摘要:由于難以獲得用于幼葉生產(chǎn)的菠菜種子的均勻發(fā)芽,因此研究了對(duì)從菠菜種子的多光譜圖像中提取的特征使用偏最小二乘判別分析(PLS-DA) 的可能性。目的是區(qū)分不同的種子大小,以及預(yù)測(cè)發(fā)芽能力和胚芽長(zhǎng)度。拍攝了包括小、中、大種子在內(nèi)的300顆種子的圖像,并檢查了種子的發(fā)芽能力和胚芽長(zhǎng)度。PLS-DA 載荷圖用于將多維圖像特征減少到幾個(gè)重要特征。 PLS-DA預(yù)測(cè)產(chǎn)生了一個(gè)獨(dú)立的測(cè)試集,不僅可以區(qū)分種子大小,還可以證明發(fā)芽能力和胚芽長(zhǎng)度如何根據(jù)種子大小而變化。結(jié)果表明,與較小的種子相比,較大的種子具有顯著更高的發(fā)芽潛力和胚芽長(zhǎng)度。投影方法的可變重要性表明近紅外 (NIR) 波長(zhǎng)區(qū)域?qū)Πl(fā)芽可預(yù)測(cè)性很重要。然而,當(dāng)僅使用 NIR 區(qū)域時(shí),PLS-DA 模型并沒(méi)有改善。
關(guān)鍵詞:PLS-DA;發(fā)芽能力;胚芽長(zhǎng)度;分類; VIS-NIR 成像;菠菜種子;種子大小
圖1.395nm(左)和 910 nm(右)的灰度圖像
在19個(gè)不同光譜帶的范圍內(nèi)捕獲了1280x960個(gè)像素的圖像。圖1顯示了在395nm(左)和910 nm(右)下捕獲的包含 25 個(gè)中等大小菠菜種子的圖像。只有圖像中的種子是感興趣的,因此執(zhí)行的第一步是分離種子從背景(濾紙),使用閾值進(jìn)行分割。下一步是使用基于灰度共生矩陣(GLCM)的灰度統(tǒng)計(jì)和Haralick紋理特征從每個(gè)圖像(每個(gè)波長(zhǎng)/波段一個(gè)圖像)中提取特征。
圖2.峰態(tài)、最大值、平均值、中值、最小值和標(biāo)準(zhǔn)偏差數(shù)據(jù)(左)和角度、對(duì)比度、相關(guān)性、熵和逆數(shù)據(jù)(右)的偏最小二乘判別分析載荷(PLS1 與 PLS2)圖
基于兩個(gè)PLS-DA加載圖,均值、最大值和最小值特征是重要的灰度特征(圖 2,左),而對(duì)比度特征是重要的紋理特征(圖 2,右)。因此,決定開(kāi)發(fā)關(guān)于均值、最大值、最小值和對(duì)比度特征的 PLS-DA模型。
圖3.未發(fā)芽(左)、發(fā)芽時(shí)胚芽長(zhǎng)度在3到10毫米之間(中)和發(fā)芽時(shí)胚芽長(zhǎng)度大于10毫米(右)菠菜種子的投影(VIP)得分圖的變量重要性
在本研究中,VIP圖(圖 3)清楚地表明,NIR 波長(zhǎng)區(qū)域?qū)τ陬A(yù)測(cè)“未發(fā)芽”和“發(fā)芽長(zhǎng)度大于10毫米”很重要。這與菠菜的單種子NIR研究一致,其中NIR區(qū)域?qū)τ诎l(fā)芽和未發(fā)芽種子的分類很重要,準(zhǔn)確度為 90-98% 。因此,開(kāi)發(fā)僅使用 NIR 波長(zhǎng)區(qū)域的 PLS-DA 模型并檢查模型性能的改進(jìn)是顯而易見(jiàn)的。然而,僅使用 NIR 波長(zhǎng)區(qū)域并沒(méi)有改進(jìn) PLS-DA 模型(數(shù)據(jù)未顯示)。