為進(jìn)一步提高感染性疾病相關(guān)個(gè)體化醫(yī)學(xué)檢測,2017年12月1日,國家衛(wèi)計(jì)委發(fā)布了最新版的感染性疾病相關(guān)個(gè)體化醫(yī)學(xué)分子檢測技術(shù)指南。新版的感染性疾病個(gè)體化醫(yī)學(xué)分子檢測技術(shù)指南更側(cè)重在分子診斷層面,涉及到標(biāo)本的采集,運(yùn)輸,保存,實(shí)驗(yàn)室設(shè)計(jì),分子診斷方法介紹,試劑的選擇,設(shè)備的維護(hù)和校準(zhǔn),質(zhì)控品,結(jié)果報(bào)告,醫(yī)患溝通等全過程,給現(xiàn)今如火如荼的分子診斷檢測有一定的標(biāo)桿作用,是行業(yè)的重要參考,有諸多的更新點(diǎn)。
乙型肝炎病毒、丙型肝炎病毒、結(jié)核分枝桿菌和人類免疫缺陷病毒是目前個(gè)體化醫(yī)學(xué)檢測開展最廣泛的病原體,分子檢測主要包括病毒載量、耐藥檢測、基因型分型和相關(guān)人類基因多態(tài)性等。其中乙型肝炎病毒感染的分子診斷要點(diǎn)如下:
要點(diǎn)一:HBV DNA定量檢測
實(shí)時(shí)熒光定量PCR技術(shù)是目前HBV DNA載量檢測的主要方法,具有較高的靈敏度和較廣的線性范圍。核苷類似物治療患者:在治療12周時(shí)檢測HBV DNA水平以確定發(fā)生病毒性應(yīng)答,之后每12-24周監(jiān)測1次。
要點(diǎn)二:HBV基因突變與耐藥
⑴ 與拉米夫定耐藥相關(guān)的變異:
拉米夫定與HBV DNA多聚酶YMDD序列結(jié)合,起到抑制病毒復(fù)制、降低HBV DNA水平的作用。HBV對拉米夫定最常見的耐藥變異就是YMDD變異。病毒出現(xiàn)變異耐藥后,應(yīng)根據(jù)患者的個(gè)體情況改用其它抗病毒藥物治療,如干擾素及其它核苷類藥物。
⑵ 與阿德福韋酯耐藥相關(guān)的變異:
在長期接受阿德福韋酯治療的病例中發(fā)現(xiàn)的耐藥變異為N236T或A181V,但其發(fā)生率很低。所有拉米夫定耐藥株對阿德福韋酯均敏感,而阿德福韋酯耐藥株對拉米夫定也敏感。
(3) 與恩替卡韋耐藥相關(guān)的變異:
恩替卡韋可抑制拉米夫定耐藥病毒株的復(fù)制,但拉米夫定耐藥株對恩替卡韋敏感性低于野毒株,并且容易發(fā)生對恩替卡韋的耐藥。目前研究結(jié)果顯示,產(chǎn)生恩替卡韋耐藥性的先決條件是需要有拉米夫定耐藥變異。在拉米夫定耐藥變異株上,I169T、184A/G/I/S、S202G/I或M250V變異的出現(xiàn),可形成對恩替卡韋的耐藥性。
⑷ 與替比夫定耐藥相關(guān)的變異:
替比夫定的耐藥屏障低,在基線病毒水平高和治療24周后仍能檢測到病毒的患者中,病毒耐藥發(fā)生率高。
要點(diǎn)三:常用的檢測方法
✔序列分析(測序法)DNA序列分析是檢測基因突變最直接可信的方法,是所有其他檢測變異技術(shù)的基礎(chǔ)。
DNA序列分析(Sanger測序)測序原理非常科學(xué),過程縝密,結(jié)果真實(shí)可視,準(zhǔn)確率達(dá)99.99%,不需要建庫,屬于直接測序,直接讀取數(shù)據(jù),連續(xù)讀取目標(biāo)片段,而不是針對某個(gè)位點(diǎn),不需要推導(dǎo)結(jié)論,數(shù)據(jù)充分可信,是分子診斷領(lǐng)域的金標(biāo)準(zhǔn)。
✔實(shí)時(shí)熒光PCR技術(shù),能計(jì)算突變株比例,是檢測慢性乙肝患者拉米夫定耐藥的有效手段。
✔微陣列技術(shù),一種高通量的檢測新技術(shù),具有大通量、快速、靈敏的優(yōu)勢,但有一定的假陽性和假陰性率,不能檢測出新位點(diǎn)的變異。
✔其他如質(zhì)譜技術(shù),也可檢測目前我國臨床使用核苷酸藥物耐藥。
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乙肝病毒耐藥和分型檢測(Sanger測序法)