近日,Nature Reviews Clinical Oncology(IF 65.011)在線發(fā)表了 “Nano-omics: nanotechnology-based multidimensional harvesting of the blood-circulating cancerome”,介紹了“納米組學(xué)”應(yīng)用于液體活檢的多種可能。中科新生命新推出的深度血液4D-DIA蛋白組基于納米富集+DIA全息掃描+ Spectronaut 16權(quán)威分析軟件,實(shí)現(xiàn)了血液中低豐度蛋白的2000+超高深度鑒定。
在生物液體孵化期,蛋白質(zhì)在納米顆粒表面的非靶向吸附被稱為“蛋白質(zhì)電暈”,該技術(shù)被用于篩選蛋白生物標(biāo)志物。納米顆粒與血液蛋白的結(jié)合親和性是由許多不同的因素決定的,包括納米顆粒的大小、表面電荷和功能化以及納米顆粒與生物流體的孵育條件。
血液樣本采用納米質(zhì)譜蛋白組學(xué)分析的實(shí)例研究
# 01
文獻(xiàn)名稱:Nano-Bio interactions in cancer: from therapeutics delivery to early detection
發(fā)表期刊:Accounts of Chemical Research(IF 24.466)
發(fā)表時間:2021年
檢測平臺:LC-MS/MS
樣本類型:血漿
研究內(nèi)容:該研究受NP-蛋白電暈特性的啟發(fā),開發(fā)了一種將多NP-蛋白電暈與質(zhì)譜相結(jié)合的Proteograph平臺,通過不同表面性質(zhì)的納米磁珠組合,用于對血漿蛋白組進(jìn)行深入分析。
(1)了解NP-蛋白冠的生物學(xué)特性,使納米醫(yī)學(xué)具有高效率;
(2)探索腫瘤病理生理特征,加速納米醫(yī)學(xué)轉(zhuǎn)化;
(3)利用納米表面和蛋白的相互作用,使大規(guī)模蛋白質(zhì)組學(xué)應(yīng)用于疾病診斷成為現(xiàn)實(shí)(引自Nature)。
# 02
文獻(xiàn)名稱:Rapid, deep and precise profiling of the plasma proteome with multi-nanoparticle protein corona
發(fā)表期刊:Nature Communications(IF 17.694)
發(fā)表時間:2020年
檢測平臺:LC-MS/MS
樣本類型:血漿
研究內(nèi)容:在該非小細(xì)胞肺癌分類試驗(yàn)中,通過5個NPs,在141個血漿樣本中檢測了2000多種蛋白質(zhì)。蛋白質(zhì)和NPs相互作用的精確定量使深度血液蛋白質(zhì)組學(xué)研究成為現(xiàn)實(shí)。
5NPs對早期NSCLC患者與健康人群的分類(n=141)
# 03
文獻(xiàn)名稱:Nano-scavengers for blood biomarker discovery in ovarian carcinoma
發(fā)表期刊:nano todany(18.962)
發(fā)表時間:2020年
檢測平臺:LC-MS/MS
樣本類型:血漿
研究內(nèi)容:通過脂質(zhì)納米顆粒-質(zhì)譜蛋白質(zhì)組學(xué)對晚期卵巢癌患者和健康捐贈者的血漿樣本進(jìn)行分析,鑒定出多種差異蛋白后又通過ELISA進(jìn)行靶向驗(yàn)證。
小編小結(jié)
納米質(zhì)譜蛋白組學(xué)作為目前創(chuàng)新血液蛋白質(zhì)組學(xué)的研究方法,其特殊的富集方式大大增加了血液樣本中低豐度蛋白的鑒定深度,可用于血液樣本的生物標(biāo)志物篩選,實(shí)現(xiàn)腫瘤液體活檢。