综合图区亚洲网友自拍|亚洲黄色网络|成人无码网WWW在线观看,日本高清视频色视频kk266,激情综合五月天,欧美一区日韩一区中文字幕页

English | 中文版 | 手機(jī)版 企業(yè)登錄 | 個(gè)人登錄 | 郵件訂閱
當(dāng)前位置 > 首頁(yè) > 技術(shù)文章 > 單細(xì)胞RNA測(cè)序技術(shù)解析人類胎盤在足月分娩期間的母體-胎兒信號(hào)傳導(dǎo)

單細(xì)胞RNA測(cè)序技術(shù)解析人類胎盤在足月分娩期間的母體-胎兒信號(hào)傳導(dǎo)

瀏覽次數(shù):178 發(fā)布日期:2024-12-20  來(lái)源:本站 僅供參考,謝絕轉(zhuǎn)載,否則責(zé)任自負(fù)
期刊:Science Translational Medicine
影響因子:15.8
主要技術(shù):ScRNA-seq;足月分娩;信號(hào)傳導(dǎo)

導(dǎo)語(yǔ)
分娩是一個(gè)復(fù)雜的生理過(guò)程,需要母體和胎兒多種信號(hào)通路的精心協(xié)調(diào)。然而,在分娩過(guò)程中促進(jìn)母胎串?dāng)_的細(xì)胞貢獻(xiàn)和通訊尚未完全闡明。本研究采用單細(xì)胞RNA測(cè)序(scRNA-seq)技術(shù)來(lái)破譯足月分娩過(guò)程中人類胎盤中的母胎信號(hào)。首先,建立了人類胎盤的單細(xì)胞圖譜,證明母體和胎兒細(xì)胞類型在分娩過(guò)程中發(fā)生了轉(zhuǎn)錄組活性的變化。受分娩影響最大的細(xì)胞類型是絨毛膜(CAM)中的胎兒間質(zhì)細(xì)胞和母體蛻膜細(xì)胞以及胎盤中的母體和胎兒髓細(xì)胞。細(xì)胞-細(xì)胞相互作用分析顯示,CAM和胎盤細(xì)胞類型參與分娩驅(qū)動(dòng)的母體和胎兒信號(hào)傳導(dǎo),包括膠原蛋白、C-X-C基序配體(CXCL)、腫瘤壞死因子(TNF)、凝集素和IL-6途徑。將scRNA-seq數(shù)據(jù)與可公開(kāi)獲得的大量轉(zhuǎn)錄組學(xué)數(shù)據(jù)相結(jié)合,表明胎盤來(lái)源的scRNA-seq特征可以在整個(gè)妊娠和分娩過(guò)程中監(jiān)測(cè)母體循環(huán)。此外,比較分析顯示,足月分娩時(shí)胎盤來(lái)源的特征與自然早產(chǎn)和分娩時(shí)的特征相一致。此外,我們證明,在妊娠早期,分娩特異性胎盤來(lái)源的特征可以在注定要經(jīng)歷自發(fā)性早產(chǎn)的婦女的循環(huán)中檢測(cè)到,無(wú)論是完整的還是過(guò)早破裂的膜?偟膩(lái)說(shuō),該研究結(jié)果為人類分娩的母胎串?dāng)_提供了見(jiàn)解,并表明胎盤來(lái)源的單細(xì)胞特征可以幫助開(kāi)發(fā)用于預(yù)測(cè)早產(chǎn)的非侵入性生物標(biāo)志物。

主要技術(shù)
scRNA-seq;足月分娩;信號(hào)傳導(dǎo)

研究結(jié)果
1. 人類胎盤單細(xì)胞圖譜的建立
為了探索分娩過(guò)程中母體和胎兒之間的細(xì)胞相互作用,首先使用自然分娩(n = 24)和非自然分娩(n = 18)足月婦女的胎盤和胎盤外組織建立了一個(gè)全面的人類胎盤單細(xì)胞圖譜。胎盤在分娩后立即收獲:絨毛膜-羊膜(CAM,包括羊膜、絨毛膜和頂蛻膜)的樣本,以及包括基底膜(基底蛻膜)和胎盤絨毛(BPPV)的活檢(圖1A)。收集的CAM和BPPV用于制備單細(xì)胞懸液,然后進(jìn)行單細(xì)胞RNA測(cè)序(scRNA-seq),并在單細(xì)胞分析期間進(jìn)行母體和胎兒基因分型以確定細(xì)胞類型來(lái)源(圖1A)。無(wú)監(jiān)督聚類分析和細(xì)胞類型注釋鑒定出33個(gè)不同的簇,對(duì)應(yīng)于CAM和BPPV的免疫和非免疫細(xì)胞類型(圖1B和C)。非免疫細(xì)胞包括基質(zhì)細(xì)胞(C7)、蛻細(xì)胞(C3)、合胞滋養(yǎng)細(xì)胞(STB)、細(xì)胞滋養(yǎng)細(xì)胞(CTB, C4)、胞外滋養(yǎng)細(xì)胞(EVT,C2)、非增殖性間質(zhì)細(xì)胞滋養(yǎng)細(xì)胞(npiCTB)、EVT軌跡內(nèi)的CTB亞群(CTB/EVT)、內(nèi)皮細(xì)胞和子宮內(nèi)膜細(xì)胞(圖2)。鑒定出的免疫細(xì)胞類型有單核細(xì)胞、巨噬細(xì)胞(C4)、先天淋巴樣細(xì)胞(ILCs)、淋巴內(nèi)皮細(xì)胞(LED)細(xì)胞、NK細(xì)胞、T細(xì)胞(C3)和B細(xì)胞(圖1B和C)。每個(gè)細(xì)胞簇的細(xì)胞計(jì)數(shù)顯示了組織間細(xì)胞類型組成的差異,與BPPV相比,CAM中內(nèi)皮細(xì)胞(C14和23)、基質(zhì)細(xì)胞(C0、2、8、15和22)和個(gè)體細(xì)胞類型(C10、12和17)更為豐富。淋巴樣細(xì)胞組成在不同細(xì)胞間無(wú)明顯差異(圖1B和C)。相比之下,髓系細(xì)胞在BPPV中更占優(yōu)勢(shì)(圖1B和C);|(zhì)-4和基質(zhì)-6(C20和27)主要存在于BPPV中(圖1B和C)。正如預(yù)期的那樣,除了EVT-1(C1)外,BPPV中多種滋養(yǎng)細(xì)胞類型更為明顯,EVT-1在CAM中更為豐富(圖1B、C)。

