1.什么是酵母展示平臺(tái)
酵母展示(或酵母表面展示)是一種強(qiáng)大的蛋白質(zhì)工程技術(shù),它是用整合到酵母細(xì)胞壁中的重組蛋白的表達(dá)來分離和工程化抗體。自 2000 年首次發(fā)表以來,酵母表面展示已被廣泛用于設(shè)計(jì)各種蛋白質(zhì)以提高親和力、特異性、表達(dá)、穩(wěn)定性和催化活性。
2.酵母展示原理
酵母抗體展示技術(shù)(Yeast Display Technology)是指用抗體序列可變區(qū)與凝集素Aga2p融合表達(dá),Aga2p蛋白亞基通過兩個(gè)二硫鍵與固定在酵母細(xì)胞壁上的Aga1p 蛋白亞基結(jié)合,結(jié)合流式分選技術(shù),將靶向抗原的特異性抗體給篩選出來。
圖1:酵母文庫(kù)展示示意圖
3.納米抗體
納米抗體(Nanobody, Nbs)是駝科動(dòng)物外周血清產(chǎn)生的一種單鏈抗體,這些抗體僅由重鏈組成,缺乏輕鏈和功能性CH1和CH4結(jié)構(gòu)域。VHH晶體為2.5nm,長(zhǎng)4nm,分子量只有15KDa。相較于傳統(tǒng)抗體,納米抗體因其分子量小,從而更容易可穿透血腦屏障;原核或真核系統(tǒng)有高表達(dá)量;特異性強(qiáng),親和力高;對(duì)人的免疫原性弱等優(yōu)點(diǎn),因此在抗腫瘤藥物研發(fā)、心腦血管疾病、免疫疾病等領(lǐng)域有巨大價(jià)值。
圖2:納米抗體的3D結(jié)構(gòu)
4.納米抗體酵母展示優(yōu)缺點(diǎn)
4.1優(yōu)點(diǎn)
(1)酵母作為真核表達(dá)系統(tǒng),可以進(jìn)行翻譯后修飾來表達(dá)和折疊復(fù)雜的真核蛋白;
(2))相對(duì)噬菌體展示文庫(kù)技術(shù)而言,酵母展示技術(shù)在微量抗體表達(dá)后抗體活性要高,得益此基礎(chǔ),在流式篩選時(shí)就能區(qū)分抗體的親和力高低;
(3)插入異源蛋白不會(huì)破壞表面蛋白的結(jié)構(gòu),也不會(huì)影響表面展示的效率。
4.2缺點(diǎn)
(1)相比于噬菌體展示技術(shù),酵母展示庫(kù)容量較低,因此主要應(yīng)用于客戶對(duì)項(xiàng)目庫(kù)容要求不高,動(dòng)物免疫后PBMC細(xì)胞經(jīng)過二次分選以及避免漏掉二硫鍵形成的抗體發(fā)現(xiàn)項(xiàng)目;
(2)由于酵母表面存在多個(gè)蛋白質(zhì)拷貝,可能會(huì)發(fā)生與寡聚蛋白靶標(biāo)不希望的多價(jià)結(jié)合。
5.酵母抗體展示應(yīng)用
隨著這項(xiàng)技術(shù)的不斷完善,現(xiàn)在酵母展示的應(yīng)用包括酶工程;蛋白質(zhì)表位作圖、蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)相互作用的鑒定、免疫生物催化和生物傳感器,以及用于生物技術(shù)和生物醫(yī)學(xué)應(yīng)用的酵母細(xì)胞上蛋白質(zhì)和酶的展示。
6.能夠提供酵母抗體展示技術(shù)服務(wù)
納米抗體酵母展示服務(wù)流程如下:抗原準(zhǔn)備,羊駝免疫,PBMC分離,RNA提取,cDNA制備,文庫(kù)構(gòu)建,文庫(kù)篩選,抗體表達(dá)。
圖3:酵母抗體展示文庫(kù)流程圖
5.1抗原制備
5.1.1密碼子優(yōu)化+基因模板合成+表達(dá)載體構(gòu)建;
