一.原核誘導(dǎo)表達(dá)原理
一旦由lacI細(xì)胞所形成的阻遏蛋白與lac操縱子融合后,就無法影響外部基因的轉(zhuǎn)錄和表達(dá)了,也就從而保證了宿主細(xì)胞的健康生長。IPTG同時也是一種可以與乳糖水解融合的中間物質(zhì),它雖然無法被細(xì)胞所同化,但卻能夠與阻遏蛋白的結(jié)合,這樣細(xì)胞也就可以控制外源融資基因的大量轉(zhuǎn)錄和高效表達(dá)。
二.誘導(dǎo)表達(dá)的優(yōu)化策略
1.增加蛋白質(zhì)溶解性和折疊:高溫易使蛋白質(zhì)以聚集的形式表達(dá)成包涵體,可選擇低溫誘導(dǎo)表達(dá)。
2.提高翻譯水平:調(diào)整SD序列與AUG間的距離、點(diǎn)突變改變堿基、增加mRNA穩(wěn)定性。
3.減輕細(xì)胞的代謝負(fù)荷,提高表達(dá)水平:將細(xì)菌的生長與外源基因的誘導(dǎo)表達(dá)分開;使用化學(xué)誘導(dǎo)、溫度誘導(dǎo)等。
4.稀有密碼子優(yōu)化:多數(shù)氨基酸有一個以上的密碼子,當(dāng)異源靶基因的mRNA異常表達(dá)后,tRNA的數(shù)量直接反應(yīng)密碼子的偏好性,一個或多個tRNA的稀有或缺少會導(dǎo)致翻譯的停止。
三.重組蛋白誘導(dǎo)表達(dá)實(shí)驗(yàn)流程
(1)用適當(dāng)?shù)南拗菩詢?nèi)切核酸酶消化載體DNA和目的基因。
(2)按連接步驟連接目的基因和載體,并轉(zhuǎn)化到轉(zhuǎn)化DH5α感受態(tài)細(xì)胞中。
(3)挑取陽性菌落將其加入至5mL Lb(0.1 g/l氨芐青霉素)內(nèi),在37℃培養(yǎng)下過夜。
(4)以2 %體積比轉(zhuǎn)接于2 mL LB( 0.1 g/L氨芐青霉素)中,37℃繼續(xù)培養(yǎng)2.5 h,至細(xì)菌對數(shù)生長期,加0.1 mmol/L IPTG 2 µL誘導(dǎo)3-4 h,同時設(shè)立不加IPTG誘導(dǎo)作為對照。
(5)取上述菌液1 mL,12000 rpm離心10min,收菌沉淀。
(6)重懸于冰的100 µL PBS中,加入PMSF至終濃度為10 mmoL/L。震蕩器震蕩混勻,加入2×加樣緩沖液,煮沸10 min變性,12,000 rpm離心10 min。
(7)將誘導(dǎo)的前后樣品各10µL,作SDS-PAGE電泳分析。
三. SDS-PAGE驗(yàn)證蛋白表達(dá)純化結(jié)果1. SDS-PAGE實(shí)驗(yàn)原理:
1.帶電粒子在電場中游動的速度與電場強(qiáng)度和帶電粒子的凈電荷成正比,與粒子半徑(分子量和結(jié)構(gòu))和介質(zhì)的粘度成反比。如果試劑為混合蛋白質(zhì)溶液,則各種蛋白質(zhì)的等電點(diǎn)的原子數(shù)量不同,這樣在電泳時,產(chǎn)生了不同的電子遷移帶。
2. 實(shí)驗(yàn)流程:
