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如何有效避免無處不在的PCR污染

瀏覽次數(shù):834 發(fā)布日期:2023-1-3  來源:本站 僅供參考,謝絕轉(zhuǎn)載,否則責(zé)任自負(fù)

前言

在PCR檢測過程中,不可否認(rèn)的是,沒有任何檢測是100%準(zhǔn)確的,比如我們可能也曾聽過假陽性這個(gè)名詞,那為什么會(huì)出現(xiàn)假陽性呢?這其實(shí)跟實(shí)驗(yàn)操作過程造成的污染相關(guān),在實(shí)驗(yàn)開展過程中,主要有4種污染途徑:標(biāo)本間交叉污染、PCR試劑污染、PCR擴(kuò)增產(chǎn)物污染、實(shí)驗(yàn)室克隆質(zhì)粒污染。

如何對(duì)污染進(jìn)行監(jiān)測?

1. 陽性對(duì)照

在建立PCR實(shí)驗(yàn)室及一般的檢驗(yàn)單位都應(yīng)設(shè)有PCR陽性對(duì)照,它是PCR 反應(yīng)是否成功、產(chǎn)物條帶位置及大小是否符合理論要求的一個(gè)重要的參考標(biāo)志,陽性對(duì)照要選擇擴(kuò)增度中等、復(fù)性好,經(jīng)各種鑒定是該產(chǎn)物的標(biāo)本,如以重組質(zhì)粒為陽性對(duì)照,其含量宜低不宜高(100個(gè)拷貝以下),但陽性對(duì)照尤其是重組質(zhì)粒及高濃度陽性標(biāo)本,其對(duì)檢測或擴(kuò)增樣品污染的可能性很大,因而當(dāng)某一PCR試劑經(jīng)自己使用穩(wěn)定,檢驗(yàn)人員心中有數(shù)時(shí),在以后的實(shí)驗(yàn)中可免設(shè)陽性對(duì)照。

2. 陰性對(duì)照

每次PCR試驗(yàn)務(wù)必做陰性對(duì)照,它包括:①標(biāo)本對(duì)照,被檢標(biāo)本是血清就用鑒定后的正常血清做對(duì)照,被檢的標(biāo)本是組織細(xì)胞就用相應(yīng)的組織細(xì)胞做對(duì)照;②試劑對(duì)照,在PCR試劑中不加模板DNA或RNA,進(jìn)行PCR擴(kuò)增,以檢測試劑是否污染。

3. 重復(fù)性實(shí)驗(yàn)

4. 選擇不同區(qū)域的引物進(jìn)行PCR擴(kuò)增

如何避免PCR污染?

實(shí)驗(yàn)室防污染是重中之重,畢竟影響最終檢測結(jié)果,那么我們有哪些防污染的方法呢?

除了注意避免人工操作引入的污染,我們?cè)趯?shí)驗(yàn)時(shí)應(yīng)設(shè)立適當(dāng)?shù)年栃詫?duì)照和陰性對(duì)照,陽性對(duì)照以能出現(xiàn)擴(kuò)增帶的最低量的標(biāo)準(zhǔn)病原體核酸為宜,并注意交叉污染的可能性,每次反應(yīng)都應(yīng)由一管不加模板的試劑對(duì)照及相應(yīng)不含有被擴(kuò)增核酸的樣品作陰性對(duì)照。同時(shí)減少PCR循環(huán)次數(shù),PCR產(chǎn)物達(dá)到檢測水平就適可而止。

來源:艾普拜生物科技(蘇州)有限公司
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