臺
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UHPLC-QTOF-MS/UHPLC-QE-MS
4.應用方向
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腸道菌群代謝物動態(tài)變化研究;
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腸道菌群差異代謝物篩選;
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腸道菌群在疾病發(fā)生發(fā)展中的作用機理研究。
5.案例分析
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小小腸道菌群決定腎的“生死”
6.延伸閱讀
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腸道菌群研究新策略——腸菌代謝物及其功能研究
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Biotree腸道菌群代謝組學助力腸道菌功能研究
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