多重PCR概述
多重PCR(multiplex PCR),又稱多重引物PCR或復(fù)合PCR,它是在同一PCR反應(yīng)體系里加上二對以上引物,同時擴(kuò)增出多個核酸片段的PCR反應(yīng),其基本原理與常規(guī)PCR相同,區(qū)別在于多重PCR反應(yīng)體系加入一對以上引物,各對引物分別結(jié)合在模板相對應(yīng)部位,最終擴(kuò)增出一條以上目的DNA片段。
多重PCR的特點
•高效性:在同一PCR反應(yīng)管內(nèi)同時檢出多種基因,或?qū)τ卸鄠型別的目的基因進(jìn)行分型,特別是微量樣本的多基因檢測。
•系統(tǒng)性:多重PCR適宜于成組病原體的檢測,如肝炎病毒,腸道致病性細(xì)菌,性病,無芽胞厭氧菌,戰(zhàn)傷感染細(xì)菌及細(xì)菌戰(zhàn)劑的同時偵檢。
•經(jīng)濟(jì)簡便性:多種病原體在同一反應(yīng)管內(nèi)同時檢出,將大大的節(jié)省時間,節(jié)省試劑,節(jié)約經(jīng)費開支。
多重PCR應(yīng)用
•基因診斷、腫瘤診斷、病原微生物的檢測。
•基因分型、連鎖分析。
•植物分子育種、基因表達(dá)檢測、病蟲害檢測。
•病原菌污染檢測。
•區(qū)域捕獲測序。
多重PCR之難
多重PCR并不是單純的將多對特異性引物混合成一個體系。多重PCR之所以難,在于多個靶點之間擴(kuò)增條件不兼容,每個靶點都需要旁邊其他的引物配合。
就像是三人兩足游戲一樣,每個靶點成功擴(kuò)增都是需要綁在一起的兩個人(一對引物)默契配合。而多重PCR就需要所有的選手同時起跑又同時到達(dá),并且所有的選手都達(dá)到最優(yōu)發(fā)揮。
多重PCR優(yōu)化
為了達(dá)到更好的擴(kuò)增效果,一般可以通過以下幾個方面進(jìn)行優(yōu)化。
◆引物的優(yōu)化:
◆反應(yīng)體系:
◆反應(yīng)條件:
◆常見問題解決辦法:
多重PCR要求在同一反應(yīng)體系內(nèi)對多個位點進(jìn)行特異性擴(kuò)增。因而引物間的配對與競爭性擴(kuò)增均會影響擴(kuò)增效果。如果能選擇合適的反應(yīng)體系、反應(yīng)條件以及更合適的PCR儀,則有望提高多重PCR的擴(kuò)增效果。所以在進(jìn)行多重PCR的時候,不應(yīng)墨守成規(guī),要根據(jù)自身實驗情況對實驗條件進(jìn)行不斷優(yōu)化,達(dá)到最佳擴(kuò)增效果。