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經(jīng)典脂質(zhì)組學(xué)介紹

瀏覽次數(shù):1930 發(fā)布日期:2021-8-12  來(lái)源:本站 僅供參考,謝絕轉(zhuǎn)載,否則責(zé)任自負(fù)
脂質(zhì)組學(xué)(lipidomics)是對(duì)生物體、組織或細(xì)胞中的脂質(zhì)以及與其相互作用的分子進(jìn)行全面系統(tǒng)的分析、鑒定,了解脂質(zhì)的結(jié)構(gòu)和功能,進(jìn)而揭示脂質(zhì)代謝與細(xì)胞、器官乃至機(jī)體的生理、病理過(guò)程之間的關(guān)系的—門(mén)學(xué)科。目前脂質(zhì)組學(xué)已經(jīng)被廣泛運(yùn)用于藥物研發(fā)、分子生理學(xué)、分子病理學(xué)、功能基因組學(xué)、營(yíng)養(yǎng)學(xué)以及環(huán)境與健康等重要領(lǐng)域。


技術(shù)優(yōu)勢(shì)

高分辨儀器平臺(tái):Q Exactive Focus(Thermo Fisher Scientific)

內(nèi)標(biāo):2個(gè)同位素內(nèi)標(biāo)

六大質(zhì)控體系:過(guò)程質(zhì)控、數(shù)據(jù)質(zhì)控

專業(yè)的數(shù)據(jù)分析:專業(yè)數(shù)據(jù)處理和分析軟件,PCA、OPLS-DA、T-test等分析

項(xiàng)目經(jīng)驗(yàn):平均項(xiàng)目可檢出900+脂質(zhì)

定性結(jié)果更準(zhǔn)確,適用性高:保留時(shí)間預(yù)測(cè)算法輔助定性

 

數(shù)據(jù)庫(kù)

基于LipidBlast構(gòu)建包含甘油磷脂、鞘脂、固醇脂、甘油脂、脂肪酸、糖脂等在內(nèi)的52類(lèi)脂質(zhì),22W+種脂質(zhì)。



技術(shù)參數(shù)

樣本要求

植物組織:200-500 mg/sample

動(dòng)物及臨床組織標(biāo)本:200 mg/sample

血清、血漿:200 µL/sample

微生物、細(xì)胞:1x107 cells/sample

 

生物學(xué)重復(fù)

樣本數(shù)量:植物和微生物n≥6,動(dòng)物樣本n≥10,臨床樣本n≥30,所有重復(fù)樣本獨(dú)立分析。

其他種類(lèi)的樣品在收集之前請(qǐng)聯(lián)系公司銷(xiāo)售工程師。

 

檢測(cè)平臺(tái)

高分辨儀器平臺(tái):

Q Exactive Focus(Thermo Fisher Scientific)

 

常規(guī)項(xiàng)目周期

實(shí)驗(yàn)檢測(cè):30個(gè)自然日,含基礎(chǔ)數(shù)據(jù)分析

 

應(yīng)用方向

1、樣本中脂質(zhì)物質(zhì)鑒定;

2、脂質(zhì)功能及代謝調(diào)控研究;

3、脂質(zhì)代謝途徑及網(wǎng)絡(luò)研究;

4、脂質(zhì)生物標(biāo)志物發(fā)掘。

 

案例分析

脂質(zhì)組學(xué)和轉(zhuǎn)錄組學(xué)研究棉蚜蟲(chóng)脂質(zhì)變化機(jī)理

棉岈蟲(chóng) (Aphis gossyp ii Glo ver)是種重要的農(nóng)業(yè)害蟲(chóng),是我國(guó)棉花主要害蟲(chóng)之。它通過(guò)寄生吸食汁液,能夠在早期生長(zhǎng)季節(jié)對(duì)棉花幼苗造成嚴(yán)重?fù)p害。據(jù)報(bào)道擬寄生物對(duì)岈蟲(chóng)的脂質(zhì)合成有影響,然而目前尚不清楚這些脂質(zhì)變化如何影響棉岈蟲(chóng)生理過(guò)程。本研究首次基于RNA-Seq與脂質(zhì)組學(xué)聯(lián)合分析方法,探討了擬寄生物對(duì)棉岈蟲(chóng)脂代謝及基因表達(dá)的影響。結(jié)果表明寄生導(dǎo)致脂質(zhì)代謝的顯著變化及甘油酯和甘油磷脂的組成變化。這些數(shù)據(jù)可作為研究寄生蟲(chóng)-昆蟲(chóng)相互作用的寶貴資源,并將進(jìn)一步表征脂質(zhì)合成途徑及其與三羧酸(TCA)循環(huán)和糖酵解的關(guān)系。

圖1寄生和非寄生螞蟲(chóng)脂質(zhì)代謝PCAxOPLS-DAx permutation分析
圖2 寄生誘因與脂質(zhì)代謝相關(guān)基因的表達(dá)

 

參考文獻(xiàn)

Gao X K, Zhang S, Luo J Y, et al. Lipidomics and RNA-Seq Study of Lipid Regulation in Aphis gossypii parasitized by Lysiphlebia japonica[J]. Scientific Reports, 2017, 7(1): 1364.

 

百趣協(xié)助客戶發(fā)表文獻(xiàn)

 

中國(guó)科學(xué)技術(shù)大學(xué):Li Q, Wang Y, Wu S, et al. CircACC1 Regulates Assembly and Activation of AMPK Complex under Metabolic Stress.

Cell Metabolism 2019,30, 1-17.

IF= 22.415

課題方向:Circacc1 調(diào)節(jié)代謝應(yīng)激下 AMPK 復(fù)合物的組裝和激活

 

復(fù)旦大學(xué)附屬腫瘤醫(yī)院:Yue Gong, Peng Ji, Yun-Song Yang, et al. Metabolic-Pathway-Based Subtyping of Triple Negative Breast Cancer Reveals Potential Therapeutic Targets.

Cell Metabolism 2020 November 06.

IF=21.567

課題方向: 基于代謝途徑的三陰性乳腺癌亞型揭示了潛在的治療靶點(diǎn)

來(lái)源:上海百趣生物醫(yī)學(xué)科技有限公司
聯(lián)系電話:021-61531195
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