果蠅攀爬試驗(yàn)(Climbing Assay)的缺點(diǎn)及DART進(jìn)行運(yùn)動(dòng)能力檢測的優(yōu)勢
瀏覽次數(shù):141 發(fā)布日期:2024-12-22
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果蠅的壽命短,加上強(qiáng)大的遺傳操作和全基因組篩選工具,使其成為研究人類神經(jīng)退行性疾。╪eurodegenerative disorders)的一個(gè)理想的模型系統(tǒng)。果蠅模型尤其被廣泛應(yīng)用于癡呆癥(包括阿爾茨海默氏癥Alzheimer disease和額顳葉癡呆癥frontotemporal dementia)和各種運(yùn)動(dòng)障礙(包括帕金森病Parkinson和肌萎縮側(cè)索硬化癥amyotrophic lateral sclerosis)的研究。
在許多研究中,需要測量與疾病相關(guān)的神經(jīng)輸出的逐漸衰退(progressive decline)。雖然神經(jīng)退行性疾病相關(guān)表型(如記憶測試或晝夜節(jié)律行為變化)可以用果蠅來量化,但這些檢測方法很復(fù)雜,不適合大規(guī)模篩選。因此,運(yùn)動(dòng)功能的逐漸衰退通常被用來衡量神經(jīng)輸出。
最常用于測量運(yùn)動(dòng)輸出的方法是利用果蠅受驚(startled)時(shí)表現(xiàn)出的先天負(fù)地心引力反應(yīng)(negative geotaxis response)。
當(dāng)敲擊小瓶底部時(shí),成蠅會向后上方爬向頂部。這種逃避反射已被果蠅研究人員使用了30多年,也是攀爬試驗(yàn)的基礎(chǔ)。在這種檢測方法中,先將一組蒼蠅轉(zhuǎn)移到空瓶中,然后輕拍空瓶,使果蠅落到瓶底。用照相機(jī)記錄果蠅向后上方爬行,并記錄在限定時(shí)間內(nèi)爬到瓶底以上設(shè)定距離的果蠅數(shù)量,從而得出一個(gè)簡單的百分比。另外,還可以計(jì)算表現(xiàn)指數(shù)(performance index)。
常規(guī)果蠅攀爬試驗(yàn)的主要缺點(diǎn):
大多數(shù)實(shí)驗(yàn)室進(jìn)行的攀爬檢測操作簡單,但有一些明顯的缺點(diǎn)。該試驗(yàn)需要相對較多的蠅類(每種基因型或每種處理僅使用 100 只蠅類), 而且相同蠅類的小瓶之間存在相當(dāng)大的表現(xiàn)差異。造成這種差異的原因可能有多種,但對樣品瓶施加的 “敲擊”力和二進(jìn)制評分系統(tǒng)的差異可能是其中兩個(gè)更重要的原因。這項(xiàng)檢測還需要大量的 “動(dòng)手”時(shí)間,尤其是在采用人工計(jì)分的情況下,而且簡單的計(jì)分方法也會忽略更細(xì)微的行為指標(biāo),尤其是運(yùn)動(dòng)速度。目前已有多種簡化攀爬測定并提高其可重復(fù)性的解決方案(Kohlhoff 等人,2011 年;Liu 等人,2015 年;Podratz 等人,2013 年;Willenbrink 等人,2016 年)。每種方法都需要定制的儀器和軟件來跟蹤果蠅的運(yùn)動(dòng),而且不是為長時(shí)間跟蹤運(yùn)動(dòng)而設(shè)計(jì)的,因?yàn)樵诖似陂g可能會出現(xiàn)不同的刺激事件。
英國BFK公司的基于視頻追蹤DART系統(tǒng)可用于果蠅運(yùn)動(dòng)能力計(jì)算和測量。相對與攀爬實(shí)驗(yàn)(climbing assay),DART的要求的樣本量更少,測定的靈敏度更高。且可以用來高通量篩選神經(jīng)退行性變的遺傳和藥理調(diào)節(jié)因子。
基于 MATLAB 的開源果蠅反應(yīng)追蹤(DART)系統(tǒng)最初是為研究長期晝夜節(jié)律行為而開發(fā)的。同樣,我們可以用DART持續(xù)監(jiān)測果蠅在驚嚇反應(yīng)之前、期間和之后的水平運(yùn)動(dòng)。使用DART軟件套件在 1 小時(shí)內(nèi)多次使用振動(dòng)刺激事件,以誘發(fā)果蠅重復(fù)的 “驚嚇”反射(startle response)。 果蠅的基線運(yùn)動(dòng)和刺激后立即增加的運(yùn)動(dòng)都可以量化。
使用成年果蠅阿爾茨海默病模型(在該模型中神經(jīng)元會分泌出聚集性Aβ1-42肽),可以證明 DART 系統(tǒng)與攀登試驗(yàn)相比具有更好的性能。還可以利用 DART系統(tǒng)測試化合物或進(jìn)行基因篩選,以確定Aβ1-42誘導(dǎo)表型的調(diào)節(jié)因子。
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參考文獻(xiàn):
Continuous tracking of startled Drosophila as an alternative to the negative geotaxis climbing assay.
Matthew J. Taylor & Richard I. Tuxworth