高分辨儀器平臺(tái):Q Exactive Focus(Thermo Fisher Scientific)
內(nèi)標(biāo):2個(gè)同位素內(nèi)標(biāo)
六大質(zhì)控體系:過(guò)程質(zhì)控、數(shù)據(jù)質(zhì)控
專業(yè)的數(shù)據(jù)分析:專業(yè)數(shù)據(jù)處理和分析軟件,PCA、OPLS-DA、T-test等分析
項(xiàng)目經(jīng)驗(yàn):平均項(xiàng)目可檢出900+脂質(zhì)
定性結(jié)果更準(zhǔn)確,適用性高:保留時(shí)間預(yù)測(cè)算法輔助定性
數(shù)據(jù)庫(kù)
基于LipidBlast構(gòu)建包含甘油磷脂、鞘脂、固醇脂、甘油脂、脂肪酸、糖脂等在內(nèi)的52類(lèi)脂質(zhì),22W+種脂質(zhì)。
樣本要求
植物組織:200-500 mg/sample
動(dòng)物及臨床組織標(biāo)本:200 mg/sample
血清、血漿:200 µL/sample
微生物、細(xì)胞:1x107 cells/sample
生物學(xué)重復(fù)
樣本數(shù)量:植物和微生物n≥6,動(dòng)物樣本n≥10,臨床樣本n≥30,所有重復(fù)樣本獨(dú)立分析。
其他種類(lèi)的樣品在收集之前請(qǐng)聯(lián)系公司銷(xiāo)售工程師。
檢測(cè)平臺(tái)
高分辨儀器平臺(tái):
Q Exactive Focus(Thermo Fisher Scientific)
常規(guī)項(xiàng)目周期
實(shí)驗(yàn)檢測(cè):30個(gè)自然日,含基礎(chǔ)數(shù)據(jù)分析
應(yīng)用方向
1、樣本中脂質(zhì)物質(zhì)鑒定;
2、脂質(zhì)功能及代謝調(diào)控研究;
3、脂質(zhì)代謝途徑及網(wǎng)絡(luò)研究;
4、脂質(zhì)生物標(biāo)志物發(fā)掘。
案例分析
脂質(zhì)組學(xué)和轉(zhuǎn)錄組學(xué)研究棉蚜蟲(chóng)脂質(zhì)變化機(jī)理
棉岈蟲(chóng) (Aphis gossyp ii Glo ver)是種重要的農(nóng)業(yè)害蟲(chóng),是我國(guó)棉花主要害蟲(chóng)之。它通過(guò)寄生吸食汁液,能夠在早期生長(zhǎng)季節(jié)對(duì)棉花幼苗造成嚴(yán)重?fù)p害。據(jù)報(bào)道擬寄生物對(duì)岈蟲(chóng)的脂質(zhì)合成有影響,然而目前尚不清楚這些脂質(zhì)變化如何影響棉岈蟲(chóng)生理過(guò)程。本研究首次基于RNA-Seq與脂質(zhì)組學(xué)聯(lián)合分析方法,探討了擬寄生物對(duì)棉岈蟲(chóng)脂代謝及基因表達(dá)的影響。結(jié)果表明寄生導(dǎo)致脂質(zhì)代謝的顯著變化及甘油酯和甘油磷脂的組成變化。這些數(shù)據(jù)可作為研究寄生蟲(chóng)-昆蟲(chóng)相互作用的寶貴資源,并將進(jìn)一步表征脂質(zhì)合成途徑及其與三羧酸(TCA)循環(huán)和糖酵解的關(guān)系。
參考文獻(xiàn)
Gao X K, Zhang S, Luo J Y, et al. Lipidomics and RNA-Seq Study of Lipid Regulation in Aphis gossypii parasitized by Lysiphlebia japonica[J]. Scientific Reports, 2017, 7(1): 1364.
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中國(guó)科學(xué)技術(shù)大學(xué):Li Q, Wang Y, Wu S, et al. CircACC1 Regulates Assembly and Activation of AMPK Complex under Metabolic Stress.
Cell Metabolism 2019,30, 1-17.
課題方向:Circacc1 調(diào)節(jié)代謝應(yīng)激下 AMPK 復(fù)合物的組裝和激活
復(fù)旦大學(xué)附屬腫瘤醫(yī)院:Yue Gong, Peng Ji, Yun-Song Yang, et al. Metabolic-Pathway-Based Subtyping of Triple Negative Breast Cancer Reveals Potential Therapeutic Targets.
Cell Metabolism 2020 November 06.
課題方向: 基于代謝途徑的三陰性乳腺癌亞型揭示了潛在的治療靶點(diǎn)