植物組織類樣本DNA提取完整解決方案
植物DNA的提取和純化是植物基因工程研究的基礎(chǔ)操作。實施分子標(biāo)記、基因圖譜、基因指紋圖譜、基因文庫構(gòu)建、遺傳多態(tài)性分析、DNA重組、RAPD(隨機(jī)引物多態(tài)性DNA)、RFLP(限制性酶多態(tài)性)、基因分離及遺傳轉(zhuǎn)化和鑒定等都以提取DNA為前提。
目前,對從植物組織中提取DNA方法的要求是:簡便、有效、快捷以及經(jīng)濟(jì)。與動物組織相比,植物組織含有較多的多糖和其他次生代謝產(chǎn)物(酚、酯、萜、色素等),這給高質(zhì)量的DNA提取帶來較多的困難。尤其是多糖成分是影響DNA純度最常見的問題。如何做到既去除這些污染物又能相對保持高的產(chǎn)量,并且能簡捷有效地提純,一直是植物生物技術(shù)研究者探索的問題。
01普通的植物
對于普通的植物(低酚、低酯、低糖等)如:水稻、白菜、莧菜、南瓜、黃瓜、西紅柿、上海青、菠菜、筍瓜、冬瓜、蓮藕、山藥、竹筍等;我們可以選用普通植物DNA提取試劑盒(磁珠法)試劑(貨號:K318)。
02多糖、多酚類植物
對于多糖、多酚類植物(香蕉、西瓜、蘋果、梨等果肉,紅薯、馬鈴薯等塊莖,棉花、月季、枇杷、益母草、夏枯草等人參、曼陀羅、向天果、射干、桔梗、滿山紅、金雞納霜等藥用植物)可以選用多酚植物DNA提取試劑盒(磁珠法)試劑(貨號K319),針對類似的植物我們經(jīng)過長期的優(yōu)化,可以得到較好的實驗結(jié)果。
---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------以葉片為例,葉片需先剪碎成小塊,以便放入1.5ml離心管。最佳樣本的長度應(yīng)在1cm 以下。重量不超過250mg,推薦使用50mg,如果是植物種子粉末可以使用10mg-20mg粉末即可。
樣本數(shù)量較多的情況下:可以使用HF Extract組織研磨儀 可以同時處理2-192個樣品(需配不同適配器)。將植物的組織切碎后放入2ml的研磨管中,加入鋼珠或二氧化鋯珠8-16顆(根據(jù)試劑情況靈活選擇),按照如下方案編輯研磨程序:
對于莖部纖維化比較嚴(yán)重的組織或者根部樣本,要配合液氮處理(將植物組織用剪刀剪切<0.5cm,放入研磨管中),使用配套的冷凍研磨套件(如下圖),將研磨罐中灌入液氮冷凍植物樣品,等液氮揮發(fā)后,快速擰好研磨罐放入研磨儀。執(zhí)行程序:
提取過程:
96孔預(yù)分裝板
3.加入預(yù)分裝96孔板中的第1、7列,然后放入核酸提取儀中(如下圖),插好磁棒套。點擊運行程序。 4.20min后,完成DNA的提取。轉(zhuǎn)移5、11列中的DNA 至1.5ml離心管中,使用超微量分光度計(Mcro-Drop )檢測核酸濃度:5.記錄檢測結(jié)果,進(jìn)入下步擴(kuò)增或?qū)NA保存至-20℃。