1. 什么是fab抗體
Fab片段是抗體結(jié)構(gòu)中可以與抗原結(jié)合的區(qū)域,也叫做抗原結(jié)合片段,涉及到抗體-抗原結(jié)合的親和力,抗體特異性等特征?贵wFab片段含有1個(gè)可變區(qū)(V區(qū))和1個(gè)恒定區(qū)(C1),V區(qū)含有3個(gè)互補(bǔ)決定結(jié)構(gòu)域(CDR),涉及到獨(dú)特型抗體的產(chǎn)生,抗體的超頻突變,尤其是CDR3結(jié)構(gòu)域是抗體工程改造的核心區(qū)域;C1區(qū)主要起結(jié)構(gòu)支撐作用。
圖1:fab抗體示意圖
2. fab抗體文庫優(yōu)點(diǎn)
重組Fab的優(yōu)勢比較明顯,由于不具備Fc區(qū),從而不需要翻譯后修飾和糖基化,可以同時(shí)在原核和哺乳動(dòng)物系統(tǒng)中表達(dá)。生產(chǎn)Fab片段,通常利用大腸桿菌表達(dá)系統(tǒng)與哺乳動(dòng)物表達(dá)系統(tǒng)。大腸桿菌表達(dá)系統(tǒng)具有生產(chǎn)成本低、生產(chǎn)速度快等優(yōu)點(diǎn),但容易形成包涵體,復(fù)性后活性難保證。
3. scfv抗體和fab抗體區(qū)別
表1:fab抗體與scfv抗體區(qū)別
4. fab抗體文庫應(yīng)用
Fab類抗體片段具有分子質(zhì)量小、組織分布特異性強(qiáng)、免疫原型低、可基因工程操作等特點(diǎn),使Fab成為了醫(yī)藥研究領(lǐng)域的重要成員之一,F(xiàn)ab類藥物在預(yù)防、診斷、治療等領(lǐng)域有著廣泛的應(yīng)用,例如:已經(jīng)上市的賽妥珠單抗酯(一種Fab片段,Cat:YR1612),可以有效地針對類風(fēng)濕性關(guān)節(jié)炎;作為Fab片段的美妥昔單抗I也已經(jīng)用于治療肺癌等。
5. 卡梅德生物能夠?yàn)榭蛻籼峁└哔|(zhì)量的fab抗體噬菌體展示服務(wù)
卡梅德生物(KMD Bioscience)多年來致力于抗體領(lǐng)域研究。我們積累了豐富的抗體文庫構(gòu)建經(jīng)驗(yàn),能夠?yàn)榭蛻籼峁┗诳贵w噬菌體展示文庫技術(shù)的fab抗體文庫構(gòu)建服務(wù)。
6. 卡梅德生物為客戶提供fab抗體文庫構(gòu)建服務(wù)的全流程介紹
卡梅德生物為客戶提供fab噬菌體文庫構(gòu)建服務(wù),流程包括:抗體cDNA制備,基因擴(kuò)增,載體構(gòu)建,電擊轉(zhuǎn)化,抗體鑒定,fab文庫包裝。
圖2:fab噬菌體展示抗體庫構(gòu)建流程
6.1 抗體cDNA制備
6.1.1 外周血單核細(xì)胞單克隆化
客戶提供人外周血淋巴細(xì)胞,淋巴結(jié)細(xì)胞或脾臟細(xì)胞(保存在RNA later等溶液中,避免RNA降解,藍(lán)冰運(yùn)輸),EBV病毒單克隆化。
6.1.2 總RNA提取
將外周血淋巴細(xì)胞從冰箱取出后分裝,加入氯仿,離心后取上清加入異丙醇,離心保留沉淀,加入75%乙醇后離心保留沉淀,干燥后加入DEPC水,孵育確保RNA溶解,將各管混合到一管中即為總RNA,取總RNA進(jìn)行電泳,取 總RNA 用核酸濃度測量儀測濃度。
6.1.3 反轉(zhuǎn)錄獲取cDNA