在確定CAM和BPPV細(xì)胞組成的變化后,我們隨后使用基因分型信息來(lái)確定所有鑒定細(xì)胞的母體和/或胎兒來(lái)源(圖1D和E)。CAM和BPPV中的滋養(yǎng)細(xì)胞來(lái)自胎兒(圖1D和E), CAM中的大部分基質(zhì)細(xì)胞也來(lái)自胎兒(圖1D)。如預(yù)期的那樣,蛻細(xì)胞來(lái)自母體,而內(nèi)皮細(xì)胞、淋巴細(xì)胞和髓細(xì)胞類型在CAM和BPPV中顯示混合的母體和胎兒來(lái)源(圖1D和E)?傊,這些數(shù)據(jù)提供了分娩時(shí)人類胎盤的全面單細(xì)胞景觀,表明在CAM中受影響最大的細(xì)胞類型是胎兒間質(zhì)細(xì)胞,而在BPPV中受影響最大的是CTB和胎兒巨噬細(xì)胞。
 

圖 1

2. 母體和胎兒細(xì)胞類型顯示運(yùn)動(dòng)驅(qū)動(dòng)的轉(zhuǎn)錄組活性
接下來(lái),我們探索了CAM和BPPV中由運(yùn)動(dòng)驅(qū)動(dòng)的細(xì)胞類型特異性轉(zhuǎn)錄組變化(圖2A)。在CAM中,胎兒Stromal-1、Stromal-2和Stromal-3表現(xiàn)出最大的運(yùn)動(dòng)驅(qū)動(dòng)差異基因表達(dá)變化(圖2A)。母體蛻膜-1細(xì)胞也顯示出相當(dāng)數(shù)量的差異表達(dá)基因(DEGs);然而,與胎兒間質(zhì)細(xì)胞相比,這種變化是溫和的(圖2A)。在BPPV細(xì)胞類型中,DEGs數(shù)量最多的主要是母體單核細(xì)胞類型,其次是胎兒巨噬細(xì)胞-2,可能分別對(duì)應(yīng)浸潤(rùn)性炎癥單核細(xì)胞和Hofbauer細(xì)胞(圖2A)。分位數(shù)-分位數(shù)圖顯示了CAM和BPPV中受胎兒和母體影響最大的細(xì)胞類型(圖2B),這與表現(xiàn)出最大差異基因表達(dá)的細(xì)胞類型基本一致。值得注意的是,在CAM中發(fā)現(xiàn)胎兒間質(zhì)細(xì)胞類型受到分娩的影響,母體蛻細(xì)胞也是如此(圖2B)。同樣,母體單核細(xì)胞和胎兒巨噬細(xì)胞-2在BPPV中受分娩影響最大(圖2B)。分娩對(duì)細(xì)胞類型間基因表達(dá)影響的相關(guān)性分析表明,母體骨髓細(xì)胞、蛻膜細(xì)胞和胎兒間質(zhì)細(xì)胞等存在相似之處(圖2C)。胎兒基質(zhì)亞群中,基質(zhì)-1表達(dá)凋亡信號(hào),基質(zhì)-2表達(dá)ATP代謝,基質(zhì)-3表達(dá)炎癥反應(yīng),包括細(xì)胞因子的產(chǎn)生(圖2D),表明這些胎兒基質(zhì)亞群在分娩過(guò)程中具有不同的功能。此外,母體decidual -1顯示了與細(xì)胞運(yùn)動(dòng)和遷移相關(guān)的過(guò)程的富集(圖2D),這表明decidual細(xì)胞參與了分娩過(guò)程中的白細(xì)胞浸潤(rùn)。

