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PROTAC 技術(shù)實(shí)現(xiàn)靶向降解 BTK

瀏覽次數(shù):636 發(fā)布日期:2022-3-11  來源:MedChemExpress
         非霍奇金淋巴瘤(Non-Hodgkin’s lymphoma, NHL)是一種 B 細(xì)胞惡性血液腫瘤。目前,利用藥物(如 Ibrutinib)抑制 BTK [1] 激酶活性是治療 NHL 的重要方法。但是,由于抑制劑與 BTK 結(jié)合位點(diǎn)的突變,使得很多淋巴瘤病人對(duì) Ibrutinib 的治療方案產(chǎn)生耐受,這就對(duì)尋找新的治療方案提出了迫切要求。

PROTAC(Proteolysis-targeting chimera)是新興的利用化合物降解靶向蛋白的方法 [2]。PROTAC 技術(shù)利用細(xì)胞內(nèi)天然存在的蛋白降解途徑-泛素化蛋白酶體途徑(Ubiquitin proteasome pathway)來清除需要被降解的特異蛋白。細(xì)胞內(nèi)結(jié)構(gòu)或功能異常的蛋白通過一系列酶(泛素化酶 E1,E2,E3)的作用,被標(biāo)記上多泛素化,隨之被轉(zhuǎn)移到蛋白酶體里進(jìn)行降解 [3]。一個(gè) PROTAC 分子包括兩個(gè)關(guān)鍵的結(jié)構(gòu)域:與需要降解的靶蛋白特異結(jié)合的結(jié)構(gòu)域、與 E3 泛素化連接酶結(jié)合的結(jié)構(gòu)域,二者通過特定的連接子相連(如圖1)。PROTAC 分子通過上述兩個(gè)關(guān)鍵結(jié)構(gòu)域?qū)⑿枰到獾牡鞍着c E3 泛素化連接酶連接起來,從而實(shí)現(xiàn)靶蛋白的多泛素化和蛋白酶體降解。

圖1. PROTAC 技術(shù)示意圖

近期,有兩組科學(xué)家都利用 PROTAC 技術(shù)研制出了可以靶向降解 BTK 激酶的化合物,他們的研究成果分別發(fā)表在國際頂級(jí)期刊 PANS [4]和 Cell Research [5]。他們?cè)O(shè)計(jì)的靶向降解 BTK 的 PROTAC 分子結(jié)構(gòu)如圖 2 所示,該 PROTAC 由結(jié)合 BTK 的配體、連接子(linker)和結(jié)合 CRBN(cereblon,E3 連接酶的重要組分,介導(dǎo) E3與底物結(jié)合)的配體構(gòu)成。

圖2. PROTAC 靶向 BTK 分子示意圖

    Adelajda Zorba 團(tuán)隊(duì)[4]設(shè)計(jì)了擁有不同長(zhǎng)度的連接子的靶向降解 BTK 的PROTACs 分子,并用 WesternBlot 檢測(cè)了細(xì)胞水平 PROTACs 對(duì) BTK 的降解效率,結(jié)果發(fā)現(xiàn) PROTACs 分子在 1h 左右的時(shí)間即可開始對(duì) BTK 有明顯的降解作用,且 BTK 的降解作用對(duì) PROTACs 分子有明顯的劑量依賴作用(圖3)。

圖3. PROTACs分子降解BTK

此外,他們還研究了連接子的長(zhǎng)度對(duì)于 PROTACs 分子與靶蛋白及 E3 連接酶結(jié)合形成三元絡(luò)合物的效率關(guān)系,發(fā)現(xiàn)在一定范圍內(nèi),較長(zhǎng)的連接子對(duì)于三元絡(luò)合物的形成更有利(圖4)。 

圖4. 不同 linker 長(zhǎng)度對(duì) BTK-PROTAC-E3 三元絡(luò)合物形成的影響

Yonghui Sun 團(tuán)隊(duì)[5]設(shè)計(jì)的 BTK 特異的 PROTAC 分子不僅可以靶向降解野生型的 BTK 蛋白,同時(shí)也可以高效的降解對(duì) Ibrutinib 耐受的突變型 BTK 蛋白(圖5),可以為 ibrutinib 耐受的 NHL 病人提供新的治療思路。


圖5. PROTAC 在多種細(xì)胞系中降解 BTK [5]

   PROTAC 利用細(xì)胞自身的蛋白質(zhì)降解機(jī)制-泛素化蛋白酶體途徑來靶向降解特定的蛋白,除了上述兩組科學(xué)家發(fā)表的成果,目前還在諸多其他蛋白(如BET、ER、AR等)的降解中取得了進(jìn)展。此外,PROTAC 技術(shù)可以很好地解決很多不可成藥(undruggable)的靶點(diǎn)如轉(zhuǎn)錄因子等的靶向降解問題,在以后的靶向治療中將會(huì)發(fā)揮重要作用。

 

參考文獻(xiàn)

[1]  Davis, R. E. et al. Chronic Active B-cell-receptor Signalling in Diffuse Large B-cell Lymphoma. Nature 463, 88–92 (2010).

[2] Carmony KC, Kim KB.PROTAC-Induced Proteolytic Targeting

Methods MolBiol. 2012;832:627-38.

[3] RoetenMSF,et al. Positioning of proteasome inhibitors in therapy of solid malignancies.Cancer ChemotherPharmacol. 2018 Feb;81(2):227-243. 

[4]  Zorba A, et al.Delineating the role of cooperativity in the design of potent PROTACs for BTK.Proc Natl Acad Sci U S A. 2018Jul 31;115(31):E7285-E7292.

[5]  Sun Y, et al.PROTAC-induced BTK degradation as a novel therapy for mutated BTK C481S induced ibrutinib-resistant B-cell malignancies.

Cell Res. 2018Jul;28(7):779-781.

 

相關(guān)產(chǎn)品

 

E3 Ligase Ligand-Linker Conjugates 系列產(chǎn)品:

 

一種合成化合物,包含 E3 泛素連接酶配體與 PROTAC 連接物,可以將靶蛋白與泛素化機(jī)制結(jié)合起來。

 

Zanubrutinib:

一種有效的選擇性 Bruton's 酪氨酸激酶 (Btk) 抑制劑。Ibrutinib:選擇性,不可逆的 Btk 抑制劑,IC50 值為 0.5 nM。

 

來源:上海皓元生物醫(yī)藥科技有限公司
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