按照商業(yè)化試劑盒操作說明書進(jìn)行cDNA制備,將上一步得到的RNA反轉(zhuǎn)錄成cDNA。
6.2 基因擴(kuò)增
以cDNA為模板擴(kuò)增抗體重鏈(Fd段)和輕鏈可變區(qū)基因。
圖3:Fd和輕鏈PCR擴(kuò)增結(jié)果
6.3載體構(gòu)建
PCR 擴(kuò)增的 Fd 片段產(chǎn)物(通過瓊脂糖凝膠電泳分離)用過量的限制酶切割,通常約350ng與2μg Xho/Spe I 線性化的 pComb3 載體(通過分離瓊脂糖凝膠電泳)在150μL 的總體積中與連接酶在 16℃下反應(yīng) 15小時(shí),命名為P+Fd。PCR擴(kuò)增的輕鏈片段產(chǎn)物和重組的p+Fd(瓊脂糖凝膠電泳分離)用過量的限制酶切割,連接、轉(zhuǎn)化,將具有Fd和κ輕鏈的噬菌粒命名為pComb3H +κ+ Fd。
6.4電擊轉(zhuǎn)化
6.4.1將連接產(chǎn)物進(jìn)行電擊轉(zhuǎn)化后構(gòu)建含有目的抗體片段的大腸桿菌文庫
取大腸桿菌感受態(tài)細(xì)胞,加入回收后的連接產(chǎn)物,將混合后的感受態(tài)細(xì)胞和連接產(chǎn)物轉(zhuǎn)移到預(yù)冷好的電轉(zhuǎn)杯中,使用電轉(zhuǎn)儀預(yù)設(shè)的轉(zhuǎn)化程序電擊轉(zhuǎn)化,電轉(zhuǎn)后立即往電轉(zhuǎn)杯中加入培養(yǎng)基,至少進(jìn)行20個(gè)電轉(zhuǎn)。將細(xì)胞復(fù)蘇后涂在瓊脂糖培養(yǎng)板上過夜生長。將上一步過夜生長后的培養(yǎng)板上的細(xì)胞用培養(yǎng)基和涂布棒沖洗刮下,加入甘油測OD600nm值后保存在-80℃,即為細(xì)菌文庫。
6.4.2 fab噬菌體文庫篩選
6 孔板(Nunclon™)用等量的外周血淋巴細(xì)胞包被 5×106 個(gè)細(xì)胞,然后在4℃下用 BSA/PBS 封閉過夜。每孔加入 1 ml 噬菌體文庫,37℃孵育 2 h。對于第 1、2、3、4 和 5 輪,分別用 TBS/ 吐溫 20 (TBST) 洗滌未結(jié)合的噬菌體 1、5、10、10、10 次。通過添加洗脫緩沖液(0.1 M HCL,用固體甘氨酸調(diào)節(jié)至 pH 2.2 并含有 0.1% BSA)洗脫結(jié)合的噬菌體,并用 2 M Tris 緩沖液,pH 8.0 中和洗脫溶液。如上所述遵循 VCSM13 輔助噬菌體的擴(kuò)增程序,同時(shí)在 LB-氨芐青霉素平板上滴定輸入和輸出噬菌體。噬菌體結(jié)合、洗脫和擴(kuò)增步驟進(jìn)行5輪。
6.5抗體鑒定
隨機(jī)挑選20-50個(gè)克隆,PCR鑒定陽性率,測序和分析抗體序列。
圖4:陽性率:>90%
6.6 fab文庫包裝
交付>1x1013噬菌體顆粒/ml。
傳統(tǒng)的雜交瘤技術(shù)生產(chǎn)單克隆抗體成本高,而且產(chǎn)生的鼠源抗體往往具有觸發(fā)人抗小鼠抗體(HAMA)反應(yīng)的缺點(diǎn)。因此,通過噬菌體展示技術(shù)產(chǎn)生的重組 Fab 抗體可以成為治療腫瘤的合適替代方案?返律餅槟峁┑娜嗽碏ab抗體文庫構(gòu)建服務(wù)親和力高,庫容量高,獨(dú)立克隆數(shù)107-1012,根據(jù)客戶需求制備,為每一個(gè)客戶量身定制實(shí)驗(yàn)方案。