細(xì)胞凋亡或程序性細(xì)胞死亡發(fā)生在生物體胚胎發(fā)育過(guò)程中以消除不需要的細(xì)胞,或者發(fā)生在成年人的愈合過(guò)程中,以消除身體的受損細(xì)胞,幫助預(yù)防癌癥。用多孔板進(jìn)行的Caspase檢測(cè)實(shí)驗(yàn)使研究人員能夠研究細(xì)胞凋亡的早期階段。在這篇文章中,我們展示了MICA如何與熒光多孔板測(cè)定一起應(yīng)用,以提供100%時(shí)空相關(guān)性的數(shù)據(jù),并將串?dāng)_降至最低。
U2OS細(xì)胞在加入細(xì)胞凋亡誘導(dǎo)劑星形孢菌素后,在13小時(shí)延時(shí)成像過(guò)程中拍攝標(biāo)記了SiR Actin、TMRE、CellEvent™和DAPI的圖像。
熒光檢測(cè)的基礎(chǔ)知識(shí)
多孔板對(duì)于需要更高通量的實(shí)驗(yàn)非常有用。它們能讓用戶收集384、96或24個(gè)不同的平行實(shí)驗(yàn)(或樣品)的數(shù)據(jù)
[1],F(xiàn)代檢測(cè)試劑盒通常用熒光探針或染料來(lái)標(biāo)記感興趣的蛋白,然后再用熒光顯微鏡對(duì)每個(gè)孔板中熒光標(biāo)記的樣品進(jìn)行分析
[2,3]。高通量的熒光多孔板檢測(cè)在神經(jīng)科學(xué)、癌癥研究和發(fā)育生物學(xué)等領(lǐng)域的很多實(shí)驗(yàn)中都有廣泛的應(yīng)用。幸運(yùn)的是,許多這類熒光檢測(cè)的試劑盒在市場(chǎng)上可以買到,這有助于大大簡(jiǎn)化樣品制備,為用戶節(jié)省大量的時(shí)間和精力。
細(xì)胞凋亡和Caspase蛋白
細(xì)胞凋亡或程序性細(xì)胞死亡發(fā)生在生物體胚胎發(fā)育過(guò)程中以消除不需要的細(xì)胞,或在成年人的愈合過(guò)程中消除身體的受損細(xì)胞,幫助預(yù)防癌癥
[4-6]。Caspases家族(含半胱氨酸的天冬氨酸蛋白水解酶)是一個(gè)大型的半胱氨酸蛋白酶家族,在細(xì)胞凋亡的啟動(dòng)和執(zhí)行中起著重要作用
[5,6]。啟動(dòng)型caspases幫助啟動(dòng)細(xì)胞凋亡,而執(zhí)行型caspases進(jìn)行大量蛋白水解。Caspase-3和caspase-7都是執(zhí)行者型caspases
[5,6,7]。caspase-3在細(xì)胞凋亡過(guò)程中有協(xié)調(diào)細(xì)胞結(jié)構(gòu)破壞的作用,而caspase-7有細(xì)胞脫離的作用
[7]。
Caspase測(cè)定法
Caspase檢測(cè)可以研究細(xì)胞凋亡的早期階段。在這里,我們研究了caspase-3和capase-7被細(xì)胞毒性藥物(如星形孢菌素)激活的劑量依賴性。為了消除隨機(jī)效應(yīng),在相同的條件下用不同濃度的一種藥物或多種藥物的組合,對(duì)多個(gè)檢測(cè)樣本進(jìn)行了研究。具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義的結(jié)果通常需要重復(fù)實(shí)驗(yàn)數(shù)次。
Caspase檢測(cè)中的挑戰(zhàn)
caspase檢測(cè)透露的主要是caspase激活級(jí)聯(lián)開(kāi)始時(shí)的信息。然而,關(guān)于單個(gè)細(xì)胞的其他形態(tài)學(xué)或激活反應(yīng)的問(wèn)題仍未得到解答。Caspase檢測(cè)中加入更多的熒光染色劑可以獲得更多的信息,例如在凋亡過(guò)程中的細(xì)胞骨架行為或細(xì)胞色素c介導(dǎo)的凋亡小體的組裝導(dǎo)致caspase-3和caspase-7切割途徑的激活
