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質(zhì)粒擴(kuò)增的操作步驟和抽提過程中的注意事項(xiàng)

瀏覽次數(shù):2006 發(fā)布日期:2022-3-31  來源:本站 僅供參考,謝絕轉(zhuǎn)載,否則責(zé)任自負(fù)

 一、擴(kuò)增流程
         收到產(chǎn)品后,請(qǐng)先根據(jù)產(chǎn)品管壁標(biāo)簽來判斷產(chǎn)品形式,并在擴(kuò)增前準(zhǔn)確查找該質(zhì)粒菌株的抗性、感受態(tài)和培養(yǎng)溫度。
        1、質(zhì)粒干粉(常溫運(yùn)輸,存于-20度,90天保質(zhì)期,請(qǐng)務(wù)必轉(zhuǎn)化挑單克隆培養(yǎng))
        ①收到質(zhì)粒干粉后請(qǐng)先5000rpm離心1min,再加入20μl ddH2O去離子水溶解質(zhì)粒;
        ②取1支100μl 感受態(tài)于冰上解凍10min,加入2μl質(zhì)粒,再冰浴30min后,42℃熱激60s,不要攪動(dòng),再冰浴2min;
(從第二步開始均要在超凈工作臺(tái)中無菌操作)
        ③加入900μl無抗的LB液體培養(yǎng)基,180rpm震蕩37℃培養(yǎng)45min;
        ④6000rpm離心5min,僅留100μl上清液重懸細(xì)菌沉淀,并涂布至目標(biāo)質(zhì)?剐缘腖B平板上;
(可使用本平臺(tái)的平板涂布專用玻璃珠進(jìn)行涂布,可以比傳統(tǒng)涂布方法獲得更多轉(zhuǎn)化子)
        ⑤將平板正向培養(yǎng)1h,再倒置37℃培養(yǎng)14h。如果要求是30度則培養(yǎng)20h;
(如果菌落過多,請(qǐng)將質(zhì)粒稀釋后再轉(zhuǎn)化。如果無菌落,請(qǐng)加入10μl質(zhì)粒離心全涂轉(zhuǎn)化)
        ⑥挑取單菌落至LB液體培養(yǎng)基中,加入對(duì)應(yīng)抗生素,220rpm震蕩培養(yǎng)14h,根據(jù)實(shí)驗(yàn)需要和質(zhì)粒提取試劑盒說明書提取質(zhì)粒。
        2、甘油菌種(冰袋運(yùn)輸,存于-80℃,保質(zhì)期30天,請(qǐng)務(wù)必劃線挑單克隆培養(yǎng))
四區(qū)劃線后挑單菌落培養(yǎng),酵母菌需要先液體復(fù)蘇再四區(qū)劃線,再挑單菌落液體培養(yǎng)。
        3、穿刺菌種(冰袋運(yùn)輸,存于4℃,保質(zhì)期7天)
穿刺接種,液體培養(yǎng)后四區(qū)劃線,再挑單菌落液體培養(yǎng)。
        4、菌落平板(冰袋運(yùn)輸,存于4℃,保質(zhì)期7天)
直接挑取單菌落至液體培養(yǎng)基中。
        5、液體質(zhì)粒(冰袋運(yùn)輸,存于-20℃,保質(zhì)期30天)
單獨(dú)提取的液體質(zhì)粒收到后可直接使用。
如需要大題好的質(zhì)粒,可以下單備注。

降低RNA殘留的方法

   RNA 的去除,首先是使用 RNase 消化。在溶液 I 中加入高濃度的 RNase A (100ug/ml),或者用含 25ug RNase A/ml TE 溶解抽提好的質(zhì)粒,都可以降低 RNA 殘留,但都不能徹底去除。幸運(yùn)的是,RNA 的殘留并不影響酶切等最常用的用途。如果想徹底去除 RNA 殘留,可以用試劑盒,或者使用對(duì) 4 個(gè)堿基都作用的 RNase。 

降低gDNA殘留的方法

   gDNA 的殘留問題,必須在抽提過程中解決,否則,就只能用膠回收方法處理了。gDNA 越大,越難于復(fù)性,也就越容易被去除;所以,一定要盡可能不打斷 gDNA。裂解體系越粘稠,gDNA 越容易被扯斷;操作手法越重,gDNA 也越容易被打斷。溫和操作,使用相對(duì)過剩的試劑,是降低 gDNA 殘留的最好方法。

