Octet®非標(biāo)記分子互作技術(shù)應(yīng)用:國內(nèi)新發(fā)表高水平文章解析
瀏覽次數(shù):1649 發(fā)布日期:2022-4-11
來源:賽多利斯
隨著國內(nèi)科研水平的提高以及先進技術(shù)的使用,國內(nèi)發(fā)表的諸如CNS高水平文章也越來越多,基于生物層干涉(BLI)技術(shù)的Octet®分子互作由于具有簡單、快速、結(jié)果準(zhǔn)確的優(yōu)點,且具有廣泛的應(yīng)用方向。
僅2022年第一季度,Octet®國內(nèi)CNS文章就達到了5篇!涉及各種高通量、粗樣品的動力學(xué)和競爭實驗,也和我們身邊新冠疫苗和治療手段息息相關(guān)。今天,陳老濕就來介紹一下這幾篇文章。
🔺科興滅活疫苗加強針可提升對奧密克戎感染的重癥保護[1]
從多名三劑新冠疫苗接種者的新冠特異性記憶B淋巴細胞中成功獲得323株全人源抗體,用Octet® RED384檢測發(fā)現(xiàn)這些抗體都與野生型的新冠病毒S蛋白高親和力結(jié)合,其中24株對奧密克戎等突變株均有比較強的抑制活性。這表明三劑疫苗免疫后,約7%的記憶B淋巴細胞攜有廣譜性中和抗體。從中選取了幾株活性最高的廣譜性抗體(比如編號347,265抗體),并對其與S蛋白的復(fù)合物進行了結(jié)構(gòu)解析,發(fā)現(xiàn)了奧密克戎的抗體逃逸表位G446S。
將帶His標(biāo)簽的S蛋白固化在NTA傳感器上,分別與347和265抗體結(jié)合,發(fā)現(xiàn)347和265結(jié)合不同的表位(Octet® RED384)。
🔺
可霧化吸入的廣譜抗新冠全人源納米雙抗藥/復(fù)旦大學(xué)[2]
復(fù)旦大學(xué)應(yīng)天雷組研發(fā)了一種治療新冠的廣譜雙特異性全人源納米抗體Bn03,該抗體由該課題組之前發(fā)現(xiàn)的兩個靶向病毒S蛋白的保守表位的納米抗體n3113v和n3130v重組而成,能夠高效中和包括奧密克戎在內(nèi)的各種流行變異株。同時,因分子量比較小可作為霧化吸入制劑,在新冠輕癥和重癥小鼠模型中顯現(xiàn)出很好的療效。論文還發(fā)現(xiàn)了一類隱藏在病毒刺突蛋白三聚體內(nèi)部的高度保守表位,對廣譜疫苗和藥物的研發(fā)具有啟示作用。
Bn03可以高親和力地結(jié)合目前已知多種新冠毒株
接種疫苗后血清RBM(受體結(jié)合結(jié)構(gòu)域)抗體和非RBM抗體測試:將RBD結(jié)合在NTA傳感器上,直接與血清結(jié)合的BLI信號Xt為所有RBD抗體,先結(jié)合ACE2再結(jié)合血清信號為Xm的是非RBM抗體,RBM抗體為Xt-Xm。發(fā)現(xiàn)非RBM抗體與奧密克戎的結(jié)合活性密切相關(guān)。
應(yīng)老師組是第一個發(fā)現(xiàn)新冠抗體的課題組,請點這里。
🔺西湖大學(xué)發(fā)現(xiàn)艱難梭菌毒素入侵人體的新受體[3]
艱難梭菌是一種厭氧的革蘭氏陽性細菌,會導(dǎo)致抗生素相關(guān)性腹瀉和偽膜性腸炎等疾病,其中一個分支會分泌TcdB2,TcdB4毒素。目前,這些毒素在小腸上皮的受體并不明確。西湖大學(xué)陶亮組用CRISPR/Cas9的基因敲除文庫篩選技術(shù)發(fā)現(xiàn)了組織因子途徑抑制因子(TFPI)是這些毒素的受體。并解析了TFPI/ TcdB4復(fù)合物結(jié)構(gòu)。用Octet®檢測了兩者之間的親和力,同時動力學(xué)實驗表明,TcdB4與FXa均可與TFPI的同一loop結(jié)合,相互之間是競爭關(guān)系。這與前人的研究以及結(jié)構(gòu)學(xué)是完全一致的。這項研究對于揭示和理解艱難梭菌感染的致病機制,并且為超毒力分支菌株引起的艱難梭菌的感染預(yù)防和治療新方法的開發(fā)提供了重要的理論依據(jù)。
用Octet® RED96e和Anti-human Fc傳感器固化Fc融合TFPI,與TcdB4結(jié)合的親和力(KD值)達到nM級別。
Octet®固定TFPI,先結(jié)合TcdB4后,F(xiàn)Xa的結(jié)合信號顯著下降(左圖)。反過來亦是如此(右圖)。即FXa與TcdB4相互阻斷。
另外兩篇文章,主要檢測奧密克戎S蛋白和人受體ACE2以及中和抗體的親和力,BLI數(shù)據(jù)質(zhì)量良好,與前面文章類似,就不做一一介紹了
[4][5]。
Octet®分子互作分析系統(tǒng)的優(yōu)勢在于:
- 非標(biāo)記Direct binding是趨勢,結(jié)果更準(zhǔn)確;
- 快速測定親和力,更加定量化地表征分子互作;
- 無洗滌步驟,可測弱親和力(解離快);
- 寫入了美國藥典,文章多,認(rèn)可度廣;
- 萬金油技術(shù),可以用與檢測DNA,小分子,蛋白質(zhì)等各種生物分子,比如這篇文章檢測的就是病毒顆粒樣品;
- 操作簡便,耗材及維護成本低。
作為成熟的分析方法,Octet®已協(xié)助包括新冠疫苗在內(nèi)的多種疫苗的研究和開發(fā),應(yīng)用于多個關(guān)鍵環(huán)節(jié),包括表位設(shè)計、識別及特征分析,病原體多樣性和分布,抗體親和力測定,宿主免疫反應(yīng)特征、多樣性和分布,核酸和分子病原體-宿主相互作用研究,以及治療藥物及臨床研究等。了解更多基于Octet®的疫苗研發(fā)策略,觀看講座:
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