[8]。在caspase檢測(cè)中要快速收集所有熒光標(biāo)簽的信號(hào),從而實(shí)現(xiàn)在規(guī)定時(shí)間間隔獲取整個(gè)樣本板上的數(shù)據(jù),可能是很困難的。其次,很難快速并可靠地分離多達(dá)四個(gè)熒光標(biāo)簽的信號(hào)。最后,如果數(shù)據(jù)的獲取與caspase活性的檢測(cè)不是同步的,它們就不直接相關(guān)。
由于這些挑戰(zhàn),在進(jìn)行caspase測(cè)定,特別是在結(jié)合額外的標(biāo)記以獲得更多信息時(shí),常常會(huì)有一些擔(dān)憂。激活反應(yīng)前后和形態(tài)學(xué)數(shù)據(jù)可能會(huì)丟失或沒(méi)有時(shí)空即位置和時(shí)間方面的相關(guān)性。另外,熒光標(biāo)簽之間的串?dāng)_也會(huì)導(dǎo)致對(duì)結(jié)果的誤解。
目前,大量的研究實(shí)驗(yàn)室可能沒(méi)有現(xiàn)成的用于這些檢測(cè)工作的所有儀器和顯微鏡。這個(gè)問(wèn)題通常通過(guò)使用多個(gè)研究小組和用戶的共享設(shè)備來(lái)解決,但這意味著可能需要很長(zhǎng)時(shí)間才能獲得所需的儀器。
這些挑戰(zhàn)可能導(dǎo)致延遲獲得重要的、可量化的結(jié)果,而這些結(jié)果會(huì)影響根本性突破和獲得新的見(jiàn)解。
Mica介紹
Mica是全場(chǎng)景顯微成像分析平臺(tái),它將研究人員需要的一切都統(tǒng)一在一個(gè)完全可控的、高度靈活的環(huán)境中,加速顯微鏡的工作流程,以便更快地獲得有意義的科學(xué)結(jié)果。通過(guò)使用這個(gè)顯微成像分析平臺(tái),您可以從以下方面受益:
人人皆享:即使是沒(méi)有經(jīng)驗(yàn)的用戶也能用MICA輕松設(shè)置復(fù)雜的檢測(cè)讀數(shù)。
觸手可及:MICA使得用戶能同時(shí)對(duì)4個(gè)標(biāo)記進(jìn)行成像,具有100%的時(shí)空相關(guān)性。
極致簡(jiǎn)化工作流程:MICA對(duì)4個(gè)標(biāo)記的同時(shí)采集以及后續(xù)AI驅(qū)動(dòng)的數(shù)據(jù)分析都顯著減少了工作流程步驟。
方法
MICA用于熒光多孔板檢測(cè)來(lái)研究caspase-3和caspase-7在激活凋亡中的作用(圖1)。制備U2OS細(xì)胞相關(guān)樣品,最后用星形孢菌素處理以誘導(dǎo)細(xì)胞凋亡。本實(shí)驗(yàn)有多個(gè)與凋亡早期階段相關(guān)的讀數(shù)。
結(jié)果
圖1結(jié)果顯示了星形孢菌素誘導(dǎo)的caspase-3和caspase-7的激活,在此之前是應(yīng)力纖維的形成和線粒體膜電位的耗盡。
圖1:圖中顯示了實(shí)驗(yàn)工作流程和caspase檢測(cè)的結(jié)果。
用MICA實(shí)現(xiàn)了4種熒光標(biāo)記物的絕對(duì)時(shí)空相關(guān)性,由此可以對(duì)凋亡誘導(dǎo)的早期進(jìn)行監(jiān)測(cè)(參考視頻1和圖2)。觀察到應(yīng)力纖維的形成與caspase-3和caspase-7激活開(kāi)始時(shí)線粒體膜電位的喪失相吻合。DNA凝結(jié)直接跟隨caspase激活。
視頻 1:U2OS細(xì)胞在63倍寬場(chǎng)模式下采集13小時(shí)的延時(shí)拍攝視頻。A) 細(xì)胞用SiR-Actin、TMRE(63倍放大,線粒體活性)、CellEvent™(caspase活性)和DAPI(細(xì)胞核)標(biāo)記。在t0加入凋亡誘導(dǎo)劑星形孢菌素。
圖2:同一數(shù)據(jù)集,每列顯示單個(gè)時(shí)間點(diǎn),每行顯示單個(gè)標(biāo)記。