降低蛋白質(zhì)殘留的方法

   蛋白質(zhì)的去除,主要是靠不溶解的 K-SDS-蛋白質(zhì)復(fù)合物的形成。雖然將中和后的體系置于 4C 一段時(shí)間,可以形成更多的該不溶復(fù)合物,從而使蛋白質(zhì)殘留更少,但實(shí)踐證明這樣做并不是必須的,除非是大量抽提。只要加入溶液 I 后的懸浮,加入溶液 II 后的裂解及加入溶液 III 后的中和是均勻徹底的,蛋白質(zhì)的殘留就應(yīng)該在可以滿足實(shí)驗(yàn)要求的水平;而只有溶液的用量足夠,甚至過剩,才能確保裂解和中和是徹底的。當(dāng)然,試劑盒等的使用,是可以更進(jìn)一步降低蛋白質(zhì)的殘留的。

降低質(zhì)粒Nick的方法

   細(xì)菌收獲時(shí)間,菌株的選擇,抽提操作的劇烈程度是影響 Nick 的三個(gè)主要因素。細(xì)菌收獲過早,質(zhì)粒還在復(fù)制過程中,Nick 的比例較高;過晚,細(xì)菌開始死亡,雜質(zhì)會(huì)比較多。如果使用胞內(nèi)酶含量很高的宿主菌,會(huì)出現(xiàn)較高比例的 Nick。加入溶液 II 及加入溶液 III 的混勻操作,也可以導(dǎo)致一些 Nick,但影響不會(huì)比前兩者大。

降低變性超螺旋的方法

   理論上,用堿裂解法抽提質(zhì)粒,變性超螺旋的出現(xiàn)是不可避免的。  之所以大家沒有非常在意,一是因?yàn)樗拇嬖谒坪鯇?duì)酶反應(yīng)沒有任何影響,二是因?yàn)樗暮坎⒉灰欢ǜ叩奖挥秒娪居^察到。抽提使用相對(duì)過剩的溶液,在加入溶液 II 后,體系能在 1 分鐘內(nèi)變澄清,再快速加入溶液 III,這樣基本上能將變性超螺旋的出現(xiàn)控制在電泳看不見的水平。 (變性超螺旋電泳時(shí)比正常超螺旋跑得快一點(diǎn)點(diǎn)。)

關(guān)于質(zhì)粒多聚體

   QIAGEN 提供了一個(gè)沒有進(jìn)一步解釋的觀察:從有些宿主菌中抽提質(zhì)粒 (pTZ19),電泳能發(fā)現(xiàn)很多條帶;但使用單酶切后,仍然變成一條帶,大小正好是線性單質(zhì)粒的大小。根據(jù)這一觀察,可以推理如下:那些大的條帶(質(zhì)粒多聚體)是由完整的單質(zhì)粒“粘”在一起形成的,而不是我的一條鏈與你的一條鏈復(fù)性在一起;第二,這種“粘”只是部分的,否則酶切會(huì)有問題;第三,這種“粘”是脆弱的,線性后的剛性足以打破它。如果是這樣,質(zhì)粒多聚體的出現(xiàn)與質(zhì)粒的結(jié)構(gòu)及序列有關(guān),可以不管它(也管不了),因?yàn)樗挥绊懨盖,或者說,即使質(zhì)粒多聚體切不動(dòng),也不會(huì)影響太大?傊龅竭@種情況,不要簡單地認(rèn)為有問題,而是應(yīng)該一步一步往下做,但一定要做完一步,檢測一次,看一看結(jié)果與預(yù)期的吻合程度。

提高得率的方法

   利用氯霉素抑制染色體的復(fù)制,而不抑制質(zhì)粒的復(fù)制這一特點(diǎn),在低拷貝質(zhì)粒(如pUC19)的培養(yǎng)過程中添加氯霉素可以大大提高得率。
來源:智立中特(武漢)生物科技有限公司
聯(lián)系電話:18907174295
E-mail:1730571639@qq.com

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