PCR簡介
聚合酶鏈反應(polymerase chain reaction,PCR)是利用一段DNA為模板,在DNA聚合酶和核苷酸底物共同參與下,將該段DNA擴增至足夠數(shù)量,以便進行結(jié)構(gòu)和功能分析的一種反應。
PCR擴增原理
核酸降解是DNA/RNA分子中的堿基和戊糖間的氮糖苷鍵,或磷酸二酯鍵在物理因素、化學因素和生物因素等作用下發(fā)生水解,使DNA/RNA鏈發(fā)生斷裂。
▲ 圖一:PCR原理反應示意圖
▲ 圖二:PCR反應過程中溫度變化圖
實時熒光定量PCR原理
通過熒光染料或熒光標記的特異性探針,對PCR產(chǎn)物進行標記跟蹤,實時監(jiān)控反應過程,結(jié)合相應軟件可以對結(jié)果進行分析,通過標準曲線對未知模板進行定量分析,計算待測樣本的初始模板濃度。
▶ 初始DNA濃度越高,熒光達到某一值(閾值)時所需要的循環(huán)數(shù)越少(Cq值)。
▶ Log濃度與循環(huán)數(shù)成線性關(guān)系,根據(jù)樣品擴增到閾值的循環(huán)數(shù)與已知起始拷貝數(shù)的標準品作出的標準曲線對比就可以計算出該樣品的起始拷貝數(shù)。
影響PCR擴增的因素
▶ 模板間的交叉污染。
▶ PCR試劑的污染。
▶ PCR產(chǎn)物的污染。
防止污染的預防操作
❶ 永遠要設置NTC(No Template Control)對照,一個不含有模板DNA但含有PCR體系中所有其他成分的對照。如果不能在污染的第一時間發(fā)現(xiàn),會導致后續(xù)一系列的數(shù)據(jù)無法使用。
❷ 準備PCR體系的移液器要專用,千萬不能用吸取過PCR產(chǎn)物的移液器去準備PCR體系。
❸ 打開離心管前先離心,開管動作要輕,以防管內(nèi)液體濺出。
❹ 最好在加完其他反應成分再加入模板。
❺ 實驗結(jié)束后及時清理臺面。
出現(xiàn)污染后的解決辦法
❶ 更換試劑:更換新的試劑和水,用確保無污染的移液器分裝備用。
❷ 清潔所有可能的污染源:實驗臺面,離心機,門把手等。
❸ 實驗過程更加小心,采用前面提到的各種防止污染的方法。
CieloTM實時熒光定量PCR系統(tǒng)
Harness of the power of qPCR
☑ 數(shù)據(jù)可靠性:連續(xù)1000次實驗后,結(jié)果高度一致。
☑ 應用靈活性:提供多種qPCR應用分析。
☑ 流程智能化:中英文用戶界面,觸控操作,可多機聯(lián)用。
☑ 在線便捷性:主機可獨立運行qPCR程序,數(shù)據(jù)可USB、Wi-Fi等網(wǎng)絡傳輸。