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SDS聚丙烯酰胺凝膠電泳的工作原理

瀏覽次數(shù):6970 發(fā)布日期:2022-4-8  來源:蘇州阿爾法生物官網(wǎng)
電泳是分離蛋白質(zhì)和其他物質(zhì)如核酸、嘌呤、嘧啶、一些有機化合物甚至無機離子的主要技術。目前的大部分電泳是將樣品分離到固定介質(zhì)中的流動相中。聚丙烯酰胺凝膠是主要介質(zhì)之一。它是一種多孔凝膠,其孔徑接近蛋白質(zhì)分子的大小,提高了蛋白質(zhì)的分辨率。此外,聚丙烯酰胺凝膠化學穩(wěn)定性好,重復性強,對pH和溫度變化穩(wěn)定,顏色觀察容易。SDS聚丙烯酰胺凝膠電泳(SDS-PAGE)在蛋白質(zhì)分子量測定、特異性蛋白質(zhì)檢測、菌種鑒定等方面具有操作簡單、重現(xiàn)性好等特點,因此廣為使用。


SDS-PAGE的工作原理是什么?
聚丙烯酰胺凝膠是由丙烯酰胺和交聯(lián)劑N,N'-亞-CH3雙丙烯酰胺在催化劑過硫酸銨(AP)和N,N,N',N'-四-CH3乙二胺(TEMED)的作用下組成。它是一種具有三維網(wǎng)絡結構的凝膠。PAGE可以根據(jù)蛋白質(zhì)分子的電荷和分子量不同而引起的遷移率不同,將蛋白質(zhì)分成若干條帶。SDS是一種陰離子表面活性劑,它可以在還原劑DTT存在下破壞蛋白質(zhì)的氫鍵和疏水鍵,并與蛋白質(zhì)分子按一定比例結合形成短棒狀復合物。相同的密度,與蛋白質(zhì)的分子量呈正相關,不同分子量的蛋白質(zhì)所形成的復合物的長度是不同的。SDS使帶負電荷的蛋白質(zhì)的數(shù)量遠遠超過其原始電荷,掩蓋了各種蛋白質(zhì)分子之間的天然電荷差異。因此,各種蛋白質(zhì)-SDS復合物在電泳過程中的遷移率不再受原有電荷和分子形狀的影響,而只取決于相對分子質(zhì)量。

聚丙烯酰胺凝膠


聚丙烯酰胺凝膠通常由上層的濃縮膠和下層的分離膠組成。上下凝膠的區(qū)別在于丙烯酰胺的濃度和 Tris-HCl 的 pH 值。在電泳過程中,向凝膠施加電場,帶負電的蛋白質(zhì)從負極遷移到正極。最常見的電泳緩沖液由 Tris 和甘氨酸組成。濃縮膠中的 pH 值為 6.8,只有少數(shù)甘氨酸分子解離。因此,經(jīng) SDS 處理的蛋白質(zhì)分子在上層甘氨酸分子和下層 Cl- 離子之間移動。這個過程將凝膠中的蛋白質(zhì)樣品壓縮成比最初加載的體積小得多的條帶。隨著電泳的進行,蛋白質(zhì)移動到分離凝膠(pH 8.8),甘氨酸分子在此解離,隨著運動速度增加而超過蛋白質(zhì)。所以,在分離凝膠中,每種蛋白質(zhì)的移動速度取決于其分子量。分子量小的蛋白質(zhì)可以較容易地通過凝膠中的孔,而分子量大的蛋白質(zhì)則更難通過。一段時間后,蛋白質(zhì)根據(jù)大小到達不同的距離,達到蛋白質(zhì)分離的目的。
 

圖 1. 聚丙烯酰胺凝膠電泳示意圖

 

如何通過 SDS-PAGE 確定蛋白質(zhì)的分子量?
SDS-PAGE是測定未知蛋白質(zhì)分子量的主要方法。同時對分子量已知的蛋白質(zhì)和未知樣品進行電泳。染色后,根據(jù)標準蛋白的相對遷移率和分子量的對數(shù),得到一條線,利用其相對遷移率確定未知樣品的分子量。在實驗室中,用一種與染料共價偶聯(lián)的標準分子量蛋白質(zhì)作為參考蛋白質(zhì),粗略地指示未知蛋白質(zhì)的大小。這種預染色的蛋白質(zhì)標記可以在電泳期間或轉(zhuǎn)移膜時直接觀察到。

如何讀取 SDS-PAGE 結果?
電泳后,肉眼無法直接觀察到蛋白質(zhì)分離,需要后續(xù)的染色技術?捡R斯亮藍染色和銀染是常規(guī)檢測和定量電泳分離蛋白質(zhì)的常用方法。經(jīng)過固定-染色-脫色等簡單處理后,可以清楚地觀察到蛋白質(zhì)的分布。隨著高靈敏度蛋白質(zhì)分析方法和蛋白質(zhì)鑒定技術的改進,熒光標記、同位素標記技術等新型染色方法的靈敏度大大提高,同時也兼容自動化蛋白質(zhì)組平臺凝膠切割技術。開發(fā)了較高靈敏度和自動化的染色技術。

如何儲存 SDS-PAGE 凝膠?
通常在每次實驗之前準備新鮮的 SDS-PAGE 凝膠。然而,凝膠也可以在 4°C 的清水中儲存約一周。如果凝膠染色后不能及時拍照,則需要將其放入水中,以防止凝膠干燥和收縮。建議盡快拍攝染色結果。如果凝膠長時間浸泡在水中,條帶會散開。

如何實現(xiàn)快速電泳?
探究電泳實驗過程你會發(fā)現(xiàn),其實凝膠電泳步驟中,配制 SDS-PAGE 凝膠是一個重要的環(huán)節(jié),同時也是花費時間較多的一步。那么有沒有什么辦法可以加速這一過程呢?其實,市場已經(jīng)在推出預制膠,這種SDS-PAGE 凝膠是已經(jīng)配制好的,無需經(jīng)過繁瑣的制膠流程,拆了包裝就可以直接使用的。上海天能 Precast Gel預制膠不僅僅使電泳實驗的時間縮短了30%,而且這種預制膠還采用了新型緩沖液配制技術,使電泳條帶清晰而均勻,有效避免了SDS水解或PH值不穩(wěn)定所造成的凝膠性能不穩(wěn)定,條帶不均勻等缺陷。
 

蘇州阿爾法生物所提供的天能系列SDS蛋白質(zhì)預制膠、梯度預制膠、電泳儀、電泳槽、核酸電泳預制膠、核酸電泳儀、電泳儀電源、電泳槽等實驗室設備。

來源:蘇州阿爾法生物實驗器材有限公司
聯(lián)系電話:0512-62956104
E-mail:jie_wu@bioalpha.cn

標簽: 蛋白電泳
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