非靶代謝PLUS在腫瘤、代謝疾病、中醫(yī)藥研究等方面的應(yīng)用
瀏覽次數(shù):1649 發(fā)布日期:2022-6-28
來源:中科新生命
兩年助力近百篇高分項(xiàng)目文章的非靶代謝PLUS,升級了!
非靶plus
非靶代謝plus從發(fā)布至今已近兩年,參與已發(fā)表SCI文獻(xiàn)84篇,涵蓋腫瘤、代謝疾病、心血管、腸道微生物、中醫(yī)藥、環(huán)境、畜牧、食品等多個(gè)方向,總計(jì)IF > 520,其中多篇發(fā)表在Cell Metabolism, Diabetes Care, Circulation Research, Cell Reports, Journal of Experimental Medicine等Top期刊上。在此我們回顧產(chǎn)品運(yùn)行情況和實(shí)測結(jié)果并向各位老師介紹我們近期改善產(chǎn)品的一些措施。
1 產(chǎn)品介紹
非靶代謝組學(xué)plus是中科新生命推出的第二代非靶向代謝組學(xué)產(chǎn)品,利用高分辨率LC-MS/MS平臺對樣本中的代謝物進(jìn)行無偏向性檢測,將下機(jī)數(shù)據(jù)匹配本地自建代謝物數(shù)據(jù)庫(本地標(biāo)準(zhǔn)品庫+商業(yè)數(shù)據(jù)庫庫)實(shí)現(xiàn)代謝物鑒定,該產(chǎn)品包含從代謝物提取,上機(jī)檢測,生信分析全程流程非靶向代謝組學(xué)分析服務(wù)。
1.1 產(chǎn)品優(yōu)勢:
- 高質(zhì)量數(shù)據(jù)庫:本地初生標(biāo)準(zhǔn)品庫整合商業(yè)數(shù)據(jù)庫,數(shù)據(jù)均采集自高分辨率質(zhì)譜平臺,經(jīng)人工過濾一級、二級譜圖,RT(保留時(shí)間)矯正,代謝物鑒定水均在level 2以上;
- 高鑒定數(shù):3萬+代謝物數(shù)據(jù)庫,平均項(xiàng)目鑒定代謝物數(shù)量1200+,最高鑒定數(shù)量3271(Score>0.6);
- 數(shù)據(jù)可靠:自有實(shí)驗(yàn)室、儀器平臺和生信團(tuán)隊(duì),實(shí)驗(yàn)過程、原始數(shù)據(jù)全程可追溯;
- 免費(fèi)增值服務(wù):專業(yè)售前支持團(tuán)隊(duì)與售后項(xiàng)目管理團(tuán)隊(duì)保證您在售中與售后的體驗(yàn),數(shù)據(jù)支持APT-云平臺在線自助分析。
1.2 技術(shù)路線:
1.3 數(shù)據(jù)庫概覽:
1.4 數(shù)據(jù)庫構(gòu)成評價(jià):
基于該數(shù)據(jù)庫實(shí)測尿液樣本,并將結(jié)果與國際頂尖代謝組研究團(tuán)隊(duì)Fiehn實(shí)驗(yàn)室發(fā)布文獻(xiàn)中尿液代謝物類型構(gòu)成比較,發(fā)現(xiàn)結(jié)果可真實(shí)反應(yīng)生物樣本中的代謝物輪廓。
1.5數(shù)據(jù)庫定性能力評價(jià):
使用碳水化合物、氨基酸、核苷酸及功能代謝分子等數(shù)百種標(biāo)準(zhǔn)品Mix進(jìn)行非靶代謝plus分析,檢出率>90%,該數(shù)據(jù)獲得行業(yè)專家認(rèn)可。
非靶plus多次憑借精準(zhǔn)的定性能力,協(xié)助研究者鎖定關(guān)鍵代謝物分子及標(biāo)志物,助力TOP文獻(xiàn)發(fā)表。
合作項(xiàng)目中關(guān)鍵代謝物標(biāo)志物的匹配鏡像圖
2 產(chǎn)品回顧
非靶plus產(chǎn)品運(yùn)行期間,樣本覆蓋109個(gè)物種,涉及多種樣本類型。如下展示部分已經(jīng)交付的項(xiàng)目中物種、樣本類型及鑒定結(jié)果。
2.1 物種及樣本類型
臨床樣本
常見模式樣本
畜牧、水產(chǎn)、微生物及其它
2.2 部分項(xiàng)目代謝物定性數(shù)量展示:
圖 人源樣本定性結(jié)果展示
圖 特殊人源樣本定性結(jié)果展示
*歡迎與我們聯(lián)系,咨詢樣本經(jīng)驗(yàn)
3 產(chǎn)品升級
數(shù)據(jù)庫治理工作
近期我們以最新的KEGG代謝物數(shù)據(jù)庫信息為準(zhǔn),更新了本地?cái)?shù)據(jù)庫中的代謝物名稱及編號,提升了代謝plus結(jié)果中代謝物與KEGG通路數(shù)據(jù)庫對應(yīng)時(shí)的覆蓋度,避免了研究者在數(shù)據(jù)分析過程中,還需要校對各數(shù)據(jù)庫代謝物名稱再進(jìn)入各數(shù)據(jù)庫查詢的問題。
色譜體系升級
依靠大量項(xiàng)目積累,中科新生命完成了典型樣本的色譜條件優(yōu)化,針對細(xì)胞、組織、體液、糞便建立了不同的色譜體系,升級前后綜合提升了代謝物鑒定數(shù)量近15%。
4 合作文獻(xiàn)展示
*更多項(xiàng)目文章歡迎聯(lián)系我們
最后再次感謝廣大科研工作者對我們的信任,得以讓我們參與到如此眾多的科研工作中來,后續(xù)我們會繼續(xù)為大家提供高品質(zhì)的代謝組學(xué)服務(wù)。