這些數(shù)據(jù)為產(chǎn)婦和胎兒細(xì)胞類型的分娩特異性轉(zhuǎn)錄組活性提供了進(jìn)一步的見(jiàn)解,特別是那些基因表達(dá)發(fā)生實(shí)質(zhì)性變化的細(xì)胞,如CAM中的結(jié)構(gòu)細(xì)胞和BPPV中的免疫細(xì)胞。此外,我們證明了在分娩過(guò)程中,細(xì)胞遷移和增殖、白細(xì)胞募集和細(xì)胞因子/趨化因子信號(hào)通路的細(xì)胞類型特異性富集。最具代表性的細(xì)胞類型,如滋養(yǎng)細(xì)胞,在勞動(dòng)過(guò)程中沒(méi)有經(jīng)歷基因表達(dá)的劇烈變化,這表明更多的轉(zhuǎn)錄活躍亞群,而不是更豐富的亞群,是勞動(dòng)相關(guān)信號(hào)的主要貢獻(xiàn)者。
 


圖 2

3. 分娩過(guò)程包括由母體-胎兒細(xì)胞-細(xì)胞串?dāng)_協(xié)調(diào)的炎癥通路
在確定了受分娩影響最大的母胎細(xì)胞類型后,我們?cè)噲D使用cellchat推斷CAM中母胎串?dāng)_的最終變化(圖3)和BPPV(圖4)。我們首先可視化CAM細(xì)胞類型的傳入和傳出相互作用,其中每個(gè)箭頭的方向和長(zhǎng)度分別表示傳入或傳出相互作用的運(yùn)動(dòng)驅(qū)動(dòng)優(yōu)勢(shì)及其強(qiáng)度,如相應(yīng)的圖例所示(圖3A)。胎兒間質(zhì)細(xì)胞類型在輸入和輸出的相互作用中都表現(xiàn)出最強(qiáng)的增加(用箭頭的長(zhǎng)度表示),暗示這些細(xì)胞是CAM中運(yùn)動(dòng)相關(guān)信號(hào)傳導(dǎo)的關(guān)鍵參與者(圖3A)。相比之下,母體T細(xì)胞、NK細(xì)胞和蛻細(xì)胞的相互作用減弱(圖3A)。這種相互作用強(qiáng)度分析提供了關(guān)于哪些細(xì)胞在勞動(dòng)過(guò)程中發(fā)生了輸出和/或輸入信號(hào)的變化的信息,但沒(méi)有告訴我們這些信號(hào)的細(xì)胞靶點(diǎn)或來(lái)源。因此,我們接下來(lái)將每種細(xì)胞類型視為信號(hào)發(fā)送者或接收者,并評(píng)估細(xì)胞類型對(duì)之間的相互作用強(qiáng)度,如圖熱圖所示(圖3B和圖3C)。胎兒基質(zhì)細(xì)胞類型表現(xiàn)出與分娩相關(guān)的強(qiáng)相互作用,以及作為發(fā)送者或接受者的非免疫細(xì)胞和免疫細(xì)胞(圖3B和C)。此外,多種基質(zhì)細(xì)胞類型表現(xiàn)出自我信號(hào)傳導(dǎo),表明與分娩有關(guān)的正反饋循環(huán)(圖3C)。與箭頭圖一致,母體CD4 T細(xì)胞的傳入信號(hào)隨著分娩而減弱(圖3B)。考慮到CAM中分娩特異性細(xì)胞-細(xì)胞信號(hào)的實(shí)質(zhì)性變化,我們隨后選擇了受分娩影響的特定信號(hào)通路,以推斷出最重要的細(xì)胞類型(圖3D-F),這可能表明他們參與了與分娩相關(guān)的CAM結(jié)構(gòu)變化。C-X-C基序配體(CXCL)信號(hào)通路主要由母體蛻膜-3、巨噬細(xì)胞-2和巨噬細(xì)胞-1細(xì)胞類型驅(qū)動(dòng),許多相互作用指向胎兒EVT-1亞群以及其他胎兒和母體細(xì)胞類型(圖3E),表明母體蛻膜細(xì)胞和胎兒滋養(yǎng)細(xì)胞之間存在母胎串?dāng)_。母體單核細(xì)胞和巨噬細(xì)胞-1類型驅(qū)動(dòng)TNF信號(hào)傳導(dǎo),可能導(dǎo)致分娩相關(guān)炎癥(圖3F)。


在BPPV中,在胎兒基質(zhì)細(xì)胞類型中再次觀察到細(xì)胞-細(xì)胞相互作用中最強(qiáng)的運(yùn)動(dòng)相關(guān)變化,基質(zhì)-1/基質(zhì)-3主要表現(xiàn)出增加的入射相互作用強(qiáng)度,基質(zhì)-2/基質(zhì)-4主要表現(xiàn)出增加的外向相互作用強(qiáng)度(圖4A)。相比之下,胎兒CD4 T細(xì)胞、巨噬細(xì)胞-2和CTB-3亞群與分娩的相互作用強(qiáng)度下降(圖4A);這些結(jié)果反映在熱圖中,胎兒基質(zhì)-2亞群顯示出與免疫細(xì)胞作為受體的外向相互作用強(qiáng)度增加(圖4B),這主要與炎癥反應(yīng)有關(guān)。

