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生物層干涉技術(shù)在中藥研究中的應(yīng)用

瀏覽次數(shù):1635 發(fā)布日期:2022-5-16  來(lái)源:賽多利斯
中藥的有效成分是其藥理作用的基礎(chǔ),運(yùn)用現(xiàn)代科學(xué)技術(shù)和手段研究、揭示中藥的多成分、多分子效應(yīng)機(jī)制,是當(dāng)今中藥學(xué)研究和發(fā)展的基本方向。通過(guò)研究中藥有效成分與生物大分子之間的關(guān)系,有助于中藥藥理作用機(jī)制的研究和藥物篩選,更有利于疾病的檢測(cè)預(yù)防和靶向治療。近年來(lái),基于生物層干涉技術(shù)(Biolayer Interferometry,BLI)的Octet®非標(biāo)記分子互作分析系統(tǒng)在中藥調(diào)節(jié)信號(hào)通路傳導(dǎo)、中藥靶向治療等方面的應(yīng)用有了快速的發(fā)展[1]。

中藥有效成分靶點(diǎn)互作研究 [2]
南京中醫(yī)藥大學(xué)

通過(guò)親和層析篩選與人參皂苷主要成分相互作用的蛋白,鑒定出14-3-3ζ蛋白為人參皂苷在腦組織中的潛在靶點(diǎn)。使用Octet®鑒定了20(S)- prototopanaxadiol (PPD,人參皂苷的代謝物)與14-3-3ζ 蛋白的直接相互作用(圖1)。14-3-3ζ蛋白-PPD復(fù)合物的共晶體結(jié)構(gòu)表明,14-3-3ζ蛋白的R56、R127和Y128氨基酸殘基參與與PPD互作,其中任何一個(gè)殘基突變都會(huì)導(dǎo)致PPD與14-3-3ζ蛋白的親和力顯著降低。該研究結(jié)果有助于更好地了解人參調(diào)節(jié)神經(jīng)元活性的作用機(jī)制,為基于人參皂苷結(jié)構(gòu)開(kāi)發(fā)與14-3-3ζ結(jié)合的小分子化合物奠定基礎(chǔ)。

圖1. 上半部分為中藥新靶點(diǎn)發(fā)現(xiàn)與鑒定的技術(shù)路線:BLI(Octet®)主要用于鑒定靶點(diǎn)(14-3-3 ζ蛋白)與人參皂苷的結(jié)合;下半部分表格為靶點(diǎn)突變體與人參皂苷的親和力測(cè)定。

用靶點(diǎn)垂釣有效成分[3]
西南醫(yī)科大學(xué)

BLI生物層干涉技術(shù)與高分辨質(zhì)譜聯(lián)合使用,并以Aβ作為誘餌來(lái)垂釣中藥開(kāi)心散(由遠(yuǎn)志、人參、茯苓和石菖蒲這4味中藥組成)中可以與Aβ相互結(jié)合的潛在小分子抑制劑。


1.將Aβ結(jié)合在Octet®傳感器上,然后將開(kāi)心散提取液與傳感器上的Aβ進(jìn)行結(jié)合并解離;
2.將收集到的解離液應(yīng)用高分辨質(zhì)譜進(jìn)行分析并鑒定,發(fā)現(xiàn)去氫土莫酸(DTA)、豬苓酸C(PPAC)和土莫酸(TA)三個(gè)化合物與Aβ有著最強(qiáng)的結(jié)合力;
3.通過(guò)色譜分離制備出這三個(gè)化合物后,然后在AD的細(xì)胞和線蟲模型上對(duì)這些化合物的抑制Aβ纖維形成的活性進(jìn)行了評(píng)價(jià);
4.研究發(fā)現(xiàn),這些化合物在體內(nèi)外均有很好的抑制Aβ纖維形成的活性(圖2):

圖2. 純化的TA與Aβ的親和力檢測(cè)

天然產(chǎn)物構(gòu)效關(guān)系研究[4]
中國(guó)藥科大學(xué)

CDC37是一種新的腫瘤治療靶點(diǎn),天然產(chǎn)物雷公藤紅素(celastrol)能夠很好的抑制該靶點(diǎn)活性。現(xiàn)在從celastrol的基本結(jié)構(gòu)(三萜)出發(fā),合成了一系列化合物,用Octet®測(cè)定了所有化合物與藥物靶點(diǎn)CDC37相互作用。

