原創(chuàng) OLYMPUS生命科學(xué)
本文作者:Forest Hill
最近小編和奮戰(zhàn)在科研一線的老同學(xué)劉博士聊天時(shí),劉博表示最近很郁悶。自己原本前不久辛辛苦苦養(yǎng)了幾周的細(xì)胞,做了實(shí)驗(yàn)后獲得了能夠驗(yàn)證自己猜測(cè)的結(jié)果,本想再重復(fù)一次獲得一個(gè)更漂亮更具有說(shuō)服力的數(shù)據(jù),結(jié)果卻沒(méi)能重復(fù)出來(lái)......
實(shí)驗(yàn)的可重復(fù)性對(duì)于生物研究來(lái)說(shuō)確實(shí)是一個(gè)老生常談的話題。Nature雜志也曾對(duì)1576名科研人員進(jìn)行網(wǎng)絡(luò)調(diào)查,結(jié)果顯示,超過(guò)70%的科研人員無(wú)法重復(fù)他人的實(shí)驗(yàn)結(jié)果,超50%無(wú)法重復(fù)自己的實(shí)驗(yàn)結(jié)果
*1。
而生物研究結(jié)果的可重復(fù)性較之物理化學(xué)等學(xué)科難度更大。但是可重復(fù)性以及可重復(fù)性的證據(jù)一直以來(lái)都是實(shí)驗(yàn)結(jié)果可靠性的重要證明,尤其是最近科研工作者甚至是科技愛(ài)好者對(duì)實(shí)驗(yàn)結(jié)果的可靠性也越來(lái)越關(guān)注。
圖1 Nature曾對(duì)1576名科研工作者做的可重復(fù)性調(diào)查統(tǒng)計(jì)
而對(duì)于生物研究中需要培養(yǎng)細(xì)胞的研究,實(shí)驗(yàn)的可重復(fù)性通常更是一項(xiàng)挑戰(zhàn)。因?yàn)榧?xì)胞不同的數(shù)量、狀態(tài)等都會(huì)對(duì)精細(xì)的生物實(shí)驗(yàn)的結(jié)果造成影響。為了解決這一問(wèn)題,Nature雜志在同一篇文章中也提出了“更出色的實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)”以及“更優(yōu)化的統(tǒng)計(jì)”作為對(duì)策。然而,在落實(shí)該建議時(shí),如何獲取所需的定量數(shù)據(jù)讓研究人員感到疲憊不堪。
為解決這一問(wèn)題,我們研發(fā)出了CM20細(xì)胞培養(yǎng)監(jiān)控系統(tǒng),可以采集細(xì)胞培養(yǎng)的定量數(shù)據(jù),從而提高實(shí)驗(yàn)的可重復(fù)性,也減輕了研究人員采集數(shù)據(jù)的負(fù)擔(dān)。
傳統(tǒng)難題:
細(xì)胞培養(yǎng)階段難以獲得定量數(shù)據(jù)
在傳統(tǒng)的細(xì)胞培養(yǎng)流程中,每次細(xì)胞數(shù)量的獲取都需要操作人員進(jìn)行手動(dòng)計(jì)數(shù)。并且細(xì)胞培養(yǎng)質(zhì)量判斷和操作時(shí)間安排,比如細(xì)胞何時(shí)傳代、什么樣的狀態(tài)以及多少數(shù)量的細(xì)胞可以收獲然后用于下面的實(shí)驗(yàn)等,都由操作人員以主觀方式判斷,但由于判斷標(biāo)準(zhǔn)不同,便會(huì)造成不同操作人員之間的實(shí)驗(yàn)結(jié)果差異很大。此外,在采集細(xì)胞定量數(shù)據(jù)時(shí),需要取出一部分樣品,缺乏以無(wú)損且無(wú)污染的方式測(cè)量大量數(shù)據(jù)的實(shí)用工具。
圖2 傳統(tǒng)的細(xì)胞培養(yǎng)流程難以獲得定量數(shù)據(jù)且存在較大個(gè)體主觀差異性