與箭頭圖一致,網(wǎng)絡(luò)圖表明胎兒間質(zhì)細(xì)胞類型表現(xiàn)出更強(qiáng)的傳入或傳出相互作用(圖4C)。受分娩影響的top細(xì)胞-細(xì)胞信號(hào)通路包括凝集素、TNF、IL-6、CCL、CD45、II型干擾素(IFN-II)和補(bǔ)體,用網(wǎng)絡(luò)圖表示(圖4D-F)。凝集素通路的一個(gè)關(guān)鍵參與者是母體巨噬細(xì)胞-1,它與母體和胎兒?jiǎn)魏思?xì)胞以及母體T細(xì)胞相互作用(圖4D)。相比之下,BPPV中TNF和IL-6信號(hào)的主要貢獻(xiàn)者分別是胎兒巨噬細(xì)胞-2和基質(zhì)-3(圖4E和F),進(jìn)一步表明胎兒對(duì)分娩相關(guān)的細(xì)胞-細(xì)胞相互作用有很強(qiáng)的貢獻(xiàn)。綜上所述,這些細(xì)胞相互作用分析表明,分娩的特點(diǎn)是母體-胎兒信號(hào)通路,涉及免疫和非免疫細(xì)胞類型之間的細(xì)胞-細(xì)胞串?dāng)_。
 


圖 3

圖 4

4. 來(lái)自胎盤組織的單細(xì)胞母體和胎兒特征可以在整個(gè)妊娠和分娩期間在母體循環(huán)中被監(jiān)測(cè)
接下來(lái),我們?cè)u(píng)估了細(xì)胞類型特異性轉(zhuǎn)錄組活性是否可以在整個(gè)妊娠期間跟蹤母體循環(huán)。我們首先利用先前生成的孕婦外周血(白細(xì)胞)的大量轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)集(n = 49)收集整個(gè)妊娠期,并評(píng)估細(xì)胞類型特異性轉(zhuǎn)錄物的軌跡(圖5A)。多種細(xì)胞類型特征隨胎齡變化而變化;即巨噬細(xì)胞-1、巨噬細(xì)胞-2、巨噬細(xì)胞-3、巨噬細(xì)胞-4、CD4 T細(xì)胞、CD8 T細(xì)胞、B細(xì)胞、基質(zhì)-2、基質(zhì)-3、基質(zhì)-4、基質(zhì)-5、基質(zhì)-7、蛻膜-1、內(nèi)皮細(xì)胞、LED、npiCTB、EVT-2和STB(圖5B)。觀察到的變化模式在特定細(xì)胞類型的單個(gè)集群之間不一致;例如,巨噬細(xì)胞-1隨著胎齡穩(wěn)步增加,巨噬細(xì)胞-2和巨噬細(xì)胞-3則隨著胎齡穩(wěn)步增加。巨噬細(xì)胞-4呈拋物線軌跡(圖5B),提示每種細(xì)胞類型簇的不同作用?紤]到細(xì)胞類型特征可以在母體外周血中追蹤,我們隨后評(píng)估了在同一組患者中進(jìn)行縱向分析的足月分娩婦女(n = 21)和足月分娩婦女(n = 28)足月收集的樣本之間的差異(圖6A)。為了比較這些數(shù)據(jù)集,使用CAM 衍生的DEG來(lái)創(chuàng)建一個(gè)偽體數(shù)據(jù)集,該數(shù)據(jù)集可以直接與大量轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)集進(jìn)行對(duì)比,同時(shí)仍然考慮每種細(xì)胞類型的母源或胎兒來(lái)源(圖6A)。CAM與母體外周血細(xì)胞類型特異性轉(zhuǎn)錄本的相關(guān)性表明,胎兒基質(zhì)-2以及母體巨噬細(xì)胞-1、巨噬細(xì)胞-2、蛻膜細(xì)胞-1和單核細(xì)胞呈正相關(guān)(圖6B)。相比之下,幾種細(xì)胞類型特征顯示CAM與母體外周血呈負(fù)相關(guān):胎兒EVT-2、母體CD8 T細(xì)胞和母體內(nèi)皮細(xì)胞(圖6B)。當(dāng)使用來(lái)自BPPV的細(xì)胞類型特征時(shí),我們注意到該組織與母體外周血之間的額外相關(guān)性(圖6C)。胎兒EVT-1、CTB-1、巨噬細(xì)胞-2、CD4 T細(xì)胞、CTB-3、STB和npiCTB在室間都顯示出正相關(guān),母體巨噬細(xì)胞-1、巨噬細(xì)胞-2、單核細(xì)胞和蛻膜細(xì)胞-2也是如此(圖6C)。胎兒基質(zhì)-1以及胎兒和母體NK細(xì)胞的特征在BPPV和母體外周血之間呈負(fù)相關(guān)(圖6C)。這一比較分析支持了胎盤細(xì)胞進(jìn)入母體循環(huán)和/或分娩相關(guān)信號(hào)驅(qū)動(dòng)外周白細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組變化的概念,這些外周白細(xì)胞的轉(zhuǎn)錄組變化至少部分與胎盤組織中的轉(zhuǎn)錄組變化相同。我們的數(shù)據(jù)進(jìn)一步表明,可以無(wú)創(chuàng)地跟蹤母胎信號(hào),以監(jiān)測(cè)正常妊娠和分娩,并可能用于生成產(chǎn)科疾病的生物標(biāo)志物。
 


