PAMP的特點為：
①PAMP代表分子結構，該結構只由微生物中的病原體所產(chǎn)生，非宿主產(chǎn)生，如革蘭陰性菌中的內(nèi)毒素、革蘭陽性菌的肽聚糖（peptidoglycan）和脂胞壁酸（lipoteichoic acid，LTA），以及支原體的甘露聚糖、甲酰化肽和細菌DNA中的CpG等。提高天然免疫系統(tǒng)中模式受體對PAMP的識別有助于天然免疫系統(tǒng)準確區(qū)別自我分子和病原體相關分子結構。

②PAMP代表病原體中保守的分子模式，該結構是微生物生存所必需的，如青霉素抑制肽聚糖合成后，細菌就無法生存。和肽聚糖的結構被選擇下來一樣，在天然免疫的進化中，作為識別的靶位，宿主的這種策略可防止“逃避突變”的產(chǎn)生。

③PAMP是為大多數(shù)微生物所共有的結構，所有細菌均含有肽聚糖和脂蛋白，LPS（脂多糖，lipopolysaccharide）和LTA的一般模式各自為所有革蘭陰性（G^-）菌和革蘭陽性（G⁺）菌所共有，PAMP的特點是只準許非常有限的識別受體去識別多樣化的微生物。

④PAMP代表著病原體種類的“分子簽名（molecular sig-nature）”，如LPS代表G^-菌，LTA代表G⁺菌，脂阿拉伯甘露聚糖代表分枝桿菌，甘露聚糖代表支原體。對這些PAMP的識別，不僅顯示感染的存在，而且能夠提供侵入的病原體的類型，有利于宿主采取更有效的效應機制去應付病原體。

具體的PAMP分子有革蘭陰性菌中的內(nèi)毒素、革蘭陽性菌的肽聚糖（peptidoglycan）和脂胞壁酸、細菌DNA中的CpG島以及支原體的甘露聚糖和甲酰化肽等。結核桿菌的脂阿拉伯甘露聚糖（lipoaramannan，LAM）、螺旋體的脂蛋白、支原體的甘露聚糖和脂蛋白以及自身病變或壞死組織和細胞所誘發(fā)的物質可以作為內(nèi)源性配體，還有如熱休克蛋白90和熱休克蛋白60等。不同的配體模式識別方式缺乏病原體的特異性，針對病原體的共同保守結構，更有利于宿主發(fā)揮免疫效應，刺激特異性免疫應答。