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納米抗體淘選體系選擇介紹

瀏覽次數(shù):858 發(fā)布日期:2023-8-9  來(lái)源:本站 僅供參考,謝絕轉(zhuǎn)載,否則責(zé)任自負(fù)

噬菌體展示技術(shù)由喬治-史密斯(George P. Smith)于 1985 年最早描述,他報(bào)道了在絲狀噬菌體(感染細(xì)菌的細(xì)長(zhǎng)病毒)上展示肽的方法,即從一系列肽序列中將病毒的外殼蛋白與一種肽融合。1988 年,斯蒂芬-帕姆雷(Stephen Parmley)和喬治-史密斯描述了用于親和力篩選的生物淘篩(biopanning),并證明逐輪篩選可以富集出十億分之一或更少出現(xiàn)的克隆。1990年,吉米-司各特(Jamie Scott)和喬治-史密斯描述了在絲狀噬菌體上展示的大型隨機(jī)肽庫(kù)的創(chuàng)建過(guò)程。格雷格-溫特(Greg Winter)和約翰-麥卡弗蒂(John McCafferty)所在的分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)室、理查德-勒納(Richard Lerner)和卡洛斯-巴巴斯(Carlos Barbas)所在的斯克里普斯研究所以及弗蘭克-布賴特林(Frank Breitling)和斯特凡-杜貝爾(Stefan Dübel)所在的德國(guó)癌癥研究中心的研究小組進(jìn)一步開(kāi)發(fā)和改進(jìn)了噬菌體展示技術(shù),用于展示治療蛋白質(zhì)工程中的抗體等蛋白質(zhì)。史密斯和溫特因開(kāi)發(fā)噬菌體展示技術(shù)的貢獻(xiàn)而獲得了 2018 年諾貝爾化學(xué)獎(jiǎng)的一半份額。1985 年,喬治-皮克澤尼克(George Pieczenik)要求優(yōu)先權(quán)的一項(xiàng)專利也描述了肽庫(kù)的生成過(guò)程。

噬菌體抗體庫(kù)技術(shù)是目前應(yīng)用廣泛的基因工程抗體制備技術(shù),在人源抗體的克隆、抗體性能的修飾、抗體基因的研究等方面具有重要的理論和實(shí)用價(jià)值。抗體庫(kù)展示技術(shù)的篩選能力為其應(yīng)用發(fā)展奠定了基礎(chǔ)。而能否從抗體庫(kù)中獲得預(yù)期的抗體受到很多因素的制約,包括抗體庫(kù)的存儲(chǔ)容量、多樣性、存儲(chǔ)條件、擴(kuò)增和篩選流程等,篩選策略需要根據(jù)抗原的性質(zhì)來(lái)確定。其他篩選策略的選擇依據(jù)如下文所述:


抗原性質(zhì)明確時(shí),使用固相篩選法和液相篩選法。

固相篩選法通過(guò)將抗原包被在酶標(biāo)板或其他固相介質(zhì)上來(lái)富集表達(dá)高親和性抗體的噬菌體。該法有兩種篩選方式:ELISA微孔板篩選和免疫試管篩選。當(dāng)抗體庫(kù)容量較大,預(yù)期目標(biāo)抗體的拷貝數(shù)較多,親和力較強(qiáng)且抗原來(lái)源豐富時(shí),固相抗原篩選法最常用。固相篩選法的缺點(diǎn)有:消耗大量抗原、部分抗原與固相介質(zhì)結(jié)合后會(huì)破壞表位、不易定量、對(duì)抗體親和力的選擇效果不佳。因此,在抗原有限等以上這些情況下可以選擇液相篩選法。

液相篩選法是在與親和素偶聯(lián)的磁珠或瓊脂糖上包被生物素化的抗原進(jìn)行抗體篩選。液相篩選法的篩選效率高,增加了噬菌體顆粒與抗原接觸的機(jī)率,能有效地將數(shù)量少或親和力低的抗體從文庫(kù)中分離出來(lái)。通過(guò)多次篩選,可以得到表達(dá)高親和力抗體的噬菌體。

抗原無(wú)法純化或性質(zhì)未知時(shí),就需要開(kāi)發(fā)新的篩選方法來(lái)建立噬菌體展示抗體庫(kù)。目前比較成熟的有細(xì)胞篩選方法、組織篩選或體內(nèi)篩選方法、選擇感染篩選方法、蛋白質(zhì)芯片篩選方法等。

細(xì)胞篩選方法可以保持抗原和抗體的天然構(gòu)象,多用于腫瘤細(xì)胞抗體篩選,還適用于細(xì)胞表面受體及抗原鑒定。而由于細(xì)胞膜成分復(fù)雜,會(huì)增加非特異性結(jié)合,因此需要去除非特異性結(jié)合的背景。最常用的去除背景的方法是用不表達(dá)特異性抗原的細(xì)胞(空白細(xì)胞)預(yù)吸附抗體庫(kù),去除非目標(biāo)抗體(負(fù)選擇),然后用吸附的噬菌體結(jié)合目標(biāo)抗體。靶細(xì)胞獲得靶細(xì)胞結(jié)合抗體(正選擇),經(jīng)過(guò)幾輪“負(fù)選擇-正選擇-擴(kuò)增”,針對(duì)靶分子的抗體噬菌體被富集。但多次篩選容易丟失特異性結(jié)合的抗體噬菌體,喪失多樣性。因此該方法的應(yīng)用并不廣泛,在此方法基礎(chǔ)上開(kāi)發(fā)了扣除篩選、競(jìng)爭(zhēng)篩選、內(nèi)化篩選等方法。

組織篩選或體內(nèi)篩選方法多用于臨床研究。組織篩選方法是利用新鮮的組織切片進(jìn)行抗體篩選,但由于組織本身抗原數(shù)量有限,限制了噬菌體抗體的回收效率。體內(nèi)篩選方法是將待篩選抗體庫(kù)通過(guò)靜脈注射進(jìn)小鼠體內(nèi),然后取出組織或靶器官,回收噬菌體,經(jīng)過(guò)3-4輪的富集可得到特異性抗體。與體外篩選相比,此類組織和細(xì)胞處于天然的三維微環(huán)境中,篩選結(jié)果更加真實(shí)。但體內(nèi)篩選效率低、篩選難度大、對(duì)文庫(kù)要求較高——通常要求文庫(kù)的多樣性達(dá)到108-109。同時(shí),應(yīng)盡量減少空噬菌體的含量。

選擇感染篩選法是將PⅢ蛋白的氨基端結(jié)構(gòu)域(NT)用特定的多肽或蛋白替代,然后這些多肽或蛋白與帶有NT端的配基特異性結(jié)合時(shí),才會(huì)有感染能力,因此在細(xì)菌細(xì)胞內(nèi)繁殖富集,得到特異性抗體。

蛋白芯片篩選法利用高通量蛋白功能分析技術(shù),將有大量不同種類的蛋白質(zhì)點(diǎn)樣在載體上,可同時(shí)檢測(cè)這些抗原抗體的反應(yīng),通過(guò)掃描儀讀取熒光強(qiáng)度,可以利用計(jì)算機(jī)對(duì)待測(cè)樣品進(jìn)行分析計(jì)算。蛋白質(zhì)芯片不僅具有高通量的特點(diǎn),還可以高靈敏性和低假陽(yáng)性的篩選抗體。 

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