圖 5


圖 6

6. 足月分娩相關(guān)的母胎單細(xì)胞特征在CAM中部分與自然早產(chǎn)婦女的特征重疊
我們的研究結(jié)果表明,隨著分娩,CAM的轉(zhuǎn)錄組活性似乎經(jīng)歷了更劇烈的細(xì)胞類型特異性變化(圖2A),這與這些組織參與分娩的共同途徑是一致的。雖然被認(rèn)為是一種不同于足月分娩的病理過(guò)程,但自發(fā)性早產(chǎn)也包括激活常見(jiàn)的分娩途徑。因此,我們下一步評(píng)估是否在自發(fā)性早產(chǎn)和分娩的婦女組織中也觀察到與產(chǎn)程相關(guān)的CAM基因表達(dá)變化(產(chǎn)程與PTL)。為此,我們利用了以前CAM的大量轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)集。來(lái)自經(jīng)羊膜穿刺術(shù)診斷羊膜腔炎癥和微生物狀態(tài)不同的早產(chǎn)和自發(fā)性早產(chǎn)婦女:無(wú)羊膜內(nèi)炎癥[低濃度IL-6 (<2.6 ng/mL),通過(guò)培養(yǎng)和分子微生物方法檢測(cè)不到微生物](PTL, n = 12);無(wú)菌羊膜內(nèi)炎癥[IL-6濃度升高(≥2.6 ng/mL),未檢出微生物](PTL+SIAI, n = 17);或羊膜內(nèi)感染(IL-6濃度升高,可檢測(cè)微生物)(PTL+IAI, n = 11)(85-92)(圖7A)。為了獲得細(xì)胞類型特異性PTL相關(guān)的變化,將各組CAM的大量轉(zhuǎn)錄組譜與對(duì)照組[經(jīng)歷過(guò)自發(fā)性早產(chǎn)但足月分娩的婦女(n = 15)]進(jìn)行比較(圖7A)。在CAM中,產(chǎn)期相關(guān)特征與胎兒Stromal-1、Stromal-3、Stromal-5、Stromal-7、EVT-1和CTB/EVT的PTL特征呈正相關(guān)(圖7B)。母體蛻細(xì)胞類型和巨噬細(xì)胞對(duì)應(yīng)的特征在產(chǎn)程和PTL之間也觀察到適度的正相關(guān)。足月產(chǎn)程與PTL+SIAI呈正相關(guān);即EVT-1、CTB/EVT和基質(zhì)細(xì)胞類型,而其余的僅顯示輕微或最小的正相關(guān)(圖7B)。因此,我們的研究結(jié)果表明,在足月分娩的生理過(guò)程中,CAM中的母胎信號(hào)與自發(fā)性早產(chǎn)時(shí)觀察到的信號(hào)重疊;然而,羊膜腔的炎癥和微生物狀態(tài)驅(qū)動(dòng)母胎細(xì)胞類型的特異性轉(zhuǎn)錄組活性。
 


圖 7

7. 分娩相關(guān)的單細(xì)胞CAM衍生的特征可以作為非侵入性生物標(biāo)志物來(lái)識(shí)別要經(jīng)歷自發(fā)性早產(chǎn)的婦女
我們最后試圖確定在最終發(fā)生早產(chǎn)的婦女的外周血中,是否可以在妊娠中期和晚期追蹤分娩特異性CAM衍生的scRNA-seq特征,這可能會(huì)為即將發(fā)生的早產(chǎn)產(chǎn)生預(yù)測(cè)性生物標(biāo)志物。首先,我們使用了之前從橫斷面研究中生成的大量轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)集,包括來(lái)自以下人群的外周血樣本:1)經(jīng)歷過(guò)自發(fā)性早產(chǎn)和早產(chǎn)的婦女(病例);2)足月分娩的胎齡匹配的對(duì)照組。大量轉(zhuǎn)錄組的主成分分析顯示,病例(紅點(diǎn))與對(duì)照組(藍(lán)點(diǎn))有一定程度的分離,這似乎是由PC2驅(qū)動(dòng)的。然后,我們將分娩特異性CAM衍生的scRNA-seq特征與母體血液轉(zhuǎn)錄組疊加,并評(píng)估每種細(xì)胞類型對(duì)PC1和PC2的貢獻(xiàn)和相關(guān)性。所有細(xì)胞類型均參與PC1;單核細(xì)胞、LED和基質(zhì)細(xì)胞類型與PC2呈正相關(guān),而NK細(xì)胞、CD8 T細(xì)胞和巨噬細(xì)胞-3與PC2呈負(fù)相關(guān)。通過(guò)建立個(gè)體單細(xì)胞特征的受試者工作特征(ROC)曲線,我們發(fā)現(xiàn)其中一些(如母體蛻膜-2)對(duì)于識(shí)別最終發(fā)生早產(chǎn)的早產(chǎn)婦女具有價(jià)值。