我們的解決方案: 使用CM20細(xì)胞培養(yǎng)監(jiān)控系統(tǒng)采集定量數(shù)據(jù)
由于CM20細(xì)胞培養(yǎng)監(jiān)控系統(tǒng)無(wú)需將細(xì)胞樣品從培養(yǎng)箱中取出,即可實(shí)現(xiàn)自動(dòng)穩(wěn)定的觀察,因此,無(wú)需研究人員干預(yù)就能夠采集到定量數(shù)據(jù)。
CM20還可根據(jù)采集的圖像自動(dòng)測(cè)量細(xì)胞數(shù)量獲得細(xì)胞的生長(zhǎng)曲線,并計(jì)算作為細(xì)胞增殖能力指標(biāo)的倍增時(shí)間。
圖3 奧林巴斯CM20系統(tǒng)針對(duì)傳統(tǒng)細(xì)胞培養(yǎng)痛點(diǎn)的解決方案
圖4 使用CM20采集MSC(間充質(zhì)干細(xì)胞)圖像并進(jìn)行細(xì)胞計(jì)數(shù)
圖5 CM20可對(duì)六孔板中培養(yǎng)細(xì)胞的生長(zhǎng)狀況進(jìn)行監(jiān)測(cè)并同步獲得細(xì)胞生長(zhǎng)曲線等定量數(shù)據(jù)
應(yīng)用案例:
利用CM20證實(shí)HUVEC傳代后的細(xì)胞增長(zhǎng)率與分化誘導(dǎo)之間的關(guān)系,
且實(shí)驗(yàn)結(jié)果高度可重復(fù)
以下為成功利用CM20細(xì)胞傳代定量數(shù)據(jù)進(jìn)行質(zhì)量評(píng)估的示例。在人類臍靜脈內(nèi)皮細(xì)胞(HUVEC)傳代培養(yǎng)過(guò)程中,使用CM20采集到大量圖像,并分析細(xì)胞形態(tài)和倍增時(shí)間。
我們發(fā)現(xiàn),HUVEC傳代培養(yǎng)過(guò)程中的倍增時(shí)間與其血管生成潛力密切相關(guān)。
在本研究中,已經(jīng)證明HUVEC在第8次傳代后倍增時(shí)間最長(zhǎng),是增殖能力發(fā)生變化的地方,并具有較好的血管生成潛力。因?yàn)檎麄(gè)細(xì)胞培養(yǎng)是在CM20的監(jiān)測(cè)下進(jìn)行的,所以HUVEC傳代后的狀態(tài)數(shù)量都被以同一的標(biāo)準(zhǔn)采集并識(shí)別分析,因此具有高度可重復(fù)性。
(本結(jié)果使用CM20原型系統(tǒng)獲得*2 ,有關(guān)實(shí)驗(yàn)詳細(xì)信息,請(qǐng)參閱《科學(xué)報(bào)告》相關(guān)論文)
圖6(a)不同傳代次數(shù)后的細(xì)胞形態(tài):每次傳代記錄圖像數(shù)據(jù)(b)傳代次數(shù)與細(xì)胞增長(zhǎng)率之間的關(guān)系:其顯示了HUVEC第8次傳代時(shí)的增長(zhǎng)率發(fā)生明顯變化(c)HUVEC的血管生成潛力和傳代次數(shù):在P7處較成功的血管生成,在P12處顯示較差的血管生成
參考文獻(xiàn):
*1) Monya Baker,“1,500名科學(xué)家揭開(kāi)重現(xiàn)性序幕”,《自然》雜志533,452–454(2016年5月26日)
*2) Tatsuya Osaki,Tatsuto Kageyama,Yuka Shimazu,Dina Mysnikova,Shintaro Takahashi,Takimoto Shinichi和Junji Fukuda,“用于穩(wěn)定細(xì)胞培養(yǎng)的平板式epi浮雕相襯細(xì)胞監(jiān)控系統(tǒng)”,《自然科學(xué)報(bào)告》 ISSN 2045-2322(在線版)(2017年5月15日)