圖3為傳統(tǒng)寬場(chǎng)顯微鏡和MICA的時(shí)空多色采集對(duì)比。熒光標(biāo)記的同步檢測(cè)在研究線粒體動(dòng)力學(xué)時(shí),消除了觀察線粒體結(jié)構(gòu)和膜電位時(shí)的時(shí)空偽影。使用傳統(tǒng)寬場(chǎng)成像時(shí),由序列采集產(chǎn)生的時(shí)空偽影會(huì)使測(cè)量結(jié)果失真,并影響結(jié)構(gòu)和功能的相關(guān)性。MICA的FluoSync技術(shù)能同時(shí)采集并確保時(shí)空相關(guān)性,采集時(shí)沒(méi)有偽影,膜電位與線粒體結(jié)構(gòu)正確相關(guān)。
圖3:MICA的63x/1.2 W PL Apo CS2 SmartCORR物鏡在寬場(chǎng)模式下拍攝的用MitoTracker™綠色(青色)和四甲基羅丹明乙酯(TMRE,品紅)染色的U2OS細(xì)胞圖像。A) 序列采集MitoTracker™綠色通道和TMRE通道,其中裁剪圖像顯示由于序列采集兩個(gè)通道之間出現(xiàn)了時(shí)空偏移。B)同時(shí)采集MitoTracker™綠色通道和TMRE通道,裁剪的圖像顯示兩個(gè)通道之間沒(méi)有任何時(shí)空偏移。兩個(gè)通道保持共定位,并能夠?qū)γ總(gè)MitoTracker™綠色結(jié)構(gòu)(線粒體結(jié)構(gòu))中的TMRE信號(hào)(線粒體膜電位)進(jìn)行量化測(cè)量。比例尺為5µm。
與傳統(tǒng)的寬場(chǎng)顯微鏡不同的是Mica FluoSync[10]可以同時(shí)進(jìn)行4色標(biāo)簽成像、寬光譜譜檢測(cè)和拆分[9] (參加圖4)。
圖4:A) 傳統(tǒng)寬場(chǎng)4色熒光成像使用帶通熒光發(fā)射濾波器:結(jié)果是染料分離度差,導(dǎo)致定位精度低,切斷信號(hào)式減少串?dāng)_,序列成像慢。B) 帶FluoSync技術(shù)的MICA可以同時(shí)進(jìn)行4個(gè)標(biāo)簽的成像,寬光譜檢測(cè)和拆分[9]進(jìn)行真正的染料分離,以及4倍的同時(shí)成像速度。
參考資料
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- J.G. Walsh, S.P. Cullen, C. Sheridan, A.U. Lüthi, C. Gerner, S.J. Martin, Executioner caspase-3 and caspase-7 are functionally distinct proteases, PNAS (2008) vol. 105, no. 35, pp. 12815-12819; DOI: 10.1073/pnas.0707715105.
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- F. Cutrale, S.E. Fraser, A New Method for Convenient and Efficient Multicolor Imaging: Interview, Science Lab (2022) Leica Microsystems.
- FluoSync - a Fast & Gentle Method for Unmixing Multicolour Images: A streamlined approach for simultaneous multiplex fluorescent imaging using a single exposure, Science Lab (2022) Leica Microsystems.
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