接下來(lái),我們?cè)噲D利用我們的分娩特異性CAM衍生的scRNA-seq特征在妊娠中期和晚期(在早產(chǎn)發(fā)作的臨床表現(xiàn)之前)收集的母親血液樣本中預(yù)測(cè)兩種不同的自發(fā)性早產(chǎn)亞群(自發(fā)性胎膜完整早產(chǎn)(sPTL)和早產(chǎn)胎膜破裂(PPROM))。我們利用了先前從一項(xiàng)前瞻性大量轉(zhuǎn)錄組學(xué)研究中生成的數(shù)據(jù)集,包括兩個(gè)外部驗(yàn)證隊(duì)列,這些數(shù)據(jù)來(lái)自妊娠17至33周最終接受sPTL或PPROM的婦女的外周血(圖8A)。通過(guò)比較從最終經(jīng)歷早產(chǎn)的婦女和胎齡匹配的足月分娩的對(duì)照者收集的血液樣本之間的基因表達(dá)譜,獲得了sPTL和PPROM相關(guān)的轉(zhuǎn)錄組活性。這種與sPTL和PPROM相關(guān)的轉(zhuǎn)錄組活性隨后與本研究中產(chǎn)生的運(yùn)動(dòng)特異性CAM衍生的scRNA-seq特征相關(guān)(圖8A)。在最終接受sPTL或PPROM的婦女的血液循環(huán)中,強(qiáng)烈檢測(cè)到幾種分娩特異性CAM衍生的scRNA-seq特征(圖8B)。母體和胎兒來(lái)源的多個(gè)分娩特異性CAM衍生的scRNA-seq特征-最突出的是母體蛻膜細(xì)胞-1和胎兒基質(zhì)細(xì)胞類型-與PPROM相關(guān)的轉(zhuǎn)錄組活性顯示出很強(qiáng)的正相關(guān)(>0.10相關(guān)系數(shù)),相關(guān)強(qiáng)度根據(jù)采樣時(shí)間點(diǎn)而變化(圖8B)。母體巨噬細(xì)胞類型與胎兒其他非免疫細(xì)胞類型也觀察到中度正相關(guān)(>0.05)(圖8B)。足月分娩和sPTL相關(guān)轉(zhuǎn)錄組活性之間的相關(guān)性強(qiáng)度低于PPROM;然而,母體蛻膜細(xì)胞-1和胎兒基質(zhì)細(xì)胞類型也是主要的貢獻(xiàn)者(圖8B)。來(lái)自母體巨噬細(xì)胞-2和胎兒EVT-1的實(shí)驗(yàn)室特異性CAM衍生的scRNA-seq特征與PPROM和sPTL相關(guān)的轉(zhuǎn)錄組活性呈負(fù)相關(guān)。

然后,我們?yōu)槊總(gè)驗(yàn)證隊(duì)列生成ROC曲線,并根據(jù)采樣時(shí)的胎齡來(lái)確定這些特征對(duì)sPTL或PPROM的預(yù)測(cè)程度。對(duì)于即將發(fā)生的sPTL的預(yù)測(cè),與隊(duì)列2相比,使用隊(duì)列1的樣本時(shí),母體Decidual-1特征顯示出更大的價(jià)值,與這些患者是否在17 - 23歲時(shí)采樣無(wú)關(guān)[隊(duì)列1:AUC為0.648 (0.503-0.794)vs隊(duì)列2:AUC 0.536(0.389-0.683)或27 - 33[隊(duì)列1:AUC 0.602 (0.454-0.750) vs;隊(duì)列2:AUC 0.497(0.321-0.674)]妊娠周(圖8C)。相比之下,對(duì)于PPROM,隊(duì)列2在妊娠17 - 23周[隊(duì)列2:AUC 0.612 (0.493-0.731) vs隊(duì)列1:AUC 0.564(0.429-0.699)]和27 - 33周[隊(duì)列2:AUC 0.654 (0.533-0.775) vs隊(duì)列1:AUC 0.610(0.476-0.745)]時(shí)的母體Decidual-1特征的預(yù)測(cè)值略有提高(圖8C)。隊(duì)列之間表現(xiàn)的差異可能是由于納入的人群不同(隊(duì)列1來(lái)自美國(guó)密歇根州的底特律,隊(duì)列2來(lái)自加拿大阿爾伯塔省的卡爾加里)。母體decual -1特征對(duì)PPROM的預(yù)測(cè)價(jià)值在孕晚期略有增加[隊(duì)列1,27 - 33周:AUC 0.610 (0.476-0.745) vs隊(duì)列1,17 - 23周:AUC 0.564 (0.429-0.699);隊(duì)列2,27 - 33周:AUC 0.654 (0.533-0.775) vs隊(duì)列2,17 Ga- 23周:AUC 0.612(0.493-0.731)],表明采樣和結(jié)果預(yù)測(cè)之間的時(shí)間縮短。胎兒基質(zhì)-1信號(hào)對(duì)sPTL的預(yù)測(cè)比對(duì)PPROM的預(yù)測(cè)更明顯;然而,與27 - 33周的sPTL相比,其預(yù)測(cè)性能在17 - 23周有所改善[隊(duì)列1,17 - 23周:AUC 0.623 (0.483-0.764) vs隊(duì)列1,27 - 33周:AUC 0.559 (0.416-0.703);隊(duì)列2,17 - 23周:AUC 0.559 (0.408-0.710) vs隊(duì)列2,27 - 33周:AUC 0.518(0.324-0.711)(圖8D)。對(duì)于PPROM,隊(duì)列2的胎兒基質(zhì)-1特征的預(yù)測(cè)性能在兩個(gè)采樣時(shí)間都得到了改善[隊(duì)列2,17 - 23周:AUC 0.665(0.561-0.769)與隊(duì)列1,17 - 23周:AUC 0.579 (0.445-0.712);隊(duì)列2,27 - 33周:AUC 0.633 (0.518-0.748) vs隊(duì)列1,27 - 33周:AUC 0.618(0.489-0.747)(圖8D)。這一概念驗(yàn)證分析表明,在母體循環(huán)中追蹤相關(guān)的單細(xì)胞特征可能提供一種預(yù)測(cè)即將發(fā)生的sPTL或PPROM的方法。
 


