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qPCR實(shí)驗(yàn)之核酸提取MIQE明確的要點(diǎn)詳解

瀏覽次數(shù):1390 發(fā)布日期:2022-6-22  來源:本站 僅供參考,謝絕轉(zhuǎn)載,否則責(zé)任自負(fù)

前言

MIQE是描述評(píng)估qPCR實(shí)驗(yàn)所需的最小信息,該指南是稿件投稿時(shí)需要同時(shí)提交的一個(gè)清單。通過作者提供相關(guān)的實(shí)驗(yàn)條件和實(shí)驗(yàn)特點(diǎn),審稿人可以評(píng)價(jià)實(shí)驗(yàn)所用方法的可靠性。另外提供詳細(xì)的實(shí)驗(yàn)所用試劑、序列和分析方法,其他研究人員可以利用這些信息進(jìn)行重復(fù)實(shí)驗(yàn)。

對(duì)于核酸提取MIQE有明確要求兩點(diǎn)——實(shí)驗(yàn)組與對(duì)照組的定義及每一組的樣本數(shù)量。

無論采用手工法還是試劑盒,只要符合MIQE的要求并實(shí)現(xiàn)良好的可操作性和重現(xiàn)性,就是合理客觀的技術(shù)方法。MIQE在該部分操作中的要求又分為兩大塊——樣本描述和核酸提取方法。


樣本描述

▶  樣本采集和處理的方法描述

▶ 樣本的來源描述(宏觀解剖還是激光顯微切割)

▶  樣本是如何即時(shí)處理(保存條件及時(shí)間)

▶  冷凍樣本的冷凍方法和時(shí)間


核酸提取

采取的提取方法:

1)手工法:小批量經(jīng)濟(jì)型

2)自動(dòng)化儀器:大批量高效型
 

按獲取的物質(zhì)可分為DNA和RNA:

◆ DNA:適合拷貝數(shù)變異、SNP分析等實(shí)驗(yàn)

◆ RNA:適合基因表達(dá)、長非編碼RNA等實(shí)驗(yàn)

圖源:網(wǎng)絡(luò),侵刪
 

按提取方法分為化學(xué)法和機(jī)械破碎法:

◆ 化學(xué)法:適合采用堿裂解法的樣本,質(zhì)粒提取、菌類的提取

◆ 機(jī)械破碎法:比較堅(jiān)硬有一定韌性的物質(zhì),動(dòng)植物組織

更推薦使用合適的商品化的核酸提取試劑盒,流程標(biāo)準(zhǔn)化程度更高,質(zhì)量更容易得到保證,這樣在方法描述時(shí)可以更簡單一些,直接引用試劑盒的生產(chǎn)廠家、貨號(hào)和名稱即可。


DNA酶或RNA酶的處理細(xì)節(jié):

基因表達(dá)實(shí)驗(yàn)中,RNA模板如果存在DNA污染,會(huì)嚴(yán)重干擾最后的結(jié)果。因此提取RNA時(shí)要加入DNA酶將DNA消化掉,工作濃度、處理溫度和時(shí)間要加以說明,同時(shí)也要加入RNase抑制劑提供保護(hù)。使用柱純化試劑盒提取RNA時(shí)也可以在柱上進(jìn)行DNA消化。同樣的,提取DNA時(shí)也要將RNA消化掉,盡管殘留RNA對(duì)DNA為模板的qPCR實(shí)驗(yàn)影響小得多。

 

 Cielo™實(shí)時(shí)熒光定量PCR系統(tǒng)

 

☑  數(shù)據(jù)可靠性:連續(xù)1000次實(shí)驗(yàn)后,結(jié)果高度一致。

☑  應(yīng)用靈活性:提供多種qPCR應(yīng)用分析。

☑  流程智能化:中英文用戶界面,觸控操作,可多機(jī)聯(lián)用。

☑  在線便捷性:主機(jī)可獨(dú)立運(yùn)行qPCR程序,數(shù)據(jù)可USB、Wi-Fi等網(wǎng)絡(luò)傳輸。

來源:艾普拜生物科技(蘇州)有限公司
聯(lián)系電話:0512--86860010
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