本文系鹿明生物原創(chuàng)，轉(zhuǎn)載請注明本文轉(zhuǎn)自鹿明生物

導(dǎo)讀

眾所周知，在2001年人類基因組計劃完成之后，組學(xué)在整個生命科學(xué)領(lǐng)域取得了一個飛躍的發(fā)展，包括基因組學(xué)，轉(zhuǎn)錄組學(xué)，蛋白組學(xué)，再到現(xiàn)在比較熱門的代謝組學(xué)，以及宏基因組學(xué)和將來的功能代謝組學(xué)等等(Janet et al., 2016)。鹿明生物項目文章同一期刊，4連發(fā)~可以讓您深入了解LC-MS非靶向代謝組學(xué)在醫(yī)口領(lǐng)域的深度應(yīng)用~~

 

代謝組學(xué)研究優(yōu)勢：

• 基因和蛋白質(zhì)表達的微小變化會在代謝物水平得到放大；

• 代謝組學(xué)的研究不需進行全基因組測序及建立大量表達序列標簽的數(shù)據(jù)庫；

• 代謝物種類遠少于基因和蛋白的數(shù)目，每個生物體中代謝產(chǎn)物大約在10數(shù)量級，而最小的細菌，其基因組中也有幾千個基因；

• 生物體的代謝物分析可反映機體系統(tǒng)的生理和病理狀態(tài)。

本篇小鹿分享連續(xù)發(fā)表于的4篇LC-MS非靶向代謝組學(xué)項目文章，希望能夠更好的助力您的科學(xué)研究。

 

文章一

 

腸道微生物-睪丸軸：FMT通過改善全身和睪丸代謝組，減輕高脂肪飲食，降低男性生育能力

期刊：Microbiology Spectrum

影響因子：9.043

發(fā)表時間：2022年4月

樣本類型：小鼠糞便、血清、睪丸

合作項目單位：中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院

運用組學(xué)技術(shù)：轉(zhuǎn)錄組學(xué)、LC-MS非靶向代謝組學(xué)（由鹿明生物提供技術(shù)支持）

 

研究背景

本篇為中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院北京畜牧獸醫(yī)研究所趙勇、張宏福及其團隊發(fā)表的文章，本研究作者運用LC-MS非靶向代謝組學(xué)、轉(zhuǎn)錄組測序的多組學(xué)技術(shù)探究高脂肪飲食(HFD)誘導(dǎo)的肥胖與男性生育能力下降和人類精液質(zhì)量下降有關(guān)。

 

研究結(jié)論

作者首次發(fā)現(xiàn)，海藻酸寡糖(AOS)可以改善腸道微生物群(A10-FMT)的糞便微生物群移植(FMT)來改善HFD降低的精液質(zhì)量。通過對血液和睪丸代謝組樣本研究。A10-FMT通過增加腸道擬桿菌和粘膜層減少調(diào)節(jié)脂代謝產(chǎn)生n-3多不飽和脂肪酸改善HFD損傷的睪丸微環(huán)境，挽救精子發(fā)生，提高精液質(zhì)量和生育能力。

研究結(jié)果表明，AOS改善的腸道微生物群可能是未來治療HFD引起的肥胖或代謝問題相關(guān)的男性不育癥的一種有前途的策略。

DOI: 10.1128/spectrum.00028-22
 

文章二

 

剖宮產(chǎn)瘢痕憩室中宮頸菌群與宿主基因調(diào)控的相互作用

期刊：Microbiology Spectrum

影響因子：9.043

發(fā)表時間：2022年8月

樣本類型：人

合作項目單位：廣州中山大學(xué)附屬第六醫(yī)院

運用組學(xué)技術(shù)：轉(zhuǎn)錄組學(xué)、16S 測序、LC-MS非靶向代謝組學(xué)（由鹿明生物提供技術(shù)支持）

 

研究背景

接受剖宮產(chǎn)手術(shù)的女性可能會患上剖宮產(chǎn)瘢痕憩室 (CSD)。CSD是由于子宮局部切口愈合不良，形成與子宮腔相連的凹陷或空腔，可導(dǎo)致各種近期和遠期并發(fā)癥，之前的研究表明，持續(xù)性積液是影響 CSD 女性生育能力的主要因素。

2022年08月，中山大學(xué)附屬第六醫(yī)院生殖醫(yī)學(xué)研究中心劉貴華主任醫(yī)師、陳培根博士、梁曉燕教授（一作：楊星副主任醫(yī)師）研究團隊，采用微生物組學(xué)、代謝組學(xué)和轉(zhuǎn)錄組學(xué)等研究方法，全面描述了剖宮產(chǎn)瘢痕憩室中微生物群的異�；顒犹卣饕约八拗�-微生物群相互作用的機制。

 

研究思路

 

研究結(jié)論

女性生殖道具有獨特的微生物組，在維持體內(nèi)平衡和某些疾病的發(fā)展中起著至關(guān)重要的作用。在本研究中，將非靶向代謝組學(xué)和人類宿主轉(zhuǎn)錄組相結(jié)合，分析了CSD微生物的活性特征以及微生物與宿主相互作用的機制。揭示了潛在有害微生物確實對宿主子宮內(nèi)膜有不利影響。這些不良反應(yīng)的機制包括抑制有益細菌（如乳酸桿菌）的活性，消耗子宮內(nèi)膜的保護性代謝物，以及有害代謝物的產(chǎn)生。研究從微生物、代謝和宿主反應(yīng)的角度闡明了該機制，為剖宮產(chǎn)瘢痕憩室的預(yù)防和治療策略提供了重要依據(jù)。

