一、上樣量
通常Western Blot每孔上樣量為30-50μg,80%蛋白在細(xì)胞中的含量很低,當(dāng)?shù)鞍追肿恿窟^小時(shí),上樣量建議選擇50-100μg。畢竟對(duì) 于小分子的蛋白來說,在跑電泳時(shí),稍不留心,蛋白就跑沒影了。
二、凝膠電泳
1.選擇合適膠濃度。分子量小的蛋白,建議配置5%的濃縮膠,分離膠濃度參考下表。
分子量(kDa) |
分離膠濃度 |
X≤10 |
15% |
10 |
13.5% |
15 |
12% |
2.電泳電壓太大會(huì)導(dǎo)致跑在最前面的小分子蛋白成鋸齒狀,建議濃縮膠用80V 30分鐘,之后調(diào)成100V, 溴酚藍(lán)跑到距膠底1cm以上就停下,不要跑到底,否則目的蛋白可能跑出去了。
三、轉(zhuǎn)模
1.膜的選擇。免疫印跡中常用的固相材料有 NC 膜、DBM、DDT、尼龍膜、PVDF 膜等。推薦選用 PVDF 膜(聚偏二氟乙烯),因?yàn)榈鞍踪|(zhì)與 PVDF 膜以疏水力結(jié)合,從而將親水部位暴露到液相,使抗體更容易與之結(jié)合。
針對(duì)不同分子量的蛋白質(zhì),PVDF 膜有兩種規(guī)格:0.45 μm 的膜適合檢測(cè) MW > 20 kDa 的蛋白質(zhì),0.2 μm 的膜適合檢測(cè)MW < 20 kDa 的蛋白質(zhì),而且0.2 μm 的膜可以有效防止蛋白質(zhì)在轉(zhuǎn)移過程中直接穿透過膜。PVDF 膜使用之前需要在甲醇中浸泡 5min 后再轉(zhuǎn)入轉(zhuǎn)移液中,PVDF膜用甲醇泡的目的是為了活化PVDF膜上面的正電基團(tuán),使它更容易跟帶負(fù)電的蛋白質(zhì)結(jié)合。
2.轉(zhuǎn)膜方式。對(duì)于小分子蛋白,電流太大或時(shí)間太長容易轉(zhuǎn)過。轉(zhuǎn)膜采用濕轉(zhuǎn),條件參考下圖
分子量(kDa) |
轉(zhuǎn)膜條件 |
X≤10 |
恒流200mA,30min |
10 < X≤15 |
恒流200mA,40min |
15< X≤20 |
恒流200mA,50min |
3.轉(zhuǎn)膜前的平衡時(shí)間短點(diǎn),幾分鐘甚至1min就好。平衡所用的液體及轉(zhuǎn)膜液成份相同,都不要加SDS,效果是天壤之別。
四、轉(zhuǎn)膜后用麗春紅染色,測(cè)定蛋白豐度。
PVDF膜經(jīng)麗春紅染色后,可以檢測(cè)出樣品電泳過程中呈現(xiàn)印跡的大小,通過各個(gè)泳道上樣品印跡的對(duì)比,可以初步判斷上樣量的準(zhǔn)確性。
五、一抗的稀釋比例。
通?贵w的說明書上都會(huì)給出一定的稀釋比例對(duì)于分子量過小的蛋白來說,一抗應(yīng)選擇低的稀釋比例,這樣有助于抗體的結(jié)合。
六、顯影要把握曝光時(shí)間。
根據(jù)信號(hào)的強(qiáng)弱適當(dāng)調(diào)整曝光時(shí)間,如果在暗處馬上可以看到條帶,建議曝光時(shí)間在30s-2min內(nèi)完成,如果信號(hào)較弱,第一遍滴加顯影液后條帶不會(huì)很清晰,可以把膜拿出來放一邊讓它反應(yīng)一會(huì),然后再放回機(jī)器里面,重新滴加顯影液顯影,效果就會(huì)好不少。還有適當(dāng)延長顯影時(shí)間,就能獲得清晰的條帶。
以上就是關(guān)于小分子量蛋白WB實(shí)驗(yàn)的一些經(jīng)驗(yàn)建議,希望對(duì)還被小分子量蛋白WB折磨的朋友們有幫助。