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“質(zhì)譜血漿蛋白質(zhì)組”+“三角法”實現(xiàn)生物標志物開發(fā)

瀏覽次數(shù):936 發(fā)布日期:2022-11-14  來源:中科新生命

三角法介紹
 
傳統(tǒng)的“三角法”旨在于小隊列中發(fā)現(xiàn)大量候選的生物標志物,然后在更大的驗證隊列中進行下一步的驗證和確證,隊列數(shù)量從少到多,而篩選的蛋白質(zhì)標志物的數(shù)量從數(shù)百或數(shù)千減少到只有少數(shù)幾個,具體步驟如下。


文章:A pipeline that integrates the discovery and verification of plasma protein biomarkers reveals candidate markers for cardiovascular disease
期刊:nature biotechnology
影響因子:68.164

研究背景:截至當時,使用蛋白質(zhì)組學鑒定的蛋白質(zhì)生物標志物僅停留在科研階段,尚未被應(yīng)用于臨床。
內(nèi)容簡介:開發(fā)了一個整合蛋白質(zhì)組學技術(shù)的研究路徑,從血漿生物標志物的發(fā)現(xiàn)到驗證,并將其應(yīng)用于臨床,作為識別PMI患者心臟損傷的早期生物標志物。在受控心肌損傷的不同階段,從患者心臟中采集血液,以確保候選生物標志物的富集,并允許患者作為自己的生物對照。LC-MS/MS分析檢測到121個高度差異表達的蛋白,包括先前證實的心血管疾病標志物和>100個心肌梗死(MI)的新候選生物標志物。通過對外周血漿樣本進行靶向質(zhì)譜檢測,來篩選候選標志物。通過PRM或免疫分析,對不同組別(對照組和PMI/自發(fā)性MI患者)的外周血漿進行分析,表明候選生物標志物可能是MI的特異性標志物。

技術(shù)路線:
 

文章:Plasma Proteomics Identify Biomarkers and Pathogenesis of COVID-19
期刊:immunity
影響因子:43.474

研究背景:2019冠狀病毒(COVID-19)大流行是一場全球公共衛(wèi)生危機。然而,對COVID-19的發(fā)病機制和生物標志物知之甚少。
內(nèi)容簡介:通過對新冠肺炎病亡、重癥、輕癥患者的血漿蛋白質(zhì)組學進行系統(tǒng)性分析,揭示了不同臨床結(jié)局患者的血漿蛋白質(zhì)在疾病進展的不同階段發(fā)生了大量獨特的變化。此外,基于機器學習,獲得了用于預(yù)測患者不同臨床結(jié)局的11種蛋白標志物,并通過獨立隊列進行驗證和確證。

技術(shù)路線:


小編小結(jié)
 “三角法”+“血液質(zhì)譜蛋白質(zhì)組學”強強聯(lián)合,目前已可對血液蛋白質(zhì)組進行深度檢測,并獲得有效、科學的生物標志物,有望實現(xiàn)臨床科研的轉(zhuǎn)化,再次推進國內(nèi)精準醫(yī)療的進程。
 
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來源:上海中科新生命生物科技有限公司
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