酵母表達(dá)服務(wù)技術(shù)流程介紹
瀏覽次數(shù):706 發(fā)布日期:2023-8-14
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酵母表達(dá)是指通過(guò)基因克隆技術(shù),將外源目的基因構(gòu)建到表達(dá)載體上,并轉(zhuǎn)化至酵母細(xì)胞中進(jìn)行穩(wěn)定表達(dá),從而獲得大量目的蛋白的方法。通過(guò)查閱相關(guān)文獻(xiàn)資料,本文匯總了酵母表達(dá)實(shí)驗(yàn)過(guò)程中常見(jiàn)的問(wèn)題,分析了可能存在的原因以及解決辦法。
1、問(wèn):用畢式酵母表達(dá)蛋白,小量表達(dá)并做SDS-PAGE有一條類(lèi)似三聚體的條帶。大量表達(dá)時(shí)在FPLC上可以看到一個(gè)大峰,但跑電泳卻沒(méi)有發(fā)現(xiàn)條帶?
答:在FPLC上可以看到一個(gè)大峰,但跑電泳卻沒(méi)有發(fā)現(xiàn)條帶,可能的原因有:
(1)上樣時(shí)沒(méi)有目的蛋白,可能是蛋白沒(méi)表達(dá)或親和層析時(shí)沒(méi)洗脫或是穿透了;
(2)目的蛋白結(jié)合在FPLC柱子上沒(méi)被洗脫;
(3)目的蛋白穿透FPLC柱子,你在FPLC上看到的大峰可能是鹽分峰;
(4)電泳時(shí)沒(méi)跑好,目的蛋白沒(méi)被檢測(cè)到.
2、問(wèn):用G418篩轉(zhuǎn)化有多拷貝的細(xì)胞株,篩了兩次,四個(gè)梯度0.5 mg/ml,1 mg/ml,2 mg/ml,4 mg/ml.結(jié)果都沒(méi)長(zhǎng)出細(xì)胞,空載體對(duì)照也沒(méi)長(zhǎng)出。載體是pPIC9K。用電轉(zhuǎn)涂于MD固體培養(yǎng)基,發(fā)現(xiàn)轉(zhuǎn)化效率較低,每塊板長(zhǎng)出十幾個(gè)點(diǎn),是否是轉(zhuǎn)化效率低導(dǎo)致的?
答:可以從以下幾點(diǎn)入手:
(1)挑取酵母單菌落,接種至含有5 ml YPD培養(yǎng)基的50 ml三角瓶中,30℃、250~300 r/min培養(yǎng)過(guò)夜;取100-500 μl的培養(yǎng)物接種至含有500 ml新鮮培養(yǎng)基的2L三角搖瓶中,28~30℃、250~300 r/min培養(yǎng)過(guò)夜,至OD600達(dá)到1.3~1.5。
(2)電擊后馬上加入1ml冰預(yù)冷的1mol的山梨醇溶液將菌體混勻。
(3)推薦:電壓1.5 kV;電容25 μF;電阻200 Ω。電擊時(shí)間為4~10 msec。
3、感受態(tài)制備關(guān)鍵點(diǎn):
甘油的質(zhì)量,水的質(zhì)量,最好是超純的,如果要求完美,洗瓶不要有洗滌劑殘留,先將瓶裝滿超純水高壓,再棄去,再配置10%甘油。收菌以半對(duì)數(shù)期合適,一般OD0.5收菌,過(guò)則不佳,直接取-80℃菌種搖,次日轉(zhuǎn)種,從盤(pán)上菌落搖的要差,33-34℃搖菌結(jié)果更理想。
在以冰冷10%甘油等量,半量,1/4量洗滌時(shí)一定低溫,重懸時(shí)應(yīng)輕震蕩,棄洗滌液應(yīng)倒干靜,那怕?lián)p掉部分細(xì)菌。最后大概500 ml能做3-4 ml感受態(tài),液氮中凍10 min轉(zhuǎn)-80℃冰箱,也可不冷凍,直接用來(lái)轉(zhuǎn)化。
感受態(tài)應(yīng)以標(biāo)準(zhǔn)濃度質(zhì)粒電轉(zhuǎn)記算效率,一般大于10 9/mg,操做以1 ng/ul質(zhì)粒1 ul加40 ul感受態(tài)置0.1杯,電轉(zhuǎn)后以最快的速度加入1 ml soc復(fù)活,100-150轉(zhuǎn)搖1h,取1/1000鋪盤(pán)應(yīng)大于1000個(gè)菌生長(zhǎng)。這樣用于建庫(kù)工作才行。
電轉(zhuǎn)時(shí)質(zhì);蜻B接物盡可能少,以減少離子,實(shí)際上離子高,電流直接通過(guò),沒(méi)有場(chǎng)強(qiáng),質(zhì)粒是進(jìn)不去的。
總結(jié):
(1)任和有關(guān)東西都要干凈,保證沒(méi)有離子。
(2)從接觸甘油開(kāi)始就保持恒0℃。
(3)電擊后復(fù)活要快。
4、問(wèn):轉(zhuǎn)化了一個(gè)基因到畢赤酵母,蛋白有表達(dá),但pcr無(wú)論如何也檢測(cè)不到陽(yáng)性的特性條帶,該如何改進(jìn)?
答:提取酵母DNA當(dāng)模板時(shí),不能按操作手冊(cè)說(shuō)明的模板的用量進(jìn)行PCR,而應(yīng)該降低模板的用量,一般在ng水平已足夠。譬如,挑取單菌落于3 mL適宜培養(yǎng)液中,搖菌過(guò)夜,用試劑盒提取酵母DNA,取1uL提取產(chǎn)物作為模板進(jìn)行PCR鑒定已足夠。
參考步驟
(1)直接用槍尖或者牙簽取單克隆到10 ul無(wú)菌去離子水中;
(2)加5 ul 5 u /ul的溶細(xì)胞酶(SIGMA);
(3)37℃孵育30分鐘;
(4)-70℃15分鐘;
(5)煮沸5分鐘;
(6)12000 rmp離心5分鐘;
(7)取上清5 ul到50 ul PCR反應(yīng)體系。
5、問(wèn):表達(dá)3KD左右的抗菌肽,電泳沒(méi)有目的蛋白,表達(dá)小肽有哪些注意的方面?
答:首先確定蛋白是不是沒(méi)有分泌,看看菌體蛋白中有沒(méi)有,如果沒(méi)有的話:
第一、構(gòu)建多種分泌表達(dá)載體,看看各種表達(dá)載體因素如載體整合方式,整合拷貝數(shù),5'非翻譯區(qū)及甲醇利用表型對(duì)表達(dá)量的影響。
第二、一般來(lái)說(shuō)發(fā)酵灌較搖瓶培養(yǎng)表達(dá)量更高(10-20倍)。
第三、選用酵母偏愛(ài)密碼子。
第四、選用蛋白酶缺陷型得宿主菌如SMD1168等。
6、問(wèn):用畢赤酵母表達(dá)蛋白(非表達(dá)分泌型),經(jīng)常會(huì)遇到表達(dá)量挺高的,但破完細(xì)胞后發(fā)現(xiàn)目的蛋白都在沉淀中沒(méi)法往下純化,請(qǐng)問(wèn)這是為什么?
答:表達(dá)量高的話,表達(dá)的蛋白很容易出現(xiàn)不正確的折疊而形成不溶性的產(chǎn)物,因此要提高可溶性蛋白的表達(dá)量,最好不要讓目的基因過(guò)量表達(dá)?刹扇∫恍┲T如降低溫度等的措施。