1#化合物替換了A環(huán)的酮基,11#化合物改變了A環(huán)的羥基極性,BLI親和力測(cè)試發(fā)現(xiàn),1#的親和力為90 μM,而11#化合物則無(wú)法與蛋白結(jié)合。說(shuō)明A環(huán)的羥基極性對(duì)保持其活性是非常重要的(圖3)。
 
圖3. 左邊為Octet® Red 96測(cè)定的Celastrol衍生物與CDC37的親和力,右邊為根據(jù)BLI結(jié)果得出的化合物構(gòu)效關(guān)系

天然化合物庫(kù)篩選和小分子競(jìng)爭(zhēng)實(shí)驗(yàn)[5]
澳門科技大學(xué)

基于分子對(duì)接并結(jié)合Octet®互作儀在天然化合物中篩選潛在SARS-CoV-2抑制劑。一些天然化合物抑制SARS-CoV-2誘導(dǎo)的Vero E6細(xì)胞的病變效應(yīng)和斑塊形成,使其喪失明顯的動(dòng)物毒性并具有SARS-CoV-2假病毒突變體(D614G、N501Y、N439K和Y453F)的抗病毒效果。通過(guò)Octet®還發(fā)現(xiàn),一些天然產(chǎn)物,比如EGCG、Bkc和Ibvc還與ACE2受體結(jié)合,體現(xiàn)與RBD和ACE2雙重結(jié)合。Octet®還可以進(jìn)行小分子之間的競(jìng)爭(zhēng)實(shí)驗(yàn),對(duì)小分子在蛋白靶點(diǎn)上的結(jié)合位點(diǎn)進(jìn)行分組(圖4)。

與RBD結(jié)合的一系列天然化合物

 
圖4. Octet®小分子競(jìng)爭(zhēng)實(shí)驗(yàn):綠色為相互不競(jìng)爭(zhēng),紅色為相互競(jìng)爭(zhēng)

BLI 技術(shù)在中藥開(kāi)發(fā)及研究領(lǐng)域的應(yīng)用優(yōu)勢(shì):

●節(jié)約樣品:只需要μg級(jí)的蛋白量和μM級(jí)的小分子量;
●避免損失:沒(méi)有復(fù)雜的流路系統(tǒng),也沒(méi)有泵和進(jìn)樣系統(tǒng),減少樣品的損失;
●經(jīng)濟(jì)高效:實(shí)驗(yàn)后還可將剩余樣品進(jìn)行回收,減少了前期純化樣品的工作量;
●快速便捷:耗時(shí)短,同時(shí)可以檢測(cè)多種樣品,實(shí)時(shí)監(jiān)控檢測(cè)結(jié)果,在前期中藥篩選階段,可以提高效率,節(jié)約寶貴時(shí)間。

BLI 技術(shù)被廣泛應(yīng)用于中藥研究中,成為中藥分子機(jī)制研究的主流技術(shù),為中醫(yī)藥走向世界提供有力的支持與保障。

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參考文獻(xiàn)

1.《生物膜干涉技術(shù)在中藥研究的應(yīng)用》. 中國(guó)商品學(xué)會(huì)第五屆全國(guó)中藥商品學(xué)術(shù)大會(huì)
2.Identification and confirmation of 14-3-3 ζ as a novel target of ginsenosides in brain tissues,Journal of Ginseng Research,2020,1226-8453
3.High-throughput screening for amyloid-β binding natural small-molecules based on the combinational use of biolayer interferometry and UHPLCLDAD-Q/TOF-MS/MS. Acta Pharmaceutica Sinica B. 2021.
4.Betulinic acid acetate, an antiproliferative natural product, suppresses client proteins of heat shock protein pathways through a CDC37-binding mechanism。RSC Adv., 2016, 6, 42537
5.Identification of natural compounds as SARS-CoV-2 entry inhibitors by molecular docking-based virtual screening with bio-layer interferometry. Pharmacological Research 172 (2021) 105820
來(lái)源:德國(guó)賽多利斯集團(tuán)
聯(lián)系電話:實(shí)驗(yàn)室產(chǎn)品與服務(wù)事業(yè)部:400 920 9889 / 生物工藝解決方案事業(yè)部:400 680 1870
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