(1)凝膠的制備:配置分離膠,ddH2O 4.0mL,30%儲備膠3.3mL, 1.5M Tris-HCl 2.5mL,10%SDS 0.1mL,10%APS 0.1mL。將上述的混合物一mL后,用TEMED(N,N,N'N'-四亞甲基二胺)10個μL封住底部,再將余下的μL,拌和均勻后,以用百分之二十乙醇溶液填充的玻璃版,蒙頭頂部。確保液位是平的。濃縮膠用ddH2O 1.4mL,30%儲備膠0.33mL,1M Tris-HCl 0.25mL,10%SDS 0.02mL,10%APS 0.02mL,TEMED 2μL制備。去除或分離膠內(nèi)的水分之后,再重新倒入混合物,然后迅速的把篦子放入玻璃內(nèi)充分聚合,需時間約15-30min。
(2)加樣及電泳:將樣品中加入一定量的2xSDS緩沖液中,加熱3-5分鐘,于12000g時離心1分鐘,再取上等清液進(jìn)行SDS-聚丙烯酰胺凝膠電泳。將10uL誘導(dǎo)和未誘導(dǎo)處理的樣品加入樣品池中,并將蛋白質(zhì)標(biāo)記物加入相鄰泳道中。將電泳緩沖液注入電泳槽,并接通電源,濃縮膠的電壓約為80V,而分離膠電壓則是120V,溴酚藍(lán)到底時電泳結(jié)束。
(3)蛋白質(zhì)的染色和脫色:將膠從玻璃板中取出,考馬斯亮藍(lán)染色液染色,室溫4-6 h。染色完畢后,將膠從染色液中取出,放入脫色液中,多次脫色至蛋白帶清晰。
(4)膠片攝像的保存:在圖像處理模式下將已經(jīng)脫色過的膠片攝像,結(jié)果保存于計(jì)算機(jī)中,而膠可保存于雙蒸水中。3. SDS-PAGE常見問題及解決方法
常見問題 |
出現(xiàn)原因 |
解決辦法 |
條帶拖尾 |
膠濃度過大/樣品溶解效果不好 |
樣品離心震蕩;電泳緩沖液現(xiàn)用現(xiàn)配;降低凝膠濃度 |
中間凹兩邊翹 |
凝膠中間凝固不均勻 |
充分凝固后操作 |
中間凸兩邊凹 |
板間底部有氣泡 |
加適量緩沖液排除氣泡 |
條帶粗 |
未濃縮好 |
適當(dāng)增加濃縮膠長度;保證電壓穩(wěn)定;保證儲液pH正確 |
加樣孔底部有沉淀 |
還原劑失活使蛋白質(zhì)分子聚合成大分子 |
添加適量DTT或β-巰基乙醇;補(bǔ)充EDTA阻止還原劑氧化 |
出現(xiàn)紋理 |
樣品有不溶顆粒 |
加促溶劑/加樣前離心 |
4. 結(jié)果展示:
大小為43KDa的某融合蛋白原核誘導(dǎo)表達(dá)前后的SDS-PAGE結(jié)果:
M:蛋白Marker;泳道1、3、5:3株單克隆菌株誘導(dǎo)前;泳道2、4、6:3株單克隆菌株誘導(dǎo)后。
五. 電泳技術(shù)的應(yīng)用場景:
1.臨床醫(yī)學(xué):電泳技術(shù)在臨床診斷中發(fā)揮重要作用,為檢測同工酶、各種蛋白質(zhì)等提供了新手段。
2.生物制藥、藥物篩選與分析:分析生物樣本中的藥物及其代謝產(chǎn)物、分析藥物雜質(zhì)、分析重要等。
3.食品安全及微生物鑒定:樣品條帶可反應(yīng)不同樣品間的群落相似性,與飛行時間質(zhì)譜、電化學(xué)檢測儀等結(jié)合使用,提高痕量檢測的可靠性。
4.農(nóng)業(yè)畜牧業(yè)生產(chǎn):可用于雜種后代的鑒定,親緣關(guān)系分析,遺傳基因定位等多種方面。
卡梅德?lián)碛胸S富的原核表達(dá)載體和多種表達(dá)菌株,通過每年400多單原核蛋白制備項(xiàng)目的技術(shù)積累,客戶僅需提供我們一段蛋白序列、CDS或者蛋白名稱,我們便可以在較短時間內(nèi)設(shè)計(jì)一個完整的蛋白表達(dá)和純化方案,為客戶提供高質(zhì)量的蛋白產(chǎn)品,助力您的實(shí)驗(yàn)進(jìn)度。