圖 8

結(jié)論
在這里,我們應(yīng)用scRNA-seq技術(shù)發(fā)現(xiàn),基底膜、胎盤絨毛和絨毛膜羊膜包括母體和胎兒起源的免疫和非免疫細(xì)胞類型,但細(xì)胞組成不同。先前對(duì)胎盤組織的單細(xì)胞調(diào)查提供了妊娠早期、妊娠中期和妊娠晚期的細(xì)胞組成概述,并允許鑒定先前未描述的細(xì)胞類型。我們的數(shù)據(jù)進(jìn)一步強(qiáng)調(diào)了胎盤和胎盤外(絨毛膜和羊膜)組織之間的細(xì)胞類型組成和相對(duì)豐度的差異,這是由它們不同的功能驅(qū)動(dòng)的。事實(shí)上,對(duì)妊娠中期絨毛(胎盤)絨毛膜和平滑(胎盤外)絨毛膜的比較分析表明,特定細(xì)胞類型(如基質(zhì)細(xì)胞)的豐度不同,以及相似細(xì)胞簇之間空間依賴性功能差異。

在懷孕不同時(shí)期的單細(xì)胞探索清楚地表明,這些隔室的細(xì)胞組成不是靜態(tài)的,而是在整個(gè)懷孕期間經(jīng)歷動(dòng)態(tài)變化。在這里,我們發(fā)現(xiàn),與胎盤組織相比,絨毛膜羊膜顯示出更多受分娩高度調(diào)節(jié)的細(xì)胞類型,這與膜激活作為分娩共同途徑的重要組成部分的參與是一致的。絨毛膜羊膜中受分娩影響最顯著的細(xì)胞群是胎兒間質(zhì)細(xì)胞、母體蛻膜細(xì)胞和母體巨噬細(xì)胞。研究了蛻細(xì)胞和母體巨噬細(xì)胞在分娩過(guò)程中的參與;然而,胎兒間質(zhì)細(xì)胞在分娩中的作用尚未得到很好的證實(shí)。數(shù)據(jù)而本項(xiàng)目表明胎兒間質(zhì)細(xì)胞在分娩過(guò)程中具有高度活躍的作用,值得進(jìn)一步研究。此外,我們報(bào)道了胎盤組織中受分娩影響最大的細(xì)胞類型是胎兒巨噬細(xì)胞和母體單核細(xì)胞。目前的證據(jù)表明,這些細(xì)胞主要表現(xiàn)為m2樣表型,與母體細(xì)胞相似,這暗示了它們?cè)谡H焉镏械姆(wěn)態(tài)作用。分娩過(guò)程中胎兒巨噬細(xì)胞參與炎癥信號(hào)通路可能表明,這些細(xì)胞在分娩過(guò)程中經(jīng)歷了向促炎表型的轉(zhuǎn)變,這是正常分娩過(guò)程的一部分,正如母體蛻膜中存在的巨噬細(xì)胞所證明的那樣。胎盤組織中檢測(cè)到的母體單核細(xì)胞群可能代表存在于絨毛間隙的循環(huán)細(xì)胞。

