為什么使用多個熒光標記很重要?在活細胞顯微成像中使用多通道方法可以同步觀察多個細胞結構和過程,提供生理學方面更重要的結果,從而為測量數據增加相關信息。通過這種方法可以研究細胞與蛋白質相互作用、動態(tài)變化以及這些變化如何相互作用和影響。不過,使用單個熒光團的實驗很常見,而使用兩個或多個熒光探針對活細胞成像可能會很復雜,并且必須仔細考慮幾個要點才能成功。本文將介紹有關成功設置多色活細胞實驗的一些關鍵方面。
選擇合適的熒光團設置多色活細胞實驗時,首先要選擇合適的熒光團,這一點至關重要。熒光團必須與活體樣本相容,并具有光穩(wěn)定性,才能進行長期成像。熒光蛋白標記、活細胞染料、動態(tài)標記(如 Ca2+ 指示劑)及其他用于標記感興趣靶標的方法是達到這類目的的合適工具。但是,由于發(fā)射光譜寬,以多通道方式研究活細胞過程時可供選擇的熒光染料仍然相當有限。每使用一個額外的標簽,找到具有高特異性和高信號輸出的激發(fā)/探測模式就變得更加困難。將兩個或多個熒光團信號一起成像時,需要使用復雜的標記策略最大程度減少光譜重疊。
在生理條件下成像無論使用細胞培養(yǎng)物、類器官、球狀體還是較小的模式生物,都必須使用近生理條件來確保樣本保持活力。在延時實驗中,某些條件必須保持最佳狀態(tài),才能確保細胞不僅能夠存活,而且不會承受壓力,并保持真實的生理機能。通常情況下使用培養(yǎng)箱(37°C、二氧化碳、濕度,有時還包括在一段時間內具有高穩(wěn)定性的氧氣)確保持續(xù)提供近生理條件。此外,選擇一種低自發(fā)熒光、不會干擾信號且不影響成像的介質也大有好處。
視頻:RPE 細胞分裂的 12 小時共聚焦延時視頻,細胞穩(wěn)定表達 eGFP-tubulin(青色)和 iRFP-Histone H2B(品紅色)。由美國巴爾的摩約翰霍普金斯醫(yī)學院荷蘭實驗室 C. Gliech 提供。荷蘭實驗室致力于研究各種控制染色體精確分布的分子機制,以及有絲分裂錯誤在人體健康和疾病中起到的作用。
圖像采集注意事項寬場顯微成像通常是活細胞成像的首選,因為它能夠更快、更溫和地成像。最先進的寬場顯微成像使用 LED 光源和濾光片組。盡管有很多濾光片都可以用于各種不同的熒光團組合,但是為了獲得用多個熒光團標記的樣本的正確圖像,需要考慮多個因素。
大多數用于活細胞成像的熒光團都具有寬發(fā)射光譜。這一事實通常意味著各個探測通道之間會出現串擾現象,例如,您會在紅色探測通道中看到來自綠色通道的一些發(fā)射光。在活細胞成像實驗中使用多個標記時,熒光光譜重疊現象很常見,因此為了確?吹较胱R別的細節(jié),可以使用窄帶濾光片。但是,這種方法會導致靈敏度下降并影響結果,因為活細胞中的熒光團信號水平通常較低,尤其是對于靶標豐度稀疏的樣本或以內源性水平表達的樣本。使用更多激發(fā)光來抵消靈敏度下降通常不可行,因為這種方法對樣本的危害性會增加(即光毒性增加)。
在活細胞實驗中,高速采集通常至關重要,特別是在研究快速動態(tài)過程時,如囊泡 觀察。 使用濾光片會導致速度受限,因為在改變每種顏色的濾光片組時必須依次成像。按順序采集圖像比同時采集圖像需要更多時間,因此在采集過程中可能會錯過樣本的快速運動,因為從一個圖像到下一個圖像時每種顏色都有更長的時間間隔。 此外,當 兩種或多種顏色之間的直接比較 至關重要時,例如在 上述 囊泡 觀察 實驗中: 信號 甚至可能 在兩次 熒光團 采集之間已經移動, 從而加大數據解釋的難度。
改善活細胞成像的替代方案研究活細胞中多個探針之間的相互作用而獲得的大量信息可提供生理學方面更重要的結果,因此人們開發(fā)了多種方法來拆分復雜的混合發(fā)射光信號。
為了能夠使用多個標簽,以便從一個樣本中獲得更深入的認識,您可以使用光譜圖像信息線性拆分方法,它可以分析每個熒光團對總信號的貢獻。要進行線性光譜拆分,必須為所有可能的參考光譜混合方式計算未知光譜與參考光譜之間的最小差值 (1)。這種方法通常用于對多種顏色成像,即使它們重疊。但是在寬場顯微成像中,您仍可能遺漏關鍵信息,因為必須對樣本中每個熒光團依次成像,這會導致速度受限。
如果采用其他方法會怎樣?有一種方法可以快速拆分多種顏色,而不必擔心采集期間光譜重疊,也無需學習復雜的光譜拆分方法。
最近發(fā)表的一些文章介紹了一種基于相量的光譜拆分方法 (2, 3)。光譜相量分析可將每個像素的光譜成分轉換為二維圖中的一個位置。這樣就可以利用簡單的數學方法即時、可靠地分離不同染料的發(fā)射光。此外,它還可以僅基于光譜而不是強度來增加濾光——從而保留圖像的細微細節(jié),同時減少可能會影響線性光譜拆分的噪聲。由于實際上消除了串擾以及自發(fā)熒光等干擾因素,選擇合適的熒光探針組合不再是問題,因此以這種方式成像可以更輕松地設置多通道活細胞成像實驗。