DOI: 10.1128/spectrum.01676-22
 

文章三

 

腸-睪丸軸:微生物群主要代謝組提高年輕Ⅱ型糖尿病人的精子質(zhì)量

期刊：Microbiology Spectrum

影響因子：9.043

發(fā)表時間：2022年10月

樣本類型：小鼠血漿、睪丸，糞便

合作項目單位：中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院

運用組學(xué)技術(shù)：轉(zhuǎn)錄組學(xué)、微生物16S、LC-MS非靶向代謝組學(xué)（由鹿明生物提供技術(shù)支持）

 

研究背景

2022年10月，中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院北京畜牧獸醫(yī)研究所趙勇、張宏福及其團隊運用LC-MS非靶向代謝組學(xué)、轉(zhuǎn)錄組測序、16s rRNA微生物測序等多組學(xué)技術(shù)，發(fā)現(xiàn)海藻酸寡糖（AOS）+腸道微生物菌群治療的方式可以改善年輕糖尿病患者的精子活力。

本研究中，作者通過模仿青年T2D患者，給3周齡的雄性小鼠喂食HFD并注射鏈脲佐菌素（STZ）以誘導(dǎo)T2D。發(fā)現(xiàn)在青春期（5周齡），小鼠出現(xiàn)T2D，成年（10周齡）后，T2D小鼠的精子密度和活動力降低，而血糖升高。隨后，作者探究海藻酸寡糖（AOS）是否能改善腸道微生物群（A10-FMT）的糞便移植（FMT）從而降低血糖，增加精子濃度和活力？探究AOS通過改善腸道微生物群的有益微生物，來改善全身環(huán)境和睪丸微環(huán)境，從而改善精子發(fā)生。

 

研究思路

 

研究結(jié)論

本文運用LC-MS非靶向代謝組學(xué)+轉(zhuǎn)錄組測序+16s rRNA微生物測序等多組學(xué)技術(shù)，研究了海藻酸寡糖（AOS）+腸道微生物菌群治療對年輕的男性二型糖尿病生育能力的影響，研究的結(jié)果為具有潛在男性不育高風(fēng)險的T2D青少年的有益腸道微生物群的作用機制提供了新的線索。

研究結(jié)果強烈表明有必要探索微生物群糞便移植療法，以降低在T2D病程早期的青年男性不育癥的升高率。此外，有必要對患有T2D的青年進行臨床研究，以闡明有益微生物群在改善精液質(zhì)量和男性生育能力中的作用。

DOI: 10.1128/spectrum.01423-22
 

文章四

特發(fā)性非梗阻性無精子癥患者精液中宿主與微生物的相互作用

期刊：Microbiology Spectrum

影響因子：9.043

發(fā)表時間：2023年1月

樣本類型：人精漿

合作項目單位：中山大學(xué)附屬第六醫(yī)院生殖醫(yī)學(xué)中心

運用組學(xué)技術(shù)：微生物16S、LC-MS非靶向代謝組學(xué)（由鹿明生物提供技術(shù)支持）

 

研究背景

患有非阻塞性無精子癥(NOA)的男性面臨著低精子數(shù)量和低精子質(zhì)量的雙重問題。大多數(shù)無明確原因的NOA男性被歸類為特發(fā)性NOA (iNOA)。此前的研究發(fā)現(xiàn)，微生物存在于精液中，NOA男性的精液微生物與正常男性不同。然而，相關(guān)機制尚不清楚。

本篇為2023年1月，新鮮出爐~~由中山大學(xué)附屬第六醫(yī)院生殖醫(yī)學(xué)研究中心劉貴華主任醫(yī)師、楊星副主任醫(yī)師、梁曉燕教授（一作：陳培根博士）研究團隊，采用微生物16S測序、LC-MS非靶向代謝組學(xué)等研究方法，第一次詳細描述iNOA精液中的微生物-宿主關(guān)系。本研究是對iNOA治療和病因?qū)W研究的重要補充，也是非常重要的深度研究的基礎(chǔ)。

 

研究結(jié)論

本篇研究作者發(fā)現(xiàn)，iNOA組精漿微生物的組成和相互作用發(fā)生了變化。代謝物溯源分析和代謝途徑分析顯示，NOA組微生物異常與微生物降解降低、果糖或甘露糖代謝增加密切相關(guān)。此外，在iNOA中，男性精液中微生物與宿主的代謝關(guān)系揭示了這種微生物可以產(chǎn)生有害的代謝物，影響精子質(zhì)量，微生物與精子競爭必需營養(yǎng)素，它們的存在降低了精子必需營養(yǎng)素的產(chǎn)量。

DOI: 10.1128/spectrum.04365-22

 

鹿明生物L(fēng)C-MS非靶向代謝組學(xué)

鹿明生物多年從事蛋白組及代謝組質(zhì)譜檢測業(yè)務(wù)的專業(yè)質(zhì)譜組學(xué)服務(wù)公司。以“鹿明質(zhì)譜”服務(wù)品牌。

經(jīng)過多年發(fā)展，鹿明生物建立起了空間代謝組學(xué)、全譜代謝組、靶向代謝組、擬靶向代謝組、脂質(zhì)組、精準靶向等代謝組學(xué)技術(shù)平臺，以及相應(yīng)的大數(shù)據(jù)整合分析平臺。