胎盤組織脫落細(xì)胞外囊泡、顆粒和其他碎片進(jìn)入母體循環(huán)。由于這種脫落,母體循環(huán)已被證明是具有診斷潛力的無(wú)細(xì)胞DNA和RNA的來(lái)源,并且母體外周血中的標(biāo)記物可用于監(jiān)測(cè)妊娠和分娩。在這里,我們利用這一概念來(lái)監(jiān)測(cè)和潛在的預(yù)測(cè)病理性分娩(如早產(chǎn))。在沒(méi)有羊膜內(nèi)炎癥的情況下,足月分娩和早產(chǎn)之間的正相關(guān)性涉及廣泛的細(xì)胞類型。沒(méi)有羊膜內(nèi)炎癥的早產(chǎn)通常被認(rèn)為是特發(fā)性的,因此這個(gè)研究組可能包括多種潛在的機(jī)制。事實(shí)上,我們之前的工作已經(jīng)暗示巨噬細(xì)胞激活是特發(fā)性早產(chǎn)和出生的潛在免疫機(jī)制。相比之下,早產(chǎn)合并羊膜內(nèi)炎癥的病例似乎涉及相似的細(xì)胞類型,無(wú)論無(wú)菌或微生物性質(zhì);|(zhì)細(xì)胞和巨噬細(xì)胞都是已知的宿主對(duì)病原體反應(yīng)的參與者。母體巨噬細(xì)胞的正相關(guān)性可能反映了急性組織學(xué)絨毛膜羊膜炎的存在,這是一種胎盤病變,是由于微生物侵入羊膜腔時(shí),先天免疫細(xì)胞浸潤(rùn)到絨毛膜羊膜引起的。這些結(jié)果表明,生理性分娩婦女的CAM轉(zhuǎn)錄組學(xué)變化與自然早產(chǎn)婦女的CAM轉(zhuǎn)錄組學(xué)變化重疊;然而,如前所述,羊膜腔的炎癥和微生物狀態(tài)也會(huì)驅(qū)動(dòng)胎盤轉(zhuǎn)錄組活性。

本文包括的自發(fā)性早產(chǎn)的兩個(gè)亞群,sPTL和PPROM,涉及不同的疾病機(jī)制和臨床管理,因此它們的預(yù)測(cè)和預(yù)防需要單獨(dú)的研究。事實(shí)上,我們注意到sPTL和PPROM之間明顯的失調(diào)模式,至少部分取決于采樣窗口。具體來(lái)說(shuō),最終接受PPROM的女性與接受sPTL的女性相比,表現(xiàn)出更強(qiáng)的運(yùn)動(dòng)特異性細(xì)胞類型特征正相關(guān)。盡管如此,我們發(fā)現(xiàn)這兩個(gè)亞群共享基質(zhì)和蛻膜特征,進(jìn)一步證實(shí)了導(dǎo)致早產(chǎn)的共同分娩途徑。在妊娠中期,最終發(fā)生自發(fā)性早產(chǎn)的婦女表現(xiàn)出特定特征的失調(diào),主要是母體蛻膜細(xì)胞,這與蛻膜時(shí)鐘的概念一致。此外,我們的研究結(jié)果強(qiáng)調(diào)了兩個(gè)關(guān)鍵事實(shí):首先,sPTL和PPROM的潛在機(jī)制涉及不同細(xì)胞類型特征的改變,這可能使它們能夠使用預(yù)測(cè)模型進(jìn)行區(qū)分;其次,在未來(lái)的研究中考慮sPTL和PPROM之間的差異是很重要的,因?yàn)檫@些亞群的組合可能會(huì)降低檢測(cè)特定生物標(biāo)志物的能力。重要的是,這些結(jié)果表明用于預(yù)測(cè)建模的最佳單細(xì)胞特征可能在sPTL和PPROM之間有所不同,進(jìn)一步支持早產(chǎn)綜合征的多病因性質(zhì)。

總之,本文的研究結(jié)果為足月分娩期間母胎信號(hào)和串?dāng)_提供了新的見(jiàn)解。我們的研究結(jié)果強(qiáng)調(diào)了單細(xì)胞技術(shù)在揭示人類胎盤分娩過(guò)程中涉及的新細(xì)胞類型和信號(hào)通路方面的實(shí)用性,并表明胎盤來(lái)源的單細(xì)胞特征在開(kāi)發(fā)非侵入性生物標(biāo)志物方面的潛在應(yīng)用。

參考文獻(xiàn):
Garcia-Flores V, Romero R, Tarca AL, Peyvandipour A, Xu Y, Galaz J, Miller D, Chaiworapongsa T, Chaemsaithong P, Berry SM, Awonuga AO, Bryant DR, Pique-Regi R, Gomez-Lopez N. Deciphering maternal-fetal cross-talk in the human placenta during parturition using single-cell RNA sequencing. Sci Transl Med. 2024 Jan 10;16(729):eadh8335. doi: 10.1126/scitranslmed.adh8335. Epub 2024 Jan 10. PMID: 38198568; PMCID: PMC11238316.

來(lái)源:上海伯豪生物技術(shù)有限公司
聯(lián)系電話:021-58955370
E-mail:market@shbio.com

用戶名: 密碼: 匿名 快速注冊(cè) 忘記密碼
評(píng)論只代表網(wǎng)友觀點(diǎn),不代表本站觀點(diǎn)。 請(qǐng)輸入驗(yàn)證碼: 8795
Copyright(C) 1998-2024 生物器材網(wǎng) 電話:021-64166852;13621656896 E-mail:info@bio-equip.com