腫瘤研究最新發(fā)現(xiàn):通過尿液或者血液精準(zhǔn)檢測神經(jīng)膠質(zhì)瘤
瀏覽次數(shù):193 發(fā)布日期:2021-8-25
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神經(jīng)膠質(zhì)瘤簡稱膠質(zhì)瘤,也稱為膠質(zhì)細(xì)胞瘤,是最常見的原發(fā)性中樞神經(jīng)系統(tǒng)腫瘤,約占所有顱內(nèi)原發(fā)腫瘤的一半。根據(jù)世界衛(wèi)生組織(WHO)分類方案分為星形細(xì)胞瘤、少支膠質(zhì)瘤、室管膜瘤、松果體實(shí)質(zhì)腫瘤、胚胎性腫瘤、神經(jīng)母細(xì)胞瘤腫瘤等。神經(jīng)膠質(zhì)瘤預(yù)后差生存期短,且缺乏有效的治療方法,膠質(zhì)瘤診斷一直依賴于神經(jīng)影像學(xué)檢查。根據(jù)英國劍橋癌癥研究所的研究團(tuán)隊(duì)最新研究成果發(fā)現(xiàn):通過尿液或血液檢測就能夠檢測不同類型的神經(jīng)膠質(zhì)瘤,且檢測準(zhǔn)確率大幅提升!
該研究團(tuán)隊(duì)招募了35例膠質(zhì)瘤患者(30例高級(jí)別膠質(zhì)瘤,英文縮寫HGG;5例低級(jí)別膠質(zhì)瘤,英文縮寫LGG);此外,還召集了26名健康志愿者和27名患有其他腦部或中樞神經(jīng)系統(tǒng)疾。i脊髓病、腦動(dòng)脈瘤-破裂和未破裂、腦積水和帕金森。┑幕颊。在這項(xiàng)研究中,研究人員開發(fā)了兩種并行的方法來檢測體液樣本中的腫瘤 cfDNA。體液樣本采用兩種基于測序的方法進(jìn)行分析:PHP(患者特異性混合捕獲靶標(biāo))和SWG(淺層全基因組測序)。
第一種方法適用于先前已切除膠質(zhì)瘤并進(jìn)行活檢的患者,該團(tuán)隊(duì)設(shè)計(jì)了一種腫瘤引導(dǎo)的測序測試,能夠在患者尿液、腦脊液和血漿中 cfDNA 內(nèi)尋找發(fā)生突變片段。在腦膠質(zhì)瘤患者的腦脊液、血漿和尿液樣本中,通過PHP法檢測腫瘤源性cfDNA片段與非突變cfDNA片段的序列長短。在這三種生物液中,我們觀察到,與非突變型相比,突變型cfDNA的片段大小一致且顯著地向較短的方向轉(zhuǎn)變。
在腦脊液樣本中,突變cfDNA的平均大小為148bp,而非突變cfDNA的平均大小為169bp;在血漿樣本中,160 bp對(duì)169bp;在尿液樣本中,101bp對(duì)133bp((Wilcoxon, P <0.001 for HGG and P < 0.001 for LGG,所有三種體液的P<0.0001)。這種變化以前曾在其他癌癥類型的血液樣本中描述過,但之前沒有通過分析特異性突變衍生片段在神經(jīng)膠質(zhì)瘤或其他惡性腫瘤患者的尿液和腦脊液中直接觀察到。
緊接著,研究人員進(jìn)一步使用全基因組測序分析了35名膠質(zhì)瘤患者、27名非惡性腦疾病患者和26名健康人的尿液樣本中的cfDNA片段大小。與非惡性腦疾病患者(P=1.7×10^2)和健康人(P=5.2×10^9)的尿液相比,腦膠質(zhì)瘤患者尿液中的cfDNA片段明顯增多。然后利用這些突變產(chǎn)生“靶向板”,對(duì)腦脊液、血漿和尿液進(jìn)行高深度測序。通過整合數(shù)百個(gè)突變的信號(hào),我們?cè)诖蠖鄶?shù)腦脊液、血漿和尿液樣本中檢測到腫瘤衍生信號(hào)。
隨后,對(duì)該測序數(shù)據(jù)輸入到機(jī)器學(xué)習(xí)模型中,該模型可以區(qū)分膠質(zhì)瘤患者的腦脊液、血漿和尿液樣本。通過機(jī)器學(xué)習(xí)分析,我們確定并測試了10個(gè)大小特征,這些特征可用于將腦脊液、尿液和血液樣本分類為來自健康個(gè)體或神經(jīng)膠質(zhì)瘤患者。這表明了通過對(duì)患者的腦脊液、尿液和血液進(jìn)行全基因組測序分析可以真正實(shí)現(xiàn)非侵入性腫瘤檢測。
綜上所述,與其他疾病類型相比,檢測腦腫瘤,特別是神經(jīng)膠質(zhì)瘤(GBM)患者的循環(huán)無細(xì)胞腫瘤DNA(cftDNA)具有極大的挑戰(zhàn)性。雖然腦脊液(CSF)中cftDNA的分析提高了檢測率,但這種生物液體既難以收集,也會(huì)給患者帶來明顯的不適;因此,通過采集腦脊液進(jìn)行cftDNA檢測明顯不合適。雖然在血液或尿液中膠質(zhì)瘤衍生的cftDNA信號(hào)僅存在微小水平,但相同的條件下血液或尿液形式的微創(chuàng)液體活檢方式更加適合。
這項(xiàng)腫瘤研究的最新研究發(fā)現(xiàn)表明:通過對(duì)尿液或血液進(jìn)行檢測就能夠準(zhǔn)確鑒別不同類型的神經(jīng)膠質(zhì)瘤,且檢測方法可以與目前的腫瘤影像診斷方式進(jìn)行結(jié)合,可以極大提升神經(jīng)膠質(zhì)瘤的檢測速度和準(zhǔn)確率!
參考文獻(xiàn)
1、Fragmentation patterns and personalized sequencing of cell-free DNA in urine and plasma of glioma patients,EMBO Molecular Medicine