5.1.2質(zhì)粒抽提+轉(zhuǎn)染(哺乳表達(dá)系統(tǒng))目的蛋白檢測(cè)(WB,SDS-PAGE);
5.1.3蛋白表達(dá)放大+蛋白親和純化。
5.2動(dòng)物免疫
5.2.1動(dòng)物免疫4次,加強(qiáng)免疫一針,共計(jì)免疫5針;
5.2.2免疫前采集陰性血清,第4針采血進(jìn)行ELISA檢測(cè)血清效價(jià);
5.2.3若第4針血清抗體效價(jià)(蛋白抗原>105;多肽抗原>104)滿足要求,則采血前7天再次加強(qiáng)免疫1針,如不滿足要求,則繼續(xù)常規(guī)免疫;
5.2.4效價(jià)合格,采血(>100ml)分離單核細(xì)胞。
5.3 cDNA制備
5.3.1 PBMC總RNA提。▍⒄誖NA提取試劑盒);
5.3.2高保真RT-PCR制備cDNA(參照反轉(zhuǎn)錄試劑盒)。
5.4文庫(kù)制備
5.4.1以cDNA為模板,兩輪PCR擴(kuò)增VHH基因;
5.4.2酵母表達(dá)質(zhì)粒構(gòu)建與轉(zhuǎn)化: VHH基因拼接酵母展示載體,電擊轉(zhuǎn)化酵母宿主菌,構(gòu)建抗體庫(kù),電擊次數(shù)不低于10次;
5.4.3鑒定:隨機(jī)挑選24個(gè)克隆,PCR鑒定陽(yáng)性率+PCR鑒定多樣性+插入率。
圖4:VHH陽(yáng)性率:>90%
5.5文庫(kù)篩選
5.5.1磁珠分選;
5.5.2 FACS分選(免疫雙標(biāo)分選);
5.5.3鋪板+陽(yáng)性克隆菌培養(yǎng)+抗體基因測(cè)序;(>20個(gè),多達(dá)96個(gè))。
5.6抗體表達(dá)
5.6.1將獲得的抗體序列構(gòu)建合適的表達(dá)載體(哺乳表達(dá))進(jìn)行表達(dá)+親和純化+抗體蛋白定量;
圖5:Fc-VHH納米抗體表達(dá)結(jié)果圖片
5.6.2 Elisa驗(yàn)證抗體與抗原結(jié)合,進(jìn)行下游驗(yàn)證(交付EC50數(shù)據(jù));
5.6.3 BLI法驗(yàn)證抗體親和力;
5.6.4細(xì)胞功能驗(yàn)證:流式驗(yàn)證;
5.6.5驗(yàn)證細(xì)胞系(抗原受體過表達(dá)細(xì)胞系)。
7.酵母展示服務(wù)優(yōu)勢(shì)
(1)物種適應(yīng)性廣泛:人,鼠,兔,羊,羊駝,駱駝,魚等物種的單抗開發(fā)均兼容
(2)技術(shù)平臺(tái)成熟:提供的1級(jí)免疫文庫(kù)的建庫(kù)庫(kù)容為106-107;插入率均滿足>95%,篩選獲得的抗體親和力普遍處于nM-pM級(jí)別
(3)開發(fā)周期短:獲得PBMC后,建庫(kù)到篩選獲得抗體序列,3-4周
(4)產(chǎn)品交付標(biāo)準(zhǔn)高:針對(duì)免疫庫(kù),交付免疫前后血清,抗體展示文庫(kù),酵母表達(dá)菌株,抗體序列
隨著抗體庫(kù)技術(shù)的不斷發(fā)展,噬菌體展示抗體文庫(kù)已經(jīng)生產(chǎn)了大量的高活性抗體,噬菌體展示技術(shù)的廣泛應(yīng)用促使科學(xué)家對(duì)于酵母文庫(kù)技術(shù)的不斷探索。酵母展示技術(shù)作為真核表達(dá)系統(tǒng),相比于噬菌體展示系統(tǒng)有其獨(dú)特的優(yōu)勢(shì),因此在人類治療和診斷領(lǐng)域也占據(jù)著重要地位。