脂多糖耐受的分子機(jī)制可能涉及CD14表達(dá)的調(diào)節(jié)。在對(duì)髓性細(xì)胞用脂多糖刺激后，mCD14 mRNA在3~6h下調(diào)，同早期內(nèi)毒素耐受的發(fā)生和發(fā)展相吻合；另一方面，15h后內(nèi)毒素耐受的CD14表達(dá)上升，但在單核細(xì)胞上大多數(shù)CD14分子對(duì)脂多糖介導(dǎo)的信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)并不是必需的，即“空置受體效應(yīng)”。

內(nèi)毒素耐受的分子基礎(chǔ)包括許多脂多糖信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)的下游分子參與，其中最為重要的是近來(lái)才認(rèn)識(shí)的TLR4分子，在對(duì)RAW264-7細(xì)胞用內(nèi)毒素刺激后，TLR4mRNA水平下調(diào)。另外，白細(xì)胞介素-1相關(guān)激酶（interleukin-1 receptor-associated kinase，IRAK）的參與、I-κB上調(diào)及p50同源二聚體占主導(dǎo)地位等因素也參與內(nèi)毒素耐受。

在炎癥反應(yīng)中也有部分具有生物學(xué)活性的介質(zhì)分泌，如IL-4、IL-10、PGE₂、巨噬細(xì)胞趨化蛋白-1(macrophage chemoattractant protein-1，MCP-1)、糖皮質(zhì)激素等，這些介質(zhì)具有抗炎的特性，能夠在病原體清除后使炎癥反應(yīng)下調(diào)。這些起負(fù)反饋?zhàn)饔玫慕橘|(zhì)合成不協(xié)調(diào)可能在敗血癥發(fā)生中起重要作用。