靶向代謝組學(xué)和轉(zhuǎn)錄組學(xué)應(yīng)用于植物對抗鹽脅迫的機制
瀏覽次數(shù):1087 發(fā)布日期:2023-3-9
來源:中科新生命
植物經(jīng)常在根際中招募微生物以改善其適應(yīng)性,同時應(yīng)對非生物脅迫。叢枝菌根(AM)真菌與大多數(shù)陸地植物形成互利共生關(guān)系,并提高寄主植物對不利環(huán)境的適應(yīng)力。棗是一種典型的AM共生木本物種,已知其AM根在野外條件下廣泛發(fā)育。然而,它們對鹽脅迫的適應(yīng)仍然未知。2022年5月,西北農(nóng)林科技大學(xué)黃建課題組在Plant Physiology(IF 8.005)上發(fā)表 “Mycorrhizal symbiosis reprograms ion fluxes and fatty acid metabolism in wild jujube during salt stress”的研究文章,作者利用靶向代謝組學(xué)和轉(zhuǎn)錄組學(xué)揭示了AM促進棗對抗鹽脅迫的機制,提示了AM提高共生宿主離子穩(wěn)態(tài)和調(diào)控宿主脂肪酸(FA)代謝以對抗鹽脅迫的新方向。中科新生命參與了該研究中靶向代謝組(植物激素、脂肪酸)檢測的相關(guān)工作。
研究材料
野生型根瘤菌接種與非菌根(NM)野生棗幼苗 、K+攝取缺陷的酵母突變菌株
技術(shù)路線
步驟1:觀察AM共生對鹽處理的生理反應(yīng);
步驟2:分析鹽脅迫下AM共生對宿主離子通量及離子穩(wěn)態(tài)的影響;
步驟3:靶向代謝分析AM共生調(diào)控宿主的植物激素水平和FA含量;
步驟4:轉(zhuǎn)錄組解析AM共生影響宿主的轉(zhuǎn)錄調(diào)控;
步驟5:分析鹽脅迫和AM共生對宿主離子通道/轉(zhuǎn)運及FA相關(guān)基因的調(diào)控。
研究結(jié)果
1. AM提高宿主幼苗的耐鹽性結(jié)果顯示,相比于NM,AM共生情況下幼苗的鹽脅迫效應(yīng)更弱。此外發(fā)現(xiàn),AM共生顯著提高了鹽脅迫下宿主的生物量、凈光合速率和抗氧化系統(tǒng)。
圖1 AM共生對鹽處理的生理反應(yīng)
2. AM共生促進鹽脅迫下的離子穩(wěn)態(tài)和根尖離子通量
鹽脅迫下AM和NM幼苗均積累了更高濃度的Na+,然而相較于NM,AM共生促進了幼苗在鹽脅迫下的K+的積累量,進而保持了較高的K+/Na+比值。AM共生同時也促進了幼苗磷水平的提高。因此,AM共生增加了宿主對鹽脅迫的適應(yīng),主要是通過增強磷和鉀的獲得來促成的。此外,通量變化結(jié)果顯示,鹽脅迫下AM共生提高了H+和Ca2+的外排、降低了K+的外排。這些結(jié)果提供了AM共生維持K+ / Na+的證據(jù)。
圖2 AM共生改變宿主離子通量
3. AM提高共生植物的生長激素與FA含量
植物激素有助于協(xié)調(diào)植物對不利條件的反應(yīng),也是菌根建立和功能發(fā)揮的介質(zhì)。為了研究鹽脅迫下AM共生對植物激素水平的調(diào)控,作者使用靶向代謝組對AM/NM幼苗的葉片和根部進行分析。AM共生誘導(dǎo)了以下顯著影響:在鹽脅迫期間,AM幼苗葉片吲哚-3-乙酸(IAA)增加、根部IAA降低;鹽處理使AM根部的脫落酸(ABA)顯著升高;鹽脅迫顯著提高了AM植株葉片中水楊酸(SA)、反式玉米素(tZ)、異戊烯腺嘌呤(iP)和異戊烯腺苷核苷(iPR)的含量。