通過Discovery Studio軟件預測了人/鼠PD-1交叉反應抗體的結合模式,并輔助以實驗驗證,從而精細解釋了具有人/鼠交叉反應抗體的交叉反應性機制,為后續(xù)PD-1抗體研發(fā)做出指導。
程序性死亡受體1(PD-1)是一種重要的免疫抑制受體分子,以PD-1為靶點的免疫調節(jié)在抗腫瘤、抗感染、抗自身免疫性疾病及器官移植存活等方面均有重要的意義。PD-1抗體是當前備受矚目,廣為關注的一類腫瘤療法?紤]到PD-1抗體在治療各種癌癥中的重要性和廣泛應用,文章作者希望開發(fā)同人/鼠PD-1有交叉反應的抗體以加速PD-1抗體的臨床前研究。目前批準用于臨床或正在研發(fā)中的PD-1抗體都只靶向人hPD-1,而并不顯示與鼠mPD-1有交叉反應。因此,本文開發(fā)并首次報道了一種具有人/鼠PD-1交叉反應的功能性抗體,并將該抗體的表位與僅同hPD-1結合的抗體表位進行了比較。
文章作者首先用hPD-1和mPD-1免疫大鼠,通過篩選大量的大鼠雜交瘤克隆發(fā)現了既能靶向hPD-1又能靶向mPD-1的抗體R9和只靶向hPD-1的抗體R11。為了快速識別兩個抗體的表位,本研究采用了丙氨酸掃描,并基于ELISA和表面等離子共振技術。同時結合分子模擬的方法,采用Discovery Studio(DS)中MODELER程序構建出了R11和R9抗體結構模型,并在此基礎上使用DS_ZDOCK/RDOCK蛋白-蛋白對接/優(yōu)化程序,將這兩個抗體與hPD-1進行了對接,預測了兩種抗體不同的結合模式,研究了他們的結合表位,從而精細解釋了具有人/鼠交叉反應抗體的交叉反應性機制。