文獻(xiàn)來源:Schneider CV, Schneider KM, Teumer A, et al. Association of Telomere Length With Risk of Disease and Mortality. JAMA Intern Med. 2022;182(3):291–300. doi:10.1001/jamainternmed.2021.7804
UK Biobank端粒科普
UK Biobank科普
翼和生物在第二篇推文中,曾經(jīng)介紹了UKB的有關(guān)端粒方法學(xué)的文章,本篇文章是同一作者發(fā)表。
關(guān)于端粒
端粒是位于染色體末端的核蛋白復(fù)合物,每次細(xì)胞分裂時(shí)都會縮短,并在維持染色體完整性方面發(fā)揮關(guān)鍵作用。
端粒長度(TL)是可遺傳的,但對其遺傳決定因素的理解并不完整。由于端粒調(diào)節(jié)基因中的罕見突變,端粒的極端縮短會導(dǎo)致早衰綜合征。相比之下個(gè)體之間的端粒長度(TL)差異與某些癌癥、冠心病等以及其他與年齡相關(guān)的常見疾病有關(guān)。
人們對較短的端粒長度(TL)作為生物年齡的標(biāo)志物非常感興趣,但現(xiàn)在看來TL與疾病之間的關(guān)系是復(fù)雜的,因?yàn)檩^短的TL和較長的TL,都與年齡相關(guān)疾病的高風(fēng)險(xiǎn)有關(guān)。人群隊(duì)列的生物庫,提供深入了解TL的遺傳結(jié)構(gòu)與生物醫(yī)學(xué)表型聯(lián)系的機(jī)會。
翼和生物的定量PCR法是檢測端粒長度的經(jīng)典技術(shù),用時(shí)短,操作簡單,結(jié)果準(zhǔn)確,適用于批量樣本檢測。
本文研究概述
研究流程
本文中,作者研究了白細(xì)胞端粒長度(LTL)在人群中的自然變異遺傳特性,并在50萬人的群體中找出了白細(xì)胞端粒長度(LTL)與生物醫(yī)學(xué)表型之間的關(guān)系。作者找出了197個(gè)與白細(xì)胞端粒長度(LTL)相關(guān)的基因組變異,它們分布在138個(gè)基因座上。這些基因座有108個(gè)是本文新發(fā)現(xiàn)的。這些變異和基因座與許多生物特征疾病有關(guān),包括身高、骨髓功能、腫瘤、血管和炎癥病理等。
最后,作者研究發(fā)現(xiàn),當(dāng)一個(gè)人40歲時(shí),如果他的白細(xì)胞端粒長度(LTL)比普通人短1個(gè)標(biāo)準(zhǔn)差,他的預(yù)期壽命就會比那些白細(xì)胞端粒長度長的人少2.5年。總的來說,作者的研究讓我們更深入地了解了LTL的遺傳調(diào)控,揭示了白細(xì)胞端粒長度對生理特征、疾病和壽命的各種影響,并為全球的研究人員提供了有價(jià)值的研究資源。
研究結(jié)果
遺傳相關(guān)位點(diǎn):這項(xiàng)研究對50萬人端粒長度和2千萬變異位點(diǎn),進(jìn)行了全基因組關(guān)聯(lián)分析,發(fā)現(xiàn)了197個(gè)變異與白細(xì)胞端粒長度(LTL)相關(guān)。
eQTL信號:通過基因功能、變異注釋與共表達(dá)分析,論文提供了114個(gè)相關(guān)的候選基因。
生物醫(yī)學(xué)性狀: 通過孟德爾隨機(jī)分析,作者發(fā)現(xiàn)了16種疾病與白細(xì)胞端粒長度(LTL)的遺傳決定有關(guān)。
死亡與端粒長度:在40歲時(shí),白細(xì)胞端粒長度(LTL)比人群平均值短1個(gè)標(biāo)準(zhǔn)差,人類預(yù)期壽命比LTL長≥1個(gè)標(biāo)準(zhǔn)差低2.5年。
Group1為端粒長度低于平均值1個(gè)標(biāo)準(zhǔn)差以上的志愿者
Group2為端粒長度低于平均值1個(gè)標(biāo)準(zhǔn)差以內(nèi)的志愿者
Group3為端粒長度高于平均值1個(gè)標(biāo)準(zhǔn)差以內(nèi)的志愿者
本文提示
在群體水平上,端粒的長短可以通過大樣本的統(tǒng)計(jì)學(xué)檢驗(yàn),確認(rèn)是與疾病有關(guān)的生物指標(biāo)。個(gè)體端粒的長短,可以定期通過端粒檢測觀察端粒長度的變化。