在菌根互惠共生關(guān)系中,宿主植物主要以FA為主要碳源的形式提供給共生真菌,AM共生對宿主植物根系的FA代謝和轉(zhuǎn)運過程進行了廣泛的調(diào)控。靶向代謝組結(jié)果表明,發(fā)現(xiàn)AM共生同時提高了幼苗根系和葉片的FA含量,尤其是棕櫚酸(C16:0)、油酸(C18:1N9)、反式油酸(C18:1TN9)、亞油酸(C18:2N6)。類似的結(jié)果在楊樹和苜蓿中得到證實,表明AM共生提升了葉子和根部的FA,這是AM植物的保守生理效應(yīng)。
圖3 靶向代謝組分析AM共生調(diào)節(jié)宿主激素和FA水平
4. 轉(zhuǎn)錄組發(fā)現(xiàn)與AM共生相關(guān)基因
為了進一步研究AM共生促進宿主抗鹽的機制,作者對AM/NM幼苗的葉片和根系進行了轉(zhuǎn)錄組分析。加權(quán)基因共表達網(wǎng)絡(luò)分析(WGCNA)分析結(jié)果的模塊-性狀關(guān)系證明了清晰的組織效應(yīng)和AM效應(yīng)。其中有兩個模塊在鹽脅迫下與AM共生幼苗的根系特異性相關(guān)。KEGG富集分析表明上述兩個模塊主要參與了FA代謝和生物合成、生物素代謝、植物激素信號轉(zhuǎn)導(dǎo)、SNARE相互作用和甘油磷脂代謝途徑,高度對應(yīng)于AM共生。
圖4脅迫下NM和AM幼苗的WGCNA
5. 離子通道/轉(zhuǎn)運蛋白受鹽脅迫和AM共生調(diào)控
轉(zhuǎn)錄組結(jié)果顯示,AM共生顯著提高磷轉(zhuǎn)運相關(guān)基因(ZjPHT1)、K+轉(zhuǎn)運蛋白(ZjHAK2)基因、Shaker類K+通道蛋白(SKORs)基因、質(zhì)膜型ATP酶(ZjAHA7)的表達。這些結(jié)果證明AM共生通過激活了質(zhì)膜型ATP酶來增強H+的外排,同時與ZjHAK2表達協(xié)調(diào)以促進K+的流入。這些K+轉(zhuǎn)運/通道蛋白共同調(diào)節(jié)AM宿主的離子穩(wěn)態(tài),同時應(yīng)對鹽脅迫。該實驗中,作者K+吸收缺陷型酵母菌株R5421證明了ZjHAK2具有K+ 轉(zhuǎn)運活性。
圖5 ZjHAK2在酵母中的系統(tǒng)發(fā)育分析及功能鑒定
6. FA代謝相關(guān)基因受鹽脅迫和AM共生調(diào)控
接下來,作者鑒定了所有參與FA生物合成和運輸?shù)臐撛诨颉T贔As循環(huán)中,ZjACP2、ZjKASI2、ZjENR1和ZjKAR2強上調(diào),并特異性誘導(dǎo)ZjACP4表達。這些結(jié)果表明,AM共生極大地增強了FAS循環(huán)的活性。同樣,F(xiàn)A伸長和加工途徑、FA運輸途徑相關(guān)基因的表達在AM共生宿主中同樣被上調(diào)。所有上述結(jié)果證明FA代謝在AM共生中被顯著重編程。RT-qPCR驗證部分關(guān)鍵基因轉(zhuǎn)錄組結(jié)果的準(zhǔn)確性。
圖6 鹽處理過程中AM和NM幼苗FA生物合成、加工和運輸?shù)幕虮磉_譜
小結(jié)
該研究為菌根共生提高木本植物對鹽脅迫的適應(yīng)性提供了一個全面的認(rèn)識,闡明了AM共生提高宿主植物離子穩(wěn)態(tài)的機制,發(fā)現(xiàn)了AM共生調(diào)控宿主植物脂肪酸代謝的新效應(yīng)。
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