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分子克隆技術中常見載體質(zhì)粒的分類及結(jié)構(gòu)原件

瀏覽次數(shù):2091 發(fā)布日期:2023-3-17  來源:absin

分子克隆技術運用的載體只要是指將DNA片段(目的基因)轉(zhuǎn)移至受體細胞的一種能自我復制的DNA分子工具。常見的載體主要有質(zhì)粒、噬菌體、病毒等。今天咱們要聊的主角是質(zhì)粒。


一、什么是質(zhì)粒?
 

天然質(zhì)粒是可獨立于染色體外可自行復制的環(huán)狀DNA分子,通常帶有一些基因,特別是一些與抗生素耐藥性有關的基因,可以在不同的細菌細胞之間傳遞。質(zhì)粒主要存在于細胞、古生菌及真核生物中,比較特殊的在植物的葉綠體和線粒體等胞器中也有出現(xiàn)。

研究報道指出質(zhì)粒也不全是環(huán)狀的哦!1984年,在Streptomyces coelicoler(天藍色鏈霉菌)等放線菌以及在Borrelia hermsii(赫氏蜱疏螺旋體)等原核生物中,又相繼發(fā)現(xiàn)線形質(zhì)粒;谫|(zhì)粒能夠攜帶基因,并且能夠在不同細胞中傳代基因的特性,質(zhì)粒被運用到分子克隆技術中。在分子克隆技術中運用的質(zhì)粒載體是在天然質(zhì)粒的基礎上為適應實驗室操作而進行人工改造得來,通常所用的是細菌載體質(zhì)粒。

它在分子克隆技術中的運用是將某種目標基因片段重組到質(zhì)粒中,構(gòu)成重組基因或重組體。將這種重組體經(jīng)微生物學的轉(zhuǎn)化技術,轉(zhuǎn)入受體細胞(如大腸桿菌)中,使重組體中的目標基因在受體菌中得以繁殖或表達,從而改變寄主細胞原有的性狀或產(chǎn)生新的物質(zhì)。

 

細菌質(zhì)粒是基因工程中最常用的載體,這些質(zhì)粒至少要有復制起點、篩選標記和克隆位點;A的部分我們都來詳細了解下。

 

二、質(zhì)粒結(jié)構(gòu)原件有哪些?



圖1 質(zhì)粒圖譜


1)復制起始位點(Origin of Replication,ORI)

ORI是一段DNA序列,質(zhì)粒復制的起始位置。DNA解螺旋酶可以作用于這段序列,然后DNA的雙鏈被分開,復制隨即開始。質(zhì)粒必須是能夠復制的,否則隨著細菌的生長,質(zhì)粒的數(shù)量將會被迅速稀釋。

 

2)抗生素抗性基因(Antibiotic Resistance Gene)

抗生素抗性基因存在作用是快速篩選。在含有抗生素的培養(yǎng)基中培養(yǎng)細菌,能夠生長的就是含有目的質(zhì)粒,不含質(zhì)粒的細菌已經(jīng)被“殺死”了。

 

3)篩選標記(Selectable Marker)

篩選已經(jīng)成功攝取質(zhì)粒的細胞。該篩選標記需要區(qū)別于細菌中的抗性篩選。細菌抗性基因篩選用于質(zhì)粒擴增過程,篩選標記用于篩選或標記轉(zhuǎn)染后的細胞。篩選標記通常是抗性篩選或者熒光蛋白。

 

4)啟動子(Promoter)

啟動子是能夠使基因進行轉(zhuǎn)錄的一段DNA序列。啟動子可以被RNA聚合酶辨別,并開始轉(zhuǎn)錄。啟動子常位于目的基因上游100-1000bp位置處,是質(zhì)粒非常重要的一個元件,它決定著目的基因可以在何種細胞中進行表達,也決定蛋白質(zhì)的表達量。

 

5)多克隆位點(Multiple Cloning Site, MCS)

多克隆位點是一段短DNA片段,包括多個限制性酶切的單一位點,便于外源基因的插入。一般來說,外源DNA片段越長,越難插入,越不穩(wěn)定,轉(zhuǎn)化效率越低。在表達型質(zhì)粒中,MCS常處于啟動子的后面。

 

6)引物結(jié)合位點(Primer Binding Site)

引物結(jié)合位點為一小段DNA片段,用來進行質(zhì)粒的PCR擴增或者測序。

 

7)插入片段(Inserted Gene)

插入片段又稱為外源性基因,是克隆到MCS中的基因、啟動子或其他DNA片段,通常是人們所希望研究的遺傳元件。


三、質(zhì)粒的分類有哪些?
 

1)表達質(zhì)粒:用于基因表達(基因功能的研究)。表達載體必須包含啟動子、轉(zhuǎn)錄終止子序列和插入基因。啟動子驅(qū)動插入DNA轉(zhuǎn)錄生成RNA,合成的RNA上的終止子序列發(fā)出停止轉(zhuǎn)錄過程的信號。表達載體可以通過增強子序列增加蛋白質(zhì)或RNA的產(chǎn)量。表達載體可以在各種細胞類型(哺乳動物、酵母、細菌等)中驅(qū)動表達,這在很大程度上取決于用于啟動轉(zhuǎn)錄的啟動子。

 

2)克隆質(zhì)粒:用于促進DNA片段的克隆?寺≥d體往往非常簡單,通常只包含細菌抗性基因、復制起點和MCS。

 

3)報告質(zhì)粒:用于研究遺傳元件的功能。這些質(zhì)粒包含一個報告基因(例如,熒光素酶或GFP),可提供遺傳元件活性的讀數(shù)。

 

4)病毒質(zhì)粒:通過修飾的病毒基因組,有效地將遺傳物質(zhì)遞送到靶細胞中?梢允褂眠@些質(zhì)粒來制造病毒顆粒,例如慢病毒、逆轉(zhuǎn)錄病毒、AAV或腺病毒顆粒,從而高效感染靶細胞。

 

5)基因敲減質(zhì)粒:用于減少內(nèi)源基因的表達。通過表達靶向目的基因mRNA的shRNA來實現(xiàn)。這些質(zhì)粒具有可以驅(qū)動短 RNA 表達的啟動子。

 

6)基因工程質(zhì)粒:用于靶向和編輯基因組。通常使用CRISPR技術完成。

來源:愛必信(上海)生物科技有限公司
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