Q1:我該如何得到完美的多色結(jié)果呢?
A1:首先,您需要有質(zhì)量不錯的樣本和抗體,這就已經(jīng)是成功的一半(樣本、抗體選擇攻略),對于樣本來說,脫片是我們需要預(yù)防的“頭號公敵”,多色實驗需要重復(fù)熱修復(fù)洗脫抗體多次,假如片子脫片,輕則成像模糊,重則組織脫落前功盡棄,可以在開始實驗之前先模擬幾輪熱修復(fù),不加抗體和其他試劑,看看組織是否有脫落的跡象,如果脫落比較嚴(yán)重,則需要重新制備切片,如果有輕微脫片,則可以考慮購買抗體洗脫液,替代熱修復(fù)的過程;然后,就可以開始做實驗了,我們建議您先進行抗體和染料工作條件摸索,再上多染(參考下圖流程),這樣多染的成功率可以達到90%以上哦。ㄐ劢(jīng)驗之談,即便是染了千百遍的常見指標(biāo),換個樣本,染色效果就可能天差地別,有條件還是建議要做預(yù)實驗。)
最后的10%,就需要調(diào)整指標(biāo)與染料搭配以及染色的順序了。
Q2:有沒有推薦的染料搭配和染色順序呢?
A2:染料搭配一般遵循“寡靶配強光,眾靶配弱光”的原則,意思是表達比較弱的指標(biāo)搭配熒光信號比較強的染料,表達相對強的指標(biāo)搭配信號比較弱的染料,Absin的TSA染料波長越短熒光強度越強,比如說需要染PD-1,CD8和CD3,我們手里有一個四色試劑盒(TSA520/TSA570/TSA650),通過IHC發(fā)現(xiàn)樣本中PD-1的信號很少,CD3信號非常多,其次是CD8,于是選擇TSA520搭配PD-1,TSA650搭配CD3,TSA570搭配CD8,比較合理。
接下來就是怎么安排染色先后順序:
1)劃分細胞定位,先外后內(nèi):確定每個指標(biāo)的細胞定位,膜表達先染,胞漿或者胞核的后染(如果是指標(biāo)比較多的情況下,胞內(nèi)指標(biāo)排在比較后面,經(jīng)過前期多輪洗脫,可以不做細胞通透;如果指標(biāo)很少,染胞內(nèi)指標(biāo)之前還是需要打孔,多個胞內(nèi)指標(biāo)也只需要打一次孔);
2)確定抗原修復(fù)方式,先酸后堿:堿修復(fù)比酸修復(fù)的力度會更強,個別抗體在用堿修復(fù)以后會染出來很多非特異性,所以如果是相同的細胞定位,就先染酸修復(fù),再染堿修復(fù)的抗體;
3)根據(jù)IHC結(jié)果判別,先弱后強:組化結(jié)果顯示指標(biāo)比較少,比較弱的,排在前面染,理論上來說越靠前染的指標(biāo)效果會越接近單標(biāo)染色。
以上就是一些通用規(guī)則,但不同的指標(biāo)還是可能出現(xiàn)變化,要想得到最完美的結(jié)果,就需要不同的排列組合一個一個嘗試(如下表,“X”代表有信號),這樣會比較耗費時間和試劑,您可以根據(jù)通用規(guī)則先行一次多染,然后各通道跟熒光單染做對比,如果效果差別很大,那就再調(diào)整染色順序,如果單染的結(jié)果跟組化差別比較大(出現(xiàn)高背景,非特異性明顯),就要考慮更換染料搭配。
Target | Best Signal | Recommended Dilution |
||
1st AR | 3rd AR | 6th AR | ||
FOXP3 | x | 1:250 | ||
PD-1 | x | 1:250 | ||
LAG3 | x | x | 1:250 | |
CD4 | x | x | 1:250 |
Q3:我成像完了以后想要做數(shù)據(jù)分析,你們有什么軟件推薦嗎?
A3:目前市面上數(shù)據(jù)分析軟件還是比較多的,像免費的您可以下載imageJ、Qupath,缺點就是用法都需要您自行摸索;我們公司安裝的是HALO和StrataQuest兩款軟件,HALO是付費的,StrataQuest是我們TG的掃描儀平臺自帶的,從功能、分析的精準(zhǔn)度和可操作性來說,肯定是大大優(yōu)于開源軟件的,且有軟件專業(yè)的技術(shù)支持團隊能夠答疑解惑。您可以根據(jù)您的實際情況選擇合適的分析軟件,如果您實在無從下手,也可以找Absin,我們可以提供數(shù)據(